شناسایی جهش فقدان عملکرد p.R۱۲X در جایگاه ژنی SLC۳۷A۲ در گاوهای مونبلیارد و هلشتاین

Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 222

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_RAP-11-29_015

تاریخ نمایه سازی: 4 مهر 1400

Abstract:

    هدف از پژوهش حاضر شناسایی جهش فقدان عملکرد p.R۱۲X موثر بر مشکلات تولید مثلی و سقط جنین در ژن SLC۳۷A۲ با روش­ های PCR-SSCP و توالی­ یابی در گاوهای هلشتاین و مونبلیارد بوده است. تعداد ۲۵۰ نمونه خون (۱۵۰ نمونه هلشتاین و ۱۰۰ نمونه مونبلیارد) تهیه و استخراج DNA با کیت انجام شد. یک جفت آغازگر اختصاصی با نرم­ افزارOligo۷ طراحی شد  که قطعه­ای با طول ۲۰۸ جفت باز از اگزون ۲ ژن SLC۳۷A۲ حاوی جهش p.R۱۲X  را تکثیر نماید. تعیین ژنوتیپ نمونه ­ها با روش SSCP  انجام و فراوانی­های ژنی و ژنوتیپی و شاخصه­ های ژنتیک جمعیت با نرم­ افزارPOPGEN محاسبه شدند. در جایگاه SLC۳۷A۲ دو ژنوتیپ AA و AB به ­ترتیب با فراوانی ­های ۷/۹۸ و ۳/۱ و ۸۶ و ۱۴ درصد به ترتیب در دو نژاد هلشتاین و مونبلیارد مشاهده شدند. همچنین فراوانی­ های آللی ژن SLC۳۷A۲ در دو جمعیت هلشتاین و مونبلیارد برای آلل­ های  A و B به ­ترتیب برابر با ۳/۹۹ و ۷/۰ و ۹۳/۰ و ۷/۰ برآورد شدند. تست دقیق فیشر و تست کای-اسکوئر نشان داد که اختلاف آماری معنی­ داری از نظر فراوانی­ های آللی و ژنوتیپی بین دو جمعیت هلشتاین و مونبلیارد وجود دارد (۰۵/۰p <). پس از تعیین ژنوتیپ، از هر ژنوتیپ دو نمونه به ­طور دو طرفه توالی­ یابی شدند و بررسی­ های بیوانفورماتیکی توالی­ های حاصل با نرم ­افزار BioEdit انجام  شد. نتایج نشان داد که در ژنوتیپ AB ژن SLC۳۷A۲ در گاوهای هلشتاین و مونبلیارد جهش فقدان عملکرد (p.R۱۲X) وجود دارد. با توجه به نقش جهش p.R۱۲X در نقایص تولید مثلی و سقط جنین در گاو مونبلیارد می­توان از نتایج این پژوهش مستقیما در برنامه ­های اصلاح نژادی جهت شناسایی دام ­های حامل و حذف آن­ها در گله­ های تجاری و روستایی استفاده نمود.

Authors

زهره سادات حسینی

epartment of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran

ایوب فرهادی

epartment of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran

محسن قلی زاده

Department f Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran

قدرت رحیمی میانجی

Department of Animal Sciences, Sari Agricultural Sciences and Ntural Resources University, Sari, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Behmaram, R., P. Akbari, M.D. Shakouri and M. Kazemi. ۲۰۱۸. ...
  • De Vries, A., C. Steenholdt and Risco. ۲۰۰۵. Pregnancy rates ...
  • Fritz, S., A. Capitan, A. Djari, S.C. Rodriguez, A. Barbat, ...
  • Hansen, L.B. ۲۰۰۰. Consequences of selection for milk yield from ...
  • He, L., K. Vasiliou and D.W. Nebert. ۲۰۰۹. Analysis and ...
  • Hoseinpour Kol-Mahaleh, M., A. Farhadi, G. Rahimi Mianji and M. ...
  • Ishida, N. and M. Kawakita. ۲۰۰۴. Molecular physiology and pathology ...
  • Kanae, Y., D. Endoh, H. Nagahata and M. Hayashi. ۲۰۰۵. ...
  • Lucy, M.C. ۲۰۰۱. Reproductive loss in high-producing dairy cattle: where ...
  • Nagahata, H., H. Oota, A. Nitanai, S. Oikawa, H. Higuchi, ...
  • Pan, C.J., S.Y. Chen, H.S. Jun, S.R. Lin, B.C. Mansfield ...
  • Plaizier, J.C.B., K.D. Lissemore, D. Kelton and G.J. King. ۱۹۹۸. ...
  • Reinartz, S and O. Distl. ۲۰۱۶. Validation of deleterious mutations ...
  • Sewalem, A., G.J. Kistemaker and F. Miglior. ۲۰۱۰. Relationship between ...
  • Thomsen, B., P. Horn, F. Panitz, E. Bendixen, A.H. Petersen, ...
  • VanRaden, P.M., A.H. Sanders, M.E. Tooker, R.H. Miller, H.D. Norman, ...
  • Wall, E., S. Brotherstone, J.A. Woolliams, G. Banosa and M.P. ...
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/۵۰۶۶۸۷ ...
  • Behmaram, R., P. Akbari, M.D. Shakouri and M. Kazemi. ۲۰۱۸. ...
  • De Vries, A., C. Steenholdt and Risco. ۲۰۰۵. Pregnancy rates ...
  • Fritz, S., A. Capitan, A. Djari, S.C. Rodriguez, A. Barbat, ...
  • Hansen, L.B. ۲۰۰۰. Consequences of selection for milk yield from ...
  • He, L., K. Vasiliou and D.W. Nebert. ۲۰۰۹. Analysis and ...
  • Hoseinpour Kol-Mahaleh, M., A. Farhadi, G. Rahimi Mianji and M. ...
  • Ishida, N. and M. Kawakita. ۲۰۰۴. Molecular physiology and pathology ...
  • Kanae, Y., D. Endoh, H. Nagahata and M. Hayashi. ۲۰۰۵. ...
  • Lucy, M.C. ۲۰۰۱. Reproductive loss in high-producing dairy cattle: where ...
  • Nagahata, H., H. Oota, A. Nitanai, S. Oikawa, H. Higuchi, ...
  • Pan, C.J., S.Y. Chen, H.S. Jun, S.R. Lin, B.C. Mansfield ...
  • Plaizier, J.C.B., K.D. Lissemore, D. Kelton and G.J. King. ۱۹۹۸. ...
  • Reinartz, S and O. Distl. ۲۰۱۶. Validation of deleterious mutations ...
  • Sewalem, A., G.J. Kistemaker and F. Miglior. ۲۰۱۰. Relationship between ...
  • Thomsen, B., P. Horn, F. Panitz, E. Bendixen, A.H. Petersen, ...
  • VanRaden, P.M., A.H. Sanders, M.E. Tooker, R.H. Miller, H.D. Norman, ...
  • Wall, E., S. Brotherstone, J.A. Woolliams, G. Banosa and M.P. ...
  • https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/۵۰۶۶۸۷. ...
  • نمایش کامل مراجع