شناسایی مولکولی ویروس پیسک توت فرنگی (Strawberry mottle virus) از مزارع توت فرنگی استان کردستان بر اساس منطقه ۳΄NCR
Publish place: Plant pests and diseases، Vol: 87، Issue: 1
Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 75
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JAEN-87-1_009
تاریخ نمایه سازی: 22 شهریور 1401
Abstract:
در تابستان ۱۳۹۷، علائم ویروسی شامل پیسک، بدشکلی و سوختگی حاشیه برگها از مزارع توتفرنگی استان کردستان مشاهده و تعداد ۴۸ نمونه برگی جمعآوری شد. ابتدا برخی نمونهها به گیاه محک Fragaria vesca با استفاده از شته توتفرنگی (Chaetosiphon fragaefolii) تلقیح و علایم مطابق با Strawberry mottle virus (SMoV) ظاهر شد. سپس، آر ان ا کل از نمونهها با روش سیلیکا استخراج و دی ان ا مکمل آن ها با آغازگرهای تصادفی ششتایی ساخته شد. PCR با آغازگرهای اختصاصی SMoV- Sm۲ncr۱a و SMoV-Smdetncr۴a انجام و قطعهای به طول ۴۶۱ جفت باز در ۲۸ نمونه از ۴۸ نمونه فوق تکثیر گردید. به منظور اطمینان از نتیجه RT-PCR و بررسی مشخصات مولکولی، پنج جدایه براساس منطقه جغرافیایی، رقم میزبان و نوع علایم انتخاب و پس از الحاق به پلاسمید pTG-۱۹ در باکتری Escherichia coliانتقال و پلاسمیدهای نوترکیب همسانه شده تعیین توالی شدند. میانگین فاصله ژنتیکی در بین جدایههای در این تحقیق در سطح نوکلئوتیدی ۰۰۲/۰ ± ۰۰۵/۰ و با سایر جدایههای موجود در بانک ژن ۰۰۸/۰ ± ۰۸۴/۰ بود. مقایسه دوبه دوی توالیهای نوکلئوتیدی نشان داد که بیشترین و کمترین فاصله ژنتیکی به ترتیب میان جدایه K۳ با جدایه NSper۵۱ از کانادا (۰۱۵/۰ ± ۰۹۳/۰) و جدایه SQA یا AG با جدایه NB۹۲۶ از کانادا (۰۰۷/۰ ± ۰۱۹/۰) وجود داشت.این اولین گزارش از شناسایی این ویروس در مزارع توتفرنگی استان کردستان میباشد.
Keywords:
Authors
نسرین قادری زندان
گروه گیاهپزشکی دانشگاه کردستان، سنندج، ایران
محمد حاجی زاده
هیات علمی دانشگاه کردستان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :