آنالیز تفاوت ژنتیکی ژن های مرتبط با پاسخ ایمنی بین گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد با استفاده از داده های RNA-Seq
Publish place: Research on Animal Production، Vol: 12، Issue: 31
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 316
This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_RAP-12-31_015
تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400
Abstract:
جهش در طول توالی ژنها سبب بروز تغییرات نوکلئوتیدی و درنتیجه ایجاد عملکرد جدید در ژنها میشود. هدف از مطالعه حاضر، ارزیابی تنوع ژنتیکی و تحلیل بیان متفاوت ژن های مرتبط با سیستم ایمنی در بین دو جمعیت گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد بود. در این مطالعه از نتایج مربوط به آنالیز بیان افتراقی در بین جمعیت گاوهای نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد با استفاده از داده های RNA-Seq جهت تجزیه ژنتیکی و ترسیم درخت فیلوژنتیکی استفاده شد. توالیهای نوکلئوتیدی با روش ClustalW توسط نرم افزار MegaAlign همردیف سازی شدند و درخت فیلوژنتیکی و ماتریس تفاوت و تشابه توالیها ترسیم شد. بر اساس نتایج این تحقیق، میانگین اختلاف نوکلئوتیدها و تعداد کل جهشها برای ژن های مورد مطالعه در بین جمعیت های گاو نژاد خالص و آمیخته سیستانی و مونتبیلیارد بهترتیب در محدودهی (۲۵۹۸/۶۶-۱۸۶) و (۳۸۹۸-۷۴) قرار داشت. همچنین، نواحی حفاظت شده بخش اندکی از توالی ژنهای مورد مطالعه را تشکیل دادند که این امر نشان دهنده چند شکلی بالای این ژنها و همچنین مستعد بودن به تغییرات نوکلئوتیدی و جهش میباشد. نتایج حاصل از درخت فیلوژنی توالی نوکلئوتیدی ژنهای مورد مطالعه نشان داد که تنوع ژنتیکی و واگرایی برای ژنهای مورد مطالعه در بین جمعیتهای گاو نژاد خالص، آمیخته سیستانی و مونت بیلیارد و ایندیکوس وجود دارد. میزان عددی نسبت جایگزینی dN/dS برای ژنهای مورد مطالعه نشان دهنده انتخاب مثبت این ژنها بود.
Keywords:
Evolution , Genetic diversity , Mutations , Phylogenetic , Sistani cows , تکامل , تنوع ژنتیکی , جهش , فیلوژنتیک , گاو سیستانی
Authors
بتول اصغری اسفدن
University of Zabol
غلامرضا داشاب
University of Zabol
محمد حسین بنابازی
Department of Biotechnology, Animal Science Research Institute of IRAN (ASIR)
محمد رکوعی
University of Zabol
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :