بررسی تاثیر چندشکلی های گیرنده هورمون لپتین بر روی تمایل اتصال آن ها به هورمون لپتین در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی
Publish place: Veterinary Research & Biological Products، Vol: 35، Issue: 4
Publish Year: 1401
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 272
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_VTJ-35-4_013
Index date: 28 December 2022
بررسی تاثیر چندشکلی های گیرنده هورمون لپتین بر روی تمایل اتصال آن ها به هورمون لپتین در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی abstract
اتصال هورمون لپتین به گیرنده اختصاصی خود (LR) اولین گام مسیر تاثیرگذاری آن بر عملکردهای تولیدی و تولیدمثلی در گاوشیری است. لذا یکی از مسیرهای تنظیمی عملکرد لپتین الگوی اتصال آن به LR می باشد. هدف از انجام مطالعه حاضر مقایسه چندشکلی های مختلف گیرنده لپتین از نظر ساختار سوم پروتئین و تمایل برهمکنش آن ها با لپتین در گاو شیری بود. برای این منظور توالی های آمینواسیدی مختلف LR از بانک ژن گرفته شد. چندشکلی های مختلف LR با آنالیز هم ترازی شناسایی و ساختارهای سوم مربوط به آن ها با استفاده از نرم افزار Modeller پیش بینی گردید. ساختارهای پیش بینی شده با نرم افزار گرافیکی PyMol ۲.۵.۱ مشاهده و با استفاده از نمودار راماچاندران و نرم افزارهای Provean و I-MUTANT مورد ارزیابی قرار گرفتند. همچنین شاخص های مختلف فیزیکیوشیمیائی پروتئین های مدل شده مانند نقطه ایزوالکتریک، وزن مولکولی، تعداد دنباله های منفی و مثبت و مقدار GRAVY با استفاده از ابزار ProtParam در پایگاه Expasy محاسبه گردید. در ادامه میزان تمایل لپتین به هر کدام از چندشکلی های LR با استفاده از تکنیک داکینگ مولکولی و بر پایه دو شاخص موقعیت فضائی و انرژی اتصال مورد ارزیابی قرار گرفت. براساس نتایج بدست آمده تنها دو چندشکلی (LR۱ و LR۲) در میان توالی های مورد مطالعه شناسائی شد و در آنها آمینواسید آرژنین جایگزین سرین شده است. تفاوتی در شاخص های فیزیکوشیمیائی بین دو چندشکلی مشاهده نشد. ارزیابی های نمودار راماچاندران و I-MUTANT نشان دادند جایگزین شدن سرین با آرژنین به میزان محدودی ثبات LR۲ را تحت تاثیر قرار می دهد با این وجود به حسب نتایج Provean این تاثیرگذاری به حدی نمی باشد که ساختار و عملکرد آن را تحت تاثیر قرار دهد. نتایج داکینگ نشان داد میزان تمایل اتصال لپتین به LR۱ در مقایسه با LR۲ بیشتر می باشد و از دیدگاه تئوریک انتظار می رود LR۱ عملکرد مناسب تری نسبت به LR۲ در انتقال پیام لپتین داشته باشد. به طور کلی نتایج حاصل از این مطالعه می تواند نقش موثری در درک رابطه چندشکلی و فعالیت فیزیولوژیک داشته باشد.
بررسی تاثیر چندشکلی های گیرنده هورمون لپتین بر روی تمایل اتصال آن ها به هورمون لپتین در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی Keywords:
بررسی تاثیر چندشکلی های گیرنده هورمون لپتین بر روی تمایل اتصال آن ها به هورمون لپتین در گاوشیری به روش داکینگ مولکولی authors
فاطمه لایقی
گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
مهدی خدایی مطلق
گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک
محمد یحیائی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :