شناسایی و تعیین توالی ژنوتیپ های ایزوله های اکینوکوکوس گرانولوزوس در سگ های ولگرد با استفاده از ژن Cox۱ در ایلام، غرب ایران
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 253
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_SHIMU-24-6_010
تاریخ نمایه سازی: 5 آذر 1400
Abstract:
مقدمه: هیداتیدوزیس یکی از بیماری های مشترک انگلی بین انسان و حیوان و از رده سستودها با انتشار جهانی است. بیماری از دو بعد بهداشت عمومی و خسارت های اقتصادی دارای اهمیت فراوانی می باشد. این انگل تنوع ژنتیکی بسیار بالایی دارد و شامل کمپلکسی از ژنوتیپ های مختلف است. معمولا در مناطق آندمیک از لحاظ بیولوژی، تنوع ژنتیکی نسبتا زیادی در انگل وجود دارد که بر چرخه زندگی انگل، مسیرهای انتقال، بیماری زایی، آنتی ژنیسیتی، ایمنی زایی، پاسخ به داروها، همه گیر شناسی و کنترل این بیماری تاثیرگذار است. این مطالعه با هدف بررسی تنوع ژنوتیپی انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس در ایزوله های سگ های ولگرد در شهرستان ایلام در غرب ایران انجام شد.
مواد و روش ها: انگل بالغ از روده کوچک سگ های ولگرد جمع آوری شد. پس از استخراج DNA، نواحیmitDNA-cox۱ با PCR تکثیر و محصولات PCR با روش PCR-RFLP با دو آنزیم Alu۱ وHpaII آنالیز شدند. برای تایید نتایج PCR-RFLP تعدادی از محصولات PCR تعیین سکانس شدند. با استفاده از نرم افزار MEGA۶ آنالیز انجام شد.
یافته های پژوهش: از مجموع ۷۵ نمونه سگ، تعداد ۲۰ نمونه(۶۶/۲۶ درصد) به انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس آلوده بودند. اندازه قطعات تکثیر یافته با cox۱تمام ایزوله ها در PCR دارای باندهای مشابه و برابر bp۴۵۰ بود. الگو قطعات حاصل از PCR-RFLP با آنزیم Alu۱ دو قطعه ۱۷۵ و ۲۷۵ و با آنزیم HpaII ۲۶۵ و ۱۸۵ جفت باز به دست آمد. بر اساس نتایج PCR-RFLP و تعیین توالی همه ایزوله های سگ ژنوتیپ های مشابهی نشان دادند. آنالیزهای مولکولی و فیلوژنتیکی مشخص کرد که این ژنوتیپ ها با موارد ثبت شده در بانک ژن جهانی ۱۰۰-۹۹ درصد مشابهت و هم پوشانی داشتند.
بحث و نتیجه گیری: نتایج این مطالعه نشان داد که تشابه بین اندازه قطعات باندهای DNAاکینوکوکوس گرانولوزوس در ایزوله های سگ با روش های PCR-RFLP و تعیین توالی وجود دارد که بیانگر وجود ژنوتیپ های متشابه انگل در منطقه ایلام است و حداقل یک ژنوتیپ از انگل حضور دارد که متعلق به کمپلکس اکینوکوکوس گرانولوزوس سنسو استریکتو(G۱-G۳) می باشد. این مطالعه دارای اهمیت بهداشی و محیطی است زیرا بیماری خاستگاه حیوانی دارد و محیط پیرامون انسان را آلوده می سازند. این اطلاعات دلیلی بر اهمیت کنترل همه گیر شناسانه و پیشگیری در بخش های پزشکی و دام پزشکی می باشد.
Keywords:
Echinococcus granulosus , Genotypes , PCR-RFLP , Sequencing , Ilam , تعیین توالی , ایلام , PCR-RFLP , اکینوکوکوس گرانولوزوس , ژنوتیپ
Authors
مرتضی شمسی
Dept of Parasitology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.
عبدالحسین دلیمی
Dept of Parasitology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.
افرا خسروی
Dept of Immunology , Faculty of Medicien, Ilam University of Medical Sciences, Ilam, Iran
فاطمه غفاری فر
Dept of Parasitology, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran.
فاضل پوراحمد
Dept of Microbiology , Faculty of Veterinary Medicien, Ilam University, Ilam, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :