شناسایی نوکاردیا آستروئیدس کمپلکس با استفاده از روش Real Time PCRدر ایزوله های بالینی
Publish place: Journal of School of Public Health and Institute of Public Health Research، Vol: 17، Issue: 3
Publish Year: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 243
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_SJSPH-17-3_004
تاریخ نمایه سازی: 1 بهمن 1401
Abstract:
زمینه و هدف: طیف بیماری های عفونی ناشی از نوکاردیا آستروئیدس کمپلکس بسیار گسترده است.افتراق بین گونه ای اعضای جنس نوکاردیا جهت تعیین پیش آگهی، درمان مناسب و بموقع و همچنین مطالعات اپیدمیولوژیک ضروری است. از آن جهت که هر یک از گونههای نوکاردیا الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی خاص خود را دارد، دقت روش تشخیصی در درجه اول اهمیت قرار دارد. نیاز به روش های مولکولی با توجه به مزیت های آشکاری که بر روش های فنوتیپی و بیوشیمیایی دارند برای تشخیص به موقع و دقیق گونه های این کمپلکس کاملا روشن است. در این مطالعه برای اولین بار از روش Real Time PCR برای افتراق بین گونه ای نوکاردیا آستروئیدس کمپلکس استفاده شد.
روش کار: از مجموع ۲۵ ایزوله بالینی مشکوک به جنس نوکاردیا، ۱۰ تعداد ایزوله با استفاده از روش ها بیوشیمیای و فنوتیپی به عنوان نوکاردیا آستروئیدس کمپلکس شناسایی شدند. سپس استخراج DNA از ۱۰ ایزوله مشکوک انجام گرفت. کنترل مثبت هر سه گونه با استفاده از سویه های استاندارد تهیه شد. Real Time PCR برای هر ۱۰ ایزوله انجام شد. در نهایت محصول تکثیر شده گونههایی که با Real Time PCR به عنوان نوکاردیا آستروئیدس کمپلکس شناسایی شد، جهت تایید هویت برای توالی یابی فرستاده شد.
نتایج: نتایج توالی یابی نشان داد که از بین ۱۰ ایزوله بالینی مشکوک به نوکاردیا آستروئیدس کمپلکس ۳ ایزوله مربوط به نوکاردیا استروئیدس کمپلکس است. ۱ گونه نوکاردیا آستروئیدس، ۱ گونه نوکاردیا فارسینیکا و ۱ گونه نوکاردیانوا یافت شد.
نتیجه گیری: این مطالعه نشان داد که روش Real Time PCR نسبت به روش های فنوتیپی و بیوشیمیایی اختصاصیت و سرعت بیش تری داشته و جهت افتراق بین گونه ای روشی کارآمد محسوب می شود.
Keywords:
Authors
نگین بلورچی
MSc. Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
الهام ابراهیمی
PhD. Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
جلیل فلاح
PhD. Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
علی جوادی
PhD. Student, Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
سید سعید اشراقی
PhD. Department of Pathobiology, School of Public Health, Tehran University of Medical Sciences, Tehran, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :