تنوع ملکولی و روابط ژنتیکی ارقام پسته ایرانی و خارجی با استفاده از نشانگرهای هدفمند مبتنی بر CAAT-box ژن ها

آزاده ایمانی; جعفر احمدی; محسن حیدری

تنوع ملکولی و روابط ژنتیکی ارقام پسته ایرانی و خارجی با استفاده از نشانگرهای هدفمند مبتنی بر CAAT-box ژن ها

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 14، Issue: 3

Publish Year: 1401

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 22 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1529223

Document National Code:

JR_JOAGK-14-3_003

Index date: 3 October 2022

تنوع ملکولی و روابط ژنتیکی ارقام پسته ایرانی و خارجی با استفاده از نشانگرهای هدفمند مبتنی بر CAAT-box ژن ها abstract

هدف: بررسی میزان تنوع ژنتیکی در ارقام ایرانی و خارجی پستههای موجود در ایران با استفاده از نشانگرهای CBDP (CAAT box- derived polymorphism) و کارائی این نشانگرها در تفکیک و گروهبندی ارقام و از و اهداف این تحقیق بهشمار میآید. مواد و روش ها: در این تحقیق تنوع ژنتیکی ۷۳ رقم (۶۳ رقم ایرانی و ۱۰ رقم خارجی) با استفاده از ۲۵ آغازگر CBPD مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج: بر اساس نتایج آزمایش درصد چند شکلی باندها در ارقام ایرانی ۵۶/۷۷ درصد و در ارقام خارجی ۸۰/۶۷ درصد مشاهده شد. میانگین PIC برای نشانگرهای CBPD، ۷۶/۰ بود و تمام آغازگرهای CBDP توانایی بالایی در تفکیک ارقام پسته داشتند. میانگین MI (Marker Index) برای آغازگرهای CBDP برابر۶۵/۲ بود و آغازگر CAAT۲ بیشترین (۵۲/۸( مقدار MI را نشان داد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که از کل تنوع، چهار درصد به تنوع بین گروهی و ۹۶ درصد به تنوع ژنتیکی درون گروهی اختصاص دارد. مقدار Gst برابر با ۰۴/۰ تنوع پایین بین گروهی و مقدار Nm برابر با ۰۳/۱۱ احتمال وقوع جریان ژنی بین ارقام خارجی و ایرانی پسته را نشان داد. ارقام ایرانی از نظر هر دو شاخص تنوع ژنی Nei و شانون از مقادیر بالاتری نسبت به ارقام خارجی برخوردار بودند. تجزیه کلاستر با استفاده از ماتریس جاکارد و به روش UPGMA نشان داد که متوسط ضریب تشابه بین ارقام ۶۸/۰ بود و ارقام پسته مورد مطالعه در سه گروه اصلی از هم متمایز شدند که هر کدام از گروههای اصلی به چند زیرگروه تفکیک شدند. تجزیه به مختصات اصلی نیز تقسیم بندی حاصل از تجزیه کلاستر را تائید نمود. نتیجه گیری: استفاده از نشانگرهایCBDP برای بررسی تنوع ژنتیکی ارقام پسته مناسب میباشند و کارایی و قدرت تمایز آغازگرهای CBDP با توجه به بالا بودن میانگین PIC و MI تایید شد.

تنوع ملکولی و روابط ژنتیکی ارقام پسته ایرانی و خارجی با استفاده از نشانگرهای هدفمند مبتنی بر CAAT-box ژن ها Keywords:

تنوع ژنی , پسته , نشانگر عملکردی , جعبه CAAT , CBDP

تنوع ملکولی و روابط ژنتیکی ارقام پسته ایرانی و خارجی با استفاده از نشانگرهای هدفمند مبتنی بر CAAT-box ژن ها authors

آزاده ایمانی

دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک و به نژادی گیاهی، دانشگاه بین المللی امام خمینی(ره)، قزوین، ایران.

جعفر احمدی

استاد، گروه ژنتیک و به نژادی گیاهی، دانشگاه بین المللی امام خمینی(ره)، قزوین، ایران

محسن حیدری

کارشناس ارشد علوم باغبانی، پژوهشگر بخش تحقیقات پسته، مرکز پژوهشی فناوری های نوین باغبانی پسته، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

تاجآبادیپور علی (۱۳۷۶) شناسایی برخی از ارقام پسته ایرانی. پایان ...

حاجی زاده حسین آبادی محبوبه، کریمی حمیدرضا، دشتی حسین، شمشیری ...

حاجیرضایی معصومه، باقیزاده امین، جوادی غلامرضا، صادقیزاده مجید (۱۳۸۸) ارزیابی ...

عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۸۹) مطالعه تنوع ...

فابریکی اورنگ صدیقه، گلمحمدی مجید، کریمی حمید (۱۳۹۷) ارزیابی روابط ...

محمودی مریم ، آیت اللهی مهرجردی احمد ، محمدآبادی محمدرضا ...

ReferencesAlinaghizadeh R, Mohammad Abadi MR, Moradnasab Badrabadi S (۲۰۰۷) Kappa-casein ...

Anderson JR, Lubberstedt T (۲۰۰۳) Functional markers in plants. Trends ...

Askari N, A Baghizadeh, MR Mohammadabadi (۲۰۱۰) Study of genetic ...

Behboodi BS (۲۰۰۵) Ecological distribution study of wild pistachios for ...

Benoist C, Ohare K, Breathnach R, Chambon P (۱۹۸۰) The ...

Biton I, Shevtsov S, Ostersetzer O et al. (۲۰۱۲) Genetic ...

Bohn M, Utz HF, Melchinger AE (۱۹۹۹) Genetic similarities among ...

Caruso T, Iannini C, Monastra F et al. (۱۹۹۸) Genetic ...

Doyle JJ, Doyle JK (۱۹۸۷) A rapid DNA isolation procedure ...

Etminan A, Pour-Aboughadareh A, Noori Aet al. (۲۰۱۸) Genetic relationships ...

Fabriki Ourang S, Golmohammadie M, Karimi H (۲۰۱۹) Evaluation of ...

Ghasemi M, Baghizadeh A, Abadi MRM (۲۰۱۰) Determination of genetic ...

Gismondi A, Canini A (۲۰۱۳) Microsatellite analysis of latial (Olea ...

Golan-Goldhirsh A, Barazani O, Wang ZS et al. (۲۰۰۴) Genetic ...

Haji-Rezaei M, Baghizadeh A, Javadi GR, Sadeghizadeh M (۲۰۰۹) Genetic ...

Hormaza JI, Dollo L, Polito VS (۱۹۹۴) Determination of relatedness ...

Iranjo P, NabatiAhmadi D, Sorkheh K et al. (۲۰۱۵) Genetic ...

Kafkas S, Perl-Treves R (۲۰۰۲) Inter-specific relationships in the genus ...

Kafkas S, Ozkan H, Acar I et al. (۲۰۰۶) Detecting ...

Karimi HR, Zamani Z, Ebadi A, Fatahi MR (۲۰۰۹) Morphological ...

Kebour D, Boutekrabt A, Mefti M (۲۰۱۲) Using ISSR markers ...

Mahmoodi M, Ayatollahi A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۸) Studying exon ۴ ...

Moazeni S, Mohammadabadi MR, Sadeghi M et al. (۲۰۱۶a) Association ...

Moazeni SM, Mohammadabadi MR, Sadeghi M et al. (۲۰۱۶b) Association ...

Mohammadabadi MR (۲۰۱۷) Role of clostridium perfringens in pathogenicity of ...

Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (۲۰۱۷) Using inter simple ...

Marra FP, Caruso T, Costa F et al. (۲۰۱۳) Genetic ...

Nei M (۱۹۷۸) Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...

Norozi SH, Baghizadeh M, Jalali Javaran M. (۲۰۰۹) The genetic ...

Pazouki L, Mardi M, Salehi Shanjani P et al. (۲۰۱۰) ...

Peakall R, Smouse PE GenAlEx ۶ (۲۰۰۶) Genetic analysis in ...

Prevost A, Wilkinson MJ (۱۹۹۹) A new system of comparing ...

Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA et al. (۲۰۱۷) Assessment ...

Pour-Aboughadareh A, Ahmadi J, Mehrabi AA et al. (۲۰۱۸) Insight ...

Powell W, Morgante M, Andre C et al. (۱۹۹۶) The ...

Rajesh MK, Sabana AA, Rachana KE (۲۰۱۵) Genetic relationship and ...

Rolf FJ (۲۰۰۰) NTSYS-pc: numerical taxonomy and multivariate analysis system. ...

Shahmuradov IA, Gammerman AJ, Hancock JM et al. (۲۰۰۳) Plant ...

Singh AK, Rana MK, Singh S et al. (۲۰۱۴) CAAT ...

Tagizad A, Ahmadi J, Haddad R, Zarrabi MA (۲۰۱۰) Comparative ...

Tajabadipour A (۱۹۹۷) Identification of some of Iranian pistachio cultivars. ...

Williams JGK, Kubelik AR, Levak KJ et al. (۱۹۹۰) DNA ...

Yan W, Li J, Zheng D et al. (۲۰۱۹) Analysis ...

Yousefiazar-Khanian M, Asghari A, Ahmadi J et al. (۲۰۱۶) Genetic ...

نمایش کامل مراجع