تبدیل توالی پروتئین به تصویر جهت طبقه بندی با شبکه عصبی کانولوشنی
Publish Year: 1399
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 401
This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
Export:
Document National Code:
JR_AICTI-12-44_010
Index date: 19 December 2021
تبدیل توالی پروتئین به تصویر جهت طبقه بندی با شبکه عصبی کانولوشنی abstract
از آنجا که روش های مخصوص قهقهبندی توالی یادگیری ماشووینج تهت قهقهبندی پروتئینهای سووالم و سوورقانی موفو نهودندبنابراین یافتن راهکاری برای بازنمایی این توالی ها جهت طبقه بندی افراد سالم و مریض با رویکردهای یادگیری عمیق ضرورت تامدارد. در این مطالعه، روش های مختلف بازنمایی توالی پروتئین، جهت طبقه بندی توالی پروتئین افراد سالم و سرطان خون، موردبررسی قرار گرفته است. نتایج نشان داد که تبدیل حروف اسید آمینه به بردار ویژگی یک بعدی در طبقه بندی ۲ کلاس موفق نبودو فقط یک کلاس مرتب تشخیص داده شد. با تغییر بردار ویژگی به صورت اعداد رنگی دقت تشخیص کلاس سالم کمی بهبود یافت.روش بازنمایی توالی پروتئینی به صورت یکپارچه دودویی، با ابتکار حفظ دنباله توالی در دو حالت یک بعدی و دوبعدی (تصویر بااعمال فیلتر گابور)، نسبت به روش های قبلی موثرتر بود. بازنمایی توالی پروتئین به شکل تصویر دودویی با اعمال فیلتر گابور با دقت۱۰۰% توالی پروتئین افراد سالم و ۹۸.۶ % توالی پروتئین افراد دارای سرطان خون را طبقه بندی کرد. یافته های این تحقیق نشان دادکه بازنمایی توالی پروتئین به شکل تصویر دودویی با اعمال فیلتر گابور، می تواند به عنوان روش موثر جدید دربازنمایی توالی هایپروتئینی جهت طبقه بندی، ارایه نماید.
تبدیل توالی پروتئین به تصویر جهت طبقه بندی با شبکه عصبی کانولوشنی Keywords:
تبدیل توالی پروتئین به تصویر جهت طبقه بندی با شبکه عصبی کانولوشنی authors
رضا احسن
استادیار دانشکده فنی مهندسی - دانشگاه قم - قم – ایران
منصور ابراهیمی
دانشیار دانشکده علوم پایه - دانشگاه قم - قم - ایران
روح اله دیانت
استادیار دانشکده فنی مهندسی - دانشگاه قم - قم – ایران