جدایه جدید Spiroplasma citri جدا شده از زنجرک Circulifer haematoceps در استان فارس

جدایه های Spiroplasma citri براساس تحرک الکتروفورزی پروتئین و RFLP ژن اسپیرالین به پنج گروه تقسیم شده اند (Foissac et al. ۱۹۹۶). در این گزارش دو جدایه جدید S. citri که واجدشرایط برای پایه گذاری گروه ششم هستند معرفی می گردد. پیش از این آلودگی S. citri در گیاه کنجد گزارش شده بود (Salehi and Izadpanah ۲۰۰۲). نمونه های زنجرک ناقل (Salehi et al.۱۹۹۳) آلوده بهS. citri از مناطق مختلف استان فارس جمع آوری شدند. حشرات ناقل آلوده (Circulifer haematoceps) جهت انتقال  S. citri روی گیاه پروانش (Catharanthus roseus) نگه داری شدند. وجود آلودگی در نمونه های گیاهی جمع آوری شده  از باغ ها و گیاهانی که توسط زنجرک ناقل و در شرایط گلخانه آلوده شده بودند با استفاده از آنتی سرم محلی که بر علیه جدایه S. citri تهیه شده بود تایید شد. محیط  LD۱۰(Lee and Davis ۱۹۸۴) جهت جداسازی بیمارگر از نمونه های آلوده مورد استفاده قرار گرفت. واکنش زنجیره ای پلیمراز با استفاده از جفت آغازگر F۱R۱ (TAATTTTAATAACATTTGCTT۳´,-´۵۳۵-GTTCTAAATAAGAAAAAGTTT-) که ژن اسپیرالین را تکثیر می کند انجام شد. محصول PCR در باکتری E. coli همسانه سازی وتعیین ترادف گردید. آنالیز RFLP ژن اسپیرالین نشان داد که اکثر جدایه های S. ctri در گروه یک قرار می گیرند اما دو جدایه اسپیروپلاسما که از زنجرک Circulifer haematocepsاز مزارع کنجد جدا شده بودند با هیچ یک از این پنج گروه تطابق نداشتند. ژن اسپیرالین در هر دو جدایه (Acc. No. FJ۷۵۵۹۲۱ and FJ۷۵۵۹۲۲.) دارای ۹۳ درصد همولوژی با جدایه GII۳بود و توانایی رمزگذاری ۲۴۴ آمینو اسید را داشت. این در حالی است که جدایه های گروه یک تا چهار تعداد ۲۴۱ و جدایه گروه پنج ۲۴۲ آمینو اسید را رمزگذاری می کنند. از طرف دیگر آنالیز RFLP ژن اسپیرالین نشان داد که این دو جدایه دارای یک جایگاه برشی اضافی با آنزیم  MboIدر موقعیت نوکلئوتید شماره ۴۵۶ به همراه تغییر در موقعیت دیگر جایگاه های برشی می باشد. این نتایج با الکتروفورز پروتئین در ژل آکریل آمید مورد تایید قرار گرفت. اندازه پروتئین اسپیرالین در این دو جدایه kDa۸/۲۲ بوددر حالی که اندازه این پروتئین در جدایه پالمیر kDa ۳۲ و در جدایه های گروه های یک تا چهار kDa ۵/۲۸- ۲۴ گزارش شده است. بنابراین با توجه به داده های موجود (Foissac et al. ۱۹۹۶) این دو جدایه را می توان در یک گروه جداگانه (گروه شش) قرار داد.