مطالعه ارتباط ژنومی چند جمعیتی مشترک برای شناسایی مکان های ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند
Publish place: Animal Production Research، Vol: 11، Issue: 3
Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 270
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARGU-11-3_002
تاریخ نمایه سازی: 17 بهمن 1401
Abstract:
چندقلوزایی یکی از مهمترین صفات اقتصادی در گوسفند با تنوع داخل و بین نژادی است. این مطالعه به منظور شناسایی مکانهای ژنومی موثر بر چندقلوزایی در گوسفند با رویکرد مگاآنالیز مطالعه ارتباط ژنومی و با استفاده از دادههای ژنوتیپی و فنوتیپی شش نژاد گوسفند از پایگاه داده انجام شد. کنترل کیفیت با استفاده از نرم افزار Plink و ایمپیوتیشن با روش LD-kNNi انجام شد. مگاآنالیز با استفاده از مدل خطی مختلط در نرم افزار TASSEL با در نظر گرفتن خویشاوندی و ساختار جمعیت انجام شد. پس از پایان کنترل کیفیت، تعداد ۳۰۵ حیوان و ۳۵۱۶۱۵ نشانگر SNP با متوسط MAF برابر با ۳۳/۰ برای ادامه تجزیه مورد استفاده قرار گرفتند. نتایج مگاآنالیز، یک SNP را روی کروموزوم ۲۱ در سطح ژنوم و ۱۰ SNP در سطح کروموزومی روی کروموزوم های ۱، ۲، ۳، ۱۴، ۱۷ و ۲۲ شناسایی کرد که بهطور معنیداری با چندقلوزایی در گوسفند در ارتباط بودند. ژنهای OPCML، GULP۱، RBP۴، MMP۲ و LPCAT۲ شناسایی شده در این تحقیق، نقش موثری در باروری و موفقیت آبستنی دارند. نتایج این تحقیق می تواند در درک ساز و کار ژنتیکی کنترلکننده چندقلوزایی در گوسفند مورد استفاده قرار گیرد.
Keywords:
Authors
محسن قلی زاده
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
سید مهدی اسماعیلی فرد
دانش آموخته دکتری، گروه علوم دامی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :