بررسی ارتباط فیلوژنتیکی جدایه های ویروس کوتولگی سبزرد هندوانه (WmCSV) استان سیستان و بلوچستان بر اساس توالی ژن رمز کننده پروتئین پوششی
Publish place: Journal of plant protection، Vol: 34، Issue: 3
Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 189
This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JPP-34-3_004
تاریخ نمایه سازی: 14 دی 1400
Abstract:
ویروسکوتولگی سبزرد هندوانه (Watermelon chlorotic stunt virus, WmCSV) به جنس Begomovirus از خانواده Geminiviridae تعلق دارد که بیشترین تعداد گونه را در مقایسه با سایر جنسهای آلودهکننده گیاهان در خانواده Geminiviridae دارد و از طریق سفید بالک منتقل میشود. به منظور شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی WmCSV در محصولات کدوییان جنوب شرق کشور در سالهای ۹۵ و ۹۶ بازدیدهایی از مزارع شهرستانهای زابل، زهک، هامون، هیرمند، نیمروز، زاهدان، سراوان، ایرانشهر، نیکشهر، سرباز، کنارک و چابهار در استان سیستان و بلوچستان انجام گرفت و از محصولات مختلف کدوییان شامل خربزه، طالبی، هندوانه، کدو مسمایی و حلوایی نمونهبرداری شد. از گیاهان دارای نشانه های زردی رگبرگ، کوتولگی گیاه، سبزردی و پیسکیشدن برگها، بدشکلی شدید و کوچک شدن اندازه میوه نمونهبرداری شد و نمونهها به آزمایشگاه منتقل شدند و سپس استخراج دی ان ای کل گیاه انجام شد. جهت شناسایی WmCSV از آغازگرهای اختصاصی Gem-CP-V-۵' و Gem-CP-V-۳' شناساییکننده جنس بگوموویروس در کدوییان استفاده شد. محصولات پی سی آر مورد انتظار، به طول ۵۵۰ جفت باز از ژن رمزکننده پروتئین پوششی، مورد توالییابی قرار گرفتند. نتایج تعیین توالی مربوط به ۱۶ نمونه از محصولات پی سی آر متعلق به مناطق مختلف استان آلودگی نمونهها را به WmCSV تایید کرد. آنالیز فیلوژنتیکی نتایج توالییابی، در این پژوهش با برنامه MEGA ۵، جدایههای WmCSV از استان سیستان و بلوچستان را در دو گروه مجزا تفکیک کرد. نتایج نشان داد که این گروهبندی ارتباطی با نوع میزبان و یا منطقه جغرافیایی نداشته و برخی جدایههای استان ارتباط نزدیکی با جدایههای کشورهای عمان و عربستان داشتند.
Keywords:
Authors
مجید جعفری
گروه گیاه پزشکی، مجتمع آموزش عالی سراوان
زهرا صادقی
گروه گیاه پزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
سعید نصراله نژاد
گروه گیاه پزشکی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان
احمد رضا شاهرخی
گروه گیاه پزشکی، مجتمع آموزش عالی سراوان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :