مطالعه مولکولی و آنالیز توالی ژن Wdhn۱۳ (LEA) در گندم های زراعی نان، دوروم و گونه های دهنده ژنومی آنها
Publish place: New Cellular Biotechnology - Molecular، Vol: 3، Issue: 9
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 162
نسخه کامل این Paper ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NCMBJ-3-9_002
تاریخ نمایه سازی: 21 اسفند 1400
Abstract:
سابقه و هدف : پروتئین های LEA اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی های عمومی ژن های LEA به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می آید. روش های بیو انفورماتیکی روش های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن Wdhn۱۳ پروتئین های LEA درگونه های مختلف گندم از ۸ گندم زراعی و وحشی(شامل سرداری، نان گنبد، دوروم شوش، دورورم بروجرد، اورارتو، دیکوکوئیدز، تائوشی و اسپلتوئیدز) استفاده شد و توالی بدست آمده از آنها با تنها توالی ژن Wdhn۱۳ مربوط به گندم نان در پایگاه اطلاعاتی NCBI از طریق نرم افزار های بلاست، CLC و داروین مقایسه شد یافته ها: نتایج آنالیز نشان داد که توالی ژن Wdhn۱۳ در گندم سرداری با توالی ژن Wdhn۱۳ مربوط به گندم نان موجود در NCBI بیشترین شباهت و توالی ژن Wdhn۱۳ در گندم اورارتو کمترین شباهت را با توالی ژن Wdhn۱۳ مربوط به گندم نان موجود در NCBI دارد. علت این تفاوت هم تغییرات در اسید های آمینه بر اساس تغییرات در توالی DNA نمونه ها می باشد. همردیفی از طریق نرم افزار BLAST و درخت فیلوژنتیکی رسم شده بر اساس الگوریتم UPGMA نیز موید این نتیجه بودند. همچنین درخت فیلوژنتیکی رسم شده سیر تکاملی منطقی را در ارتباط با این ژن برای اشتقاق گونه های دیپلوئید، تتراپلوئید و هگزاپلوئید از یکدیگر نشان داد. جدول فاصله توالی ها نیز موید این بود که نتایج BLAST و درخت فیلوژنتیک بر هم منطبق می باشند نتیجه گیری : نتایج این تحقیق نشان داد که با توجه به تکثیر ژن مورد نظر بر روی ژنوم های دیپلوئید اورارتو( AA ) و گونه های تتراپلوئید و هگزاپلوئید شامل ژنوم AA و عدم تکثیر برروی گونه های اسپلتوئیدز ( BB ) و تائوشی( DD ) می توان نتیجه گرفت که ژن Wdhn۱۳ بر روی ژنوم AA گندم قرار دارد.
Keywords:
Authors
مهران فلک ناز
Plant Breeding of Ilam University, Ilam, Iran
علی اشرف مهرابی
Agronomy and Plant Breeding Department, Ilam University, Ilam, Iran
دانیال کهریزی
Agronomy and Plant Breeding Department, Razi University, Kermanshah, Iran
علی اصغر نصراله نژاد
Agronomy and Plant Breeding Department, Agricultural Sciences & Natural Resources University of Groan
خیراله یاری
Medical Biology Research Center, Kermanshah University of Medical Sciences