شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های کلیدی دخیل در تنش اسمزی گیاه آرابیدوپسیس
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 14، Issue: 1
Publish Year: 1400
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 435
This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JOAGK-14-1_009
Index date: 19 April 2022
شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های کلیدی دخیل در تنش اسمزی گیاه آرابیدوپسیس abstract
هدف: گیاهان اغلب در معرض انواع تنشهای محیطی مانند خشکی و شوری قرار میگیرند که منجر به تنش اسمزی در گیاه میشود و در نهایت سبب کاهش رشد و بهرهوری محصول میگردد. شناسایی ژنهای موثر در سطوح مختلف تنش اسمزی میتواند در یافتن ژن های موثر در تحمل گیاه به تنشهای محیطی بسیار کمک کند. از این رو هدف از این مطالعه، شناسایی ژنهای کلیدی و بسیار موثر گیاه مدل آرابیدوپسیس در تنش اسمزی و معرفی آنها در راستای به نژادی گیاهان زراعی در شرایط تنشهای محیطی است. مواد و روشها: در این مطالعه دادههای میکروآرایه آرابیدوپسیس که به مدت ۵/۱، ۳، ۱۲ و ۲۴ ساعت در معرض تنش اسمزی ناشی از مانیتول قرار داشتند، توسط ابزار آنلاین GEO۲R به طور جداگانه آنالیز شدند. ژنهای دارای بیان معنادار مشخص شدند و مهمترین ژنها در هر سطح تنش با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی تعیین شدند. سپس ژنهای کلیدی موثر در تنش اسمزی شناسایی شدند و برهمکنش پروتئینی و فرآیندهای بیولوژیکی آنها مورد بررسی و بحث قرار گرفت. یافتهها: در ساعات ۵/۱، ۳، ۱۲ و ۲۴ ساعت پس از تنش به ترتیب ۲۶، ۷۹، ۱۳۸ و ۱۸۴ ژن دارای بیان معنادار بودند. براساس آنالیز شبکه پروتئینی و بررسی فرآیندهای بیولوژیکی ژنهای SDA۱،CRK۱۱ ،CYP۸۱F۲ ،EDA۳۹ ،PLA۲A،T۱K۷_۲۴ ، F۶N۷_۲۴،AT۲G۲۵۷۳۵ و MRH۱۰_۱۸ به عنوان ژنهای کلیدی بسیار موثر در سطوح مختلف تنش اسمزی گزارش شدند. نتایج آنالیز عملکرد مولکولی ژنهای کلیدی نشان داد که این ژنها در پاسخ به تنش اکسیداتیو، پاسخ به کمبود اکسیژن، تنظیم حرکت روزنهها، پاسخ فوق حساسیت، پاسخ به کیتین، مقاومت سیستمیک القایی، فرآیند بیوسنتزی ایندول گلوکوزینولات، پاسخ دفاعی بوسیله رسوب کالوز در دیواره سلولی، پاسخ به یون کادمیوم، فرآیندهای بیوسنتزی فیتوکلاتین، انتقال آرسنیت، پاسخ دفاعی در برابر باکتری، حشرات، قارچها و ویروسها و فرآیندهای بیولوژیکی مرتبط با تنشهای محیطی نقش بسیار مهمی ایفا میکنند. نتیجه گیری: به نظر میرسد از ژنهای کلیدی معرفی شده در این پژوهش میتوان در راستای به نژادی گیاهان زراعی در شرایط تنش های محیطی که سبب تنش اسمزی در گیاهان میشود، بهره برد.
شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های کلیدی دخیل در تنش اسمزی گیاه آرابیدوپسیس Keywords:
شناسایی بیوانفورماتیکی ژن های کلیدی دخیل در تنش اسمزی گیاه آرابیدوپسیس authors
محمد محسن زاده گلفزانی
نویسنده مسئول: استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران،
مریم پسندیده ارجمند
دانشگاه گیلان
حبیب الله سمیع زاده لاهیجی
دانشگاه گیلان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :