روش ایمونو انفورماتیک برای طراحی واکسن پپتیدی مبتنی بر اپی توپ سلول B و T در برابر هپاتیت A

زمینه و هدف: ویروس هپاتیت HAV)A) یکی از مهم ترین عفونت های ویروسی در جهان است که عامل بیماری هپاتیت A است. HAV توزیعجهانی دارد و سالانه باعث حدود ۱.۵ میلیون مورد هپاتیت بالینی می شود. راه های مختلفی برای پیشگیری از هپاتیت A وجود دارد امابهترین راه واکسیناسیون است. هدف از این مطالعه طراحی واکسن مبتنی بر اپی توپ علیه HAV بر اساس آنالیز In silico برای تعیینحفاظت شده ترین اپی توپ های سلول B و T پروتئین VP۱ بود که قادر به تحریک پاسخ ایمنی قابل توجهی باشد.روش بررسی: توالی پروتئین VP۱ از پایگاه های داده پروتئین (NCBI & Uniprot) جمع آوری شد و با ابزار In silico (IEDB - ABCpred) برای شناسایی حفاظت شده ترین اپی توپ های ایمنی زا برای تحریک پاسخ ایمنی سلول های T و B تجزیه و تحلیل شد. ایناپی توپ های مناسب از نظر سمیت و حساسیت زایی و ایمنی زایی به ترتیب با استفاده از سرورهای Toxinpred ، AllerTop وVaxiJen مورد ارزیابی قرار گرفتند. در نهایت، پروتئین کایمریک به عنوان یک واکسن جدید مبتنی بر اپی توپ به ترتیب توسطسرورهای Prabi Garland و Swiss-model از نظر ساختارهای دو بعدی و سه بعدی طراحی و مورد سنجش قرار گرفت.یافته ها: بر اساس مطالعه ایمونوانفورماتیک، بیشترین اپی توپ (TFTFNSNNKE) و (VGITTMKDLKGKANR) برای تحریکTCD۸ و TCD۴ توسط سرور IEDB پیش بینی شد، همچنین اپی توپ مناسب (SNNKEYT) توسط سرور ABCpred برایتحریک سلول B پیش بینی شد. این پپتیدها به بیشترین تعداد آلل متصل شدند. همچنین اپی توپ های سمی و آلرژی زا نبودند کهتوسط سرورهای Toxinpred و AllerTop بررسی شدند در حالی که ایمنوژن بودند که با سرور VaxiJen مورد ارزیابی قرار گرفت.پروتئین کایمریک طراحی شده از نظر خواص فیزیکوشیمیایی و پایداری مناسب بود.نتیجه گیری: مطالعه ایمونو انفورماتیک نشان داد که اپی توپ های پیش بینی شده دارای کارایی و پایداری بالایی هستند که می توانند به عنوانیک واکسن پپتیدی، درمانی برای پیشگیری از عفونت HAV مورد استفاده قرار گیرند.

روش ایمونو انفورماتیک برای طراحی واکسن پپتیدی مبتنی بر اپی توپ سلول B و T در برابر هپاتیت A Keywords:

ایمنوانفورماتیک , واکسن های بر پایه اپی توپ , هپاتیت A