جایگاه تاکسونومیکی جدایه های ایرانی ویروس موزائیک خیار از استان های کرمان و یزد

ویروس موزائیک خیار (CMV Cucumber mosaic virus,) یکی از ویروس های مهم کدوئیان در نقاط مختلف دنیاست. به منظور شناسایی و تعیین جایگاه تکاملی جدایه­های این ویروس، تعدادی نمونه از استان­های کرمان و یزد جمع­آوری گردید. آلودگی به CMV در این نمونه­ها توسط آزمون DAS-ELISA مورد بررسی قرار گرفت. بر اساس گیاه میزبان و مناطق نمونه­برداری، از نمونه های آلوده شش جدایه متفاوت، جهت مطالعات مولکولی انتخاب گردیدند. با استفاده از آزمون RT-PCR و آغازگرهای اختصاصی، یک قطعه ۹۴۶ جفت بازی در برگیرنده ژن پروتئین پوششی، تکثیر، همسانه سازی و تعیین ترادف گردید. قطعات همسانه سازی شده جهت تعیین جایگاه تکاملی جدایه­های ایرانی با ترادف های مشابه مربوط به سایر جدایه های CMV موجود در بانک ژن مقایسه شدند. آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد که جدایه­های بررسی شده در دو زیر گروه I و II قرار می­گیرند که زیر گروه I نیز به دو زیر گروه IA وIB تقسیم می­گردد. دو جدایه ایرانی CMV در زیر گروه IA و چهار جدایه دیگر در زیر گروه IB واقع گردیدند. بیشترین میزان تشابه ترادف نوکلئوتیدی در بین جدایه­های ایرانی به میزان ۱/۹۹% دربین دو جدایه Ker.Ker.Pep و Ker.Ker.Mel.۲ از زیر گروه IB و کمترین میزان تشابه به میزان ۱/۹۲% بین دو جدایه Ker.Jir.Cu از زیر گروه IA و Yaz.Yaz.Tom از زیر گروه IB تعیین گردید. جدایه­های زیر گروه IB اختصاص به کشورهای شرق آسیا داشته و این بررسی اولین گزارش از وجود تعدادی ازجدایه­های CMV مربوط به زیر گروه IB از ایران و خاورمیانه می­باشد.

Keywords:

فیلوژنی , پروتئین پوششی , ویروس موزائیک خیار