بررسی بیوانفورماتیکی miRNA های موثر بر برخی از ژن های خانواده سلولز سینتاز (CESA) موجود درکلزا (.Brassica napus L)

سیدامیررضا فلاح قوی بازو لیالستانی; حبیب اله سمیع زاده لاهیجی; فرجاد رفیعی; محمد محسن زاده گلفزانی; محمدمهدی تقوایی

بررسی بیوانفورماتیکی miRNA های موثر بر برخی از ژن های خانواده سلولز سینتاز (CESA) موجود درکلزا (.Brassica napus L)

Publish place: 17th National Congress and 3rd International Congress of Agricultural Sciences and Plant Breeding of Iran

Publish Year: 1400

Type: Conference paper

Language: Persian

This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1419438

Document National Code:

NABATAT17_642

Index date: 14 March 2022

بررسی بیوانفورماتیکی miRNA های موثر بر برخی از ژن های خانواده سلولز سینتاز (CESA) موجود درکلزا (.Brassica napus L) abstract

کلزا (.Brassica napus L) به دلیل دارا بودن ۴۰ تا ۴۵ درصد روغن در هر دانه، سومین منبع بزرگ روغن نباتی در جهاناست. سلولز به عنوان برجسته ترین بخش تحمل بار بسیاری از دیواره های سلولی گیاه، نقش محوری در ریخت زایی واستحکام مکانیکی گیاه دارد. علاوه بر این سلولز توسط یک کمپلکس گسترده سلولز سینتاز (CESA) سنتز می شود.miRNA ها از عوامل کلیدی تنظیم کننده بیان ژن پس از رونویسی در موجودات یوکاریوتی هستند. در این مطالعهmiRNA های موثر بر ژن های خانواده CESA در کلزا که شامل ۸ نوع ژن است (CESA۴ ،CESA۳ ،CESA۲ ،CESA۱،CESA۸ ،CESA۷ ،CESA۶ ،CESA۵) مورد بررسی قرار گرفت و به صورت بیوانفورماتیکی و با استفاده از پایگاه دادهNCBI و نرم افزار تحت وب psRNATarget شناسایی شدند. و در انتها ارتباطات بین ژن های هدف و miRNA هایوابسته آنها به صورت نقشه در نرم افزار Cytoscape ترسیم شد. براساس نتایج بدست آمده در این مطالعه، برای ژن هایمذکور تعداد ۳۵ نوع microRNA در خانواده Brassicaceae شناسایی شد که بیشترین آنها به ترتیب شامل خانوادهmiR۳۹۵ و miR۱۵۶ و پس از آن ها miR۸۵۴ ، miR۱۶۴ و miR۳۹۷ بودند. از ۳۵ نوع microRNA شناخته شده، فقطسه خانواده miR۶۰۲۸ ،miR۸۳۸ ،miR۸۵۴ از سیستم ترجمه و بقیه از سیستم برشی استفاده می کنند.

بررسی بیوانفورماتیکی miRNA های موثر بر برخی از ژن های خانواده سلولز سینتاز (CESA) موجود درکلزا (.Brassica napus L) Keywords:

براسیکاسه , خانواده CESA , دیواره سلولی , سلولز

بررسی بیوانفورماتیکی miRNA های موثر بر برخی از ژن های خانواده سلولز سینتاز (CESA) موجود درکلزا (.Brassica napus L) authors

سیدامیررضا فلاح قوی بازو لیالستانی

دانشجوی کارشناسی ارشد گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان

حبیب اله سمیع زاده لاهیجی

استاد، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان

فرجاد رفیعی

استادیار، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان

محمد محسن زاده گلفزانی

استادیار، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان

محمدمهدی تقوایی

دانش آموخته دکتری، گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان