پویش کل ژنومی صفات مرتبط با وزن تخم مرغ در نژاد رد آیلند رد با استفاده از روش های بیزی

تحقیق حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی و ژن­های کاندیدای مرتبط با صفات وزن تخم ­مرغ، بر اساس پویش ژنومی با استفاده از تراشه پربرون­داد Affymetrix ۶۰۰K chip در ۱۰۷۸ پرنده نسل یازدهم مرغ نژاد رد آیلند رد انجام شد. برای هر پرنده، هفت صفت شامل وزن تخم­ مرغ در اولین تخم­گذاری، و وزن تخم مرغ در سنین ۲۸، ۳۶، ۵۶، ۶۶، ۷۲ و ۸۰ هفتگی جمع­آوری شده بود. ارتباط بین هر یک از نشانگرهای چندشکل تک نوکلئوتیدی (SNP) و صفات مختلف با استفاده از روش­های بیز A و B در نرم­افزار GenSel نسخه ۹۰/۴ بررسی شد. در مجموع، نتایج این تحقیق نشان داد روش بیز A از نظر میزان واریانس ژنتیکی افزایشی توجیه شده در مقایسه با روش بیز B دارای عملکرد بهتری بود. تعداد نه نشانگر حاصل از روش بیزA  با بیشترین میزان واریانس ژنتیکی روی کروموزوم­های شماره ۱، ۳، ۵ و ۲۰ قرار داشتند. SNP­های شناسایی شده در نزدیکی ۳۵ ژن قرار گرفته بودند که از این میان، ژن­های کاندیدای BPIFB۲، OCX۳۶، CPT۱A، TCF۱۵، CECR۲، SIAH۳، FADS۱، FADS۲ و SGK۱ عملکردهای مهمی را در فرآیند تولید تخم ­مرغ از راه تشکیل پروتئین آلبومین، سوخت و ساز اسیدهای چرب و تشکیل پوسته تخم مرغ داشتند. نتایج تحقیق حاضر نشان می­دهد هنگامی که معماری صفات بررسی شده از مدل تعداد زیاد جایگاه ژنی پیروی کند، معمولا روش­ بیز A بر روش بیز B برتری دارد. علاوه بر این، با توجه به شناسایی مناطق ژنومی جدید و نقش کلیدی ژن­های ذکر شده در ایجاد وزن تخم ­مرغ، می­توان کارآیی روش بیز A برای پویش ژنومی در صفات وزن تخم مرغ را تایید کرد.

Keywords:

پویش ژنومی , روش بیزی , ژن کاندیدا , وزن تخم مرغ