ردیابی و آنالیز تبارزایی چهار ویروئید مهم آلوده کننده تاکستان های استان زنجان

چکیده  ویروئیدها در دو خانواده آوسان ویروئیده با سه جنسPelamoviroid) ،  Avsunviroidو (Elaviroid و پوسپی ویروئیده با پنج جنس (Pospiviroid, Coleviroid, Cocaviroid, Hostuviroid, Apscaviroid) طبقه­ بندی می شوند که ویروئیدهای شناخته شده انگور متعلق به سه جنس خانواده پوسپی و یروئیده هستند. به­ منظور بررسی وضعیت آلودگی به ویروئیدهای انگور از تاکستان­ های استان زنجان نمونه برداری به صورت انتخابی از گیاهان دارای علائم مشکوک و همچنین فاقد علائم ظاهری مشخص بیماری های ویروئیدی انجام و در مجموع ۱۲۱ نمونه گیاهی دارای علائم یا بدون علائم جمع آوری شد. استخراج آران­ای کل از بافت­های برگی و آوندی صورت گرفت و سپس، ساخت دی­ان­ای مکمل (cDNA) با استفاده از آغازگر تصادفی شش تایی انجام شد. آزمون نسخه برداری معکوس-واکنش زنجیره ای پلیمراز (پی سی­آر) با استفاده از آغازگر اختصاصی ویروئیدهای برای ردیابی ویروئیدهای Grapevine yellow speckle viroid ۱(GYSVd-۱) ،(GYSVd-۲)   Grapevine yellow speckle viroid ۲،(HSVd)  Hop stunt viroid، Australian grapevine viroid (ASGVd) انجام شد و نتایج حاکی از تکثیر قطعات اختصاصی مربوط به ویروئیدهای ذکر شده به ترتیب در ۱۶، ۱۹، ۲۴ و ۲۶ نمونه (حدود ۱۴%، ۱۶%، ۲۰% و ۲۲% نسبت به کل نمونه ­های آزموده شده) بود. تعیین ترادف نوکلئوتیدی هفت محصول پی­سی­آر به صورت انتخابی وبررسی روابط تبارزائی بر اساس توالی­ های نوکلئوتیدی نشان داد که جدایه ­های جدید ردیابی ­شده در این تحقیق با جدایه ­هایی که قبلا از ایران گزارش شده­ اند در یک گروه تبار­زایی قرار می­گیرند. علاوه براین، آلودگی مخلوط ویروئیدهای مذکور نشان داد بیشترین آلودگی مخلوط مربوط به آلودگی با ویروئید کوتولگی رازک با سایر ویروئیدها در اکثر مناطق نمونه برداری شده بود. این مطالعه اولین گزارش از شناسایی ویروئیدهای مهم آلوده کننده تاکستان های استان زنجان بر اساس داده های مولکولی می باشد.

Keywords:

کلمات کلیدی: آلودگی مخلوط , خانواده پوسپی ویروئید , مخلوط واکنش زنجیره­ای پلیمراز , واکنش آرتی ­پی ­سی ­آر