تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس(HaNPV) در استان های مازندران و گلستان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD.
Publish place: Journal of applied plant protection، Vol: 3، Issue: 2
Publish Year: 1393
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 349
This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_PLNTI-3-2_004
Index date: 20 July 2022
تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس(HaNPV) در استان های مازندران و گلستان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD. abstract
کرم غنچه توتون (Helicoverpa armigera) یکی از آفات مهم و کلیدی مزارع توتون محسوب می شود. ویروس چند وجهی هستهای (Nucleopolyhedrovirus) یکی از عوامل مهم کنترل بیولوژیک علیه کرم غنچه و تعدادی از گونههای دیگر می باشد. این تحقیق با هدف بررسی تنوع ژنتیکی جدایههای مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس در ۱۶ جمعیت طبیعی استانهای مازندران و گلستان انجام شد. نمونههای کرم غنچه توتون آلوده به ویروس از مزارع توتون در استانهای مازندران و گلستان جمعآوری شدند. خالصسازی ویروس و استخراج DNA با استفاده از روش CTAB انجام شد. در آزمون نشانگرهای RAPD ابتدا از ده جفت آغازگر جهت تکثیر DNA ویروس NPV استفاده گردید که از بین آنها دو جفت آغازگر که بیشترین پلیمورفیسم را داشتند، انتخاب شدند. این دو جفت آغازگر روی ۱۶ نمونه DNA مربوط به جدایههای مناطق جغرافیایی مختلف بررسی شدند. دو جفت آغازگر مورد استفاده همگی نوارهای قابل کدگذاری ایجاد کردند. پس از الکتروفورز محصولات PCR، در مجموع تعداد ۸۷ باند قابل امتیازدهی به دست آمد که از بین آنها، ۷۵ باند (۸۶ درصد) دارای چندشکلی بودند. تجزیه و تحلیل دادهها با استفاده از نرم افزارPyElph انجام شد. پس از گروهبندی جمعیتها با روش UPGMA در فاصله ژنتیکی ۲۰، پنج شاخه اصلی مشاهده شد که این بیانگر وجود تنوع ژنتیکی میان جدایههای مورد بررسی بود، ولی این تنوع ژنتیکی با توزیع جغرافیایی جدایهها مطابقت زیادی نداشت. با مبنا قرار دادن نشانگرRAPD جدایههایی از نوکلئوپلی هیدروویروس با بیشترین قرابت ژنتیکی در یک خوشه ژنی قرار گرفتند و بیشترین شباهت را نشان دادند. نتایج ثابت کرد که بین جدایههای مطالعه شده تنوع خوبی وجود داشت که جهت برنامههای به نژادی و همچنین کنترل بیولوژیک میتوان از آنها استفاده نمود.
تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس(HaNPV) در استان های مازندران و گلستان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD. Keywords:
تنوع ژنتیکی جدایه های مختلف نوکلئوپلی هیدروویروس(HaNPV) در استان های مازندران و گلستان با استفاده از نشانگر مولکولی RAPD. authors
مرضیه شازده احمدی
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، مازندران، ایران
هدی عاصمی
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران
زین العابدین شهادتی مقدم
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران
سید افشین سجادی
محققین مرکز تحقیقات و آموزش توتون تیرتاش، بهشهر، ایران