سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

Login
PapersConferencesJournals

اتصال توالی های ژنی کدکننده ی نواحی اپی توپی پروتئین های غیرساختاری ویروس تب برفکی به روش OE-PCR یک مرحله ای

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 14، Issue: 2
Publish Year: 1401
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 253

This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Export:

Link to this Paper:
https://civilica.com/doc/1452114

Document National Code:

JR_JOAGK-14-2_005

Index date: 23 May 2022

اتصال توالی های ژنی کدکننده ی نواحی اپی توپی پروتئین های غیرساختاری ویروس تب برفکی به روش OE-PCR یک مرحله ای abstract

هدف: تب برفکی یک بیماری بسیار ویرانگر در حیوانات زوج سم می باشد که خسارات اقتصادی گسترده ای در صنعت دامپروری ایجاد می کند. اخیرا روش های تشخیصی این بیماری برای ردیابی آنتی بادی های علیه پروتئین های غیرساختاری ویروس تب برفکی بسیار توسعه یافته اند. پروتئین های غیرساختاری ۳ABC و ۳D که ارائه دهنده ی اپی توپ های خطی سلول های B هستند، تشخیص موثر دام های آلوده به ویروس را امکان پذیر می کنند. در این تحقیق، اپی توپ های خطی ایمنی زای غالب از پروتئین های ۳ABD برای طراحی ساخت توالی ژنی جدید و اتصال قطعات ۳AB و ۳D در نظر گرفته شد.  مواد و روش ها: از تکنیک گسترش نواحی همپوشان به کمک واکنش زنجیره ای پلیمراز (OE-PCR) برای سنتز توالی ۳ABD آنتی ژنی استفاده شد. RNA ویروسی از سلول های BHK آلوده به ویروس جداسازی و رونویسی معکوس شد. برای حذف توالی میانی ۶۵۴ نوکلئوتیدی ژن۳C ، یک جفت آغازگر داخلی با ۲۹ نوکلئوتید همپوشان و یک جفت آغازگر خارجی طراحی شدند. قطعات ۳AB و ۳D هرکدام در واکنش های جداگانه ی PCR تکثیر شدند و پس از الکتروفورز از ژل تخلیص شدند. این قطعات به عنوان الگو در OE-PCR برای سنتز توالی ۳ABD به کمک آغازگرهای خارجی و آنزیم Pfu پلیمراز در یک واکنش یک مرحله ای مورداستفاده قرار گرفتند. نتایج: نتایج این مطالعه نشان داد که هرکدام از قطعات ۳AB  (۴۱۸ جفت باز) و ۳D  (۵۵۷ جفت باز) با توالی های همپوشان به ترتیب در انتهای '۳ و '۵ تکثیر شدند. OE-PCR منجر به تکثیر چندین قطعه شد و قطعه ی ۳ABD با طول موردنظر (۹۴۶ جفت باز) پس از توالی یابی تایید شد. تنها با در نظر گرفتن ۲۹ جفت باز همولوژی در طراحی آغازگرهای همپوشان و یک آنزیم پلیمراز با دقت بالا، دو ناحیه ی اپی توپی از پروتئین های غیرساختاری ویروس تب برفکی (۳’-۳AB و ۵’-۳D) به هم متصل شدند. نتیجه گیری: توالی ژنی ساخته شده به روش OE-PCR یک مرحله ای، علاوه براین که نواحی آنتی ژنی پروتئین های غیرساختاری ۳ABD ویروس تب برفکی را دارا می باشد، مشکلات مربوط به هزینه ی بالای سنتز پپتید را ندارد و می تواند گزینه ی مناسبی برای تولید پروتئین نوترکیب و بررسی امکان استفاده در تشخیص بیماری تب برفکی به روش الایزا باشد.

اتصال توالی های ژنی کدکننده ی نواحی اپی توپی پروتئین های غیرساختاری ویروس تب برفکی به روش OE-PCR یک مرحله ای Keywords:

اتصال توالی های ژنی کدکننده ی نواحی اپی توپی پروتئین های غیرساختاری ویروس تب برفکی به روش OE-PCR یک مرحله ای authors

پروین مقدم

گروه علوم سلولی و مولکولی، دانشگاه خوارزمی کرج

آزاده زحمت کش

بخش تحقیق و تولید واکسن های بی هوازی، موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج

معصومه باقری

موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، کرج

پروانه اسمعیل نژاد اهرنجانی

بخش تحقیق و تولید واکسن های باکتریایی بی هوازی، موسسهی تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی، سازمان تحقیقات، ترویج و آموزش کشاورزی، کرج، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
خراتی کوپایی حامد، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۹۲) استفاده از روش رگرسیون ...
محمدآبادی محمدرضا، قاسمی مریم (۱۳۹۰) ارزیابی تنوع ژنتیکی گاوهای هلشتاین ...
معتمدی سده فرحناز، سلیمان جاهی حوریه، جلیلیان امیررضا، مهروانی همایون ...
ReferencesAndre P, Kim A, Khrapko K (۱۹۹۷) Fidelity and mutational ...
Badakhshan Y, Mohammadabadi MR (۲۰۱۵) Thermoregulatory Mechanisms of Jersey Adult ...
Barazandeh A, Mohammadabadi MR, Ghaderi-Zefrehei M, Nezamabadipour H (۲۰۱۶) Predicting ...
Bergmann IE, Neitzert E, Beck E, Gomes I (۱۹۹۳) Diagnosis ...
Clavijo A, Wright P, Kitching, P (۲۰۰۴) Developments in diagnostic ...
Danna K, Nathans D (۱۹۷۱) Specific cleavage of simian virus ...
De Diego M, Brocchi E, Mackay D, De Simone F ...
Duan X, Chen J, Wu J (۲۰۱۳) Improving the thermostability ...
Gao MC, Zhang RX, Li M, et al. (۲۰۱۲) An ...
Fu Y, Lu Z, Li P, et al. (۲۰۱۴) Development ...
Ghasemi M, Baghizadeh A, Abadi MRM (۲۰۱۰) Determination of genetic ...
Grubman MJ, Zellner M, Wagner J (۱۹۸۷) Antigenic comparison of ...
Höhlich BJ, Wiesmüller KH, Schlapp T, at al. (۲۰۰۳) Identification ...
Horton RM, Cai ZL, Ho SN, Pease LR (۱۹۹۰) Gene ...
Inoue T, Parida S, Paton DJ, et al. (۲۰۰۶) Development ...
Kadkhodaei S, Memari HR, Abbasiliasi S, et al. (۲۰۱۶) Multiple ...
Kharrati koopaei H, Mohammadabadi MR (۲۰۱۳) Model for prediction of ...
Kuwayama H, Obara S, Morio T, et al. (۲۰۰۲) PCR-mediated ...
Li G, Dong BX, Liu YH, Li CJ, Zhang LP ...
Lu H, Yu H, Guo R, Jia Y (۲۰۰۹). Improvement ...
Luo WG, Liu HZ, Lin WH, et al. (۲۰۱۳) Simultaneous ...
Mahajan S, Mohapatra JK, Pandey LK, et al. (۲۰۱۵) Indirect ...
Moghaddam P, Zahmatkesh A, Bagheri M, Mahravani H (۲۰۲۱) Are ...
Mohammadabadi MR, Ghasemi M (۲۰۱۱) Assessment of genetic diversity of ...
Mohammadabadi MR, Shaikhaev GO, Sulimova GE et al. (۲۰۰۴) Detection ...
Mohammadabadi MR, Soflaei M, Mostafavi H, Honarmand M (۲۰۱۱) Using ...
Motamedi Sedeh F, Soleimanjahi H, Jalilian AR, Mahravani H (۲۰۱۱) Construction of PCDNA۳.۱+ vector ...
Neitzert E, Beck EWALD, de Mello PA, Gomes I, Bergmann ...
O'Donnell VK, Boyle DB, Sproat K, et al. (۱۹۹۶) Detection ...
Shen F, Chen PD, Walfield AM, et al. (۱۹۹۹) Differentiation ...
Shevchuk NA, Bryksin AV, Nusinovich YA, et al. (۲۰۰۴) Construction ...
Smith HO, Welcox KW (۱۹۷۰) A restriction enzyme from Hemophilus ...
Thomson GR, Bastos ADS (۲۰۰۴) Foot-and-mouth disease. In: Infectious Diseases ...
Yang M, Clavijo A, Li M, et al. (۲۰۰۷) Identification ...
Zhang P, Ding Y, Liao W, et al. (۲۰۱۳). A ...
نمایش کامل مراجع