ورود
مقالات فارسیISIکنفرانسهاژورنالها

ارزیابی تکاملی هاپلوتایپ های ژنتیکی غالب ویروس SARS-CoV-۲ در ایران در بازه زمانی خرداد تا آبان ۱۳۹۹

Publish place: Journal of Police Medicine، Vol: 11، Issue: 1
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 189

This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:
https://civilica.com/doc/1602608

شناسه ملی سند علمی:

JR_TEB-11-1_001

تاریخ نمایه سازی: 24 بهمن 1401

Abstract:

اهداف: مطالعات اولیه تغییرات نوکلئوتیدی درتوالی های ژنومی ویروس، منجر به شناسایی ۱۳ گروه هاپلوتایپی شده است. از بین این هاپلوتایپ ها موارد H۱، H۲ و H۵ بیشترین فراوانی را در دنیا نشان داده اند. بنابراین تغییرات برچسب تک نوکلئوتیدی، در این هاپلوتایپ ها با استفاده از روش PCR در جمعیت ایرانی ارزیابی شد. مواد و روش ها: نمونه های RNA این مطالعه مقطعی از افرادی که در بازه زمانی خرداد تا آبان سال ۱۳۹۹ به یکی از آزمایشگاه های تشخیصی ناجا در شهر تهران مراجعه کرده بودند و ابتلای آنها به COVID-۱۹ به وسیله تست PCR تایید شده بود، گرفته شد. ۳۰۰ نمونه به روش تصادفی انتخاب شدند. به منظور شناسایی و تعیین فراوانی تغییرات برچسب تک نوکلئوتیدی موجود در هاپلوتایپ های H۱،H۲ و H۵ تمام نمونه ها با استفاده از رویکرد ARMS-PCR ارزیابی شدند. جهت کسب اطمینان از صحت نتایج ARMS-PCR تعدادی از نمونه ها به روش Sanger، توالی یابی شدند. یافته ها: تعیین ژنوتیپ نمونه های ژنومی نشان داد، ۱۲۲ نمونه دارای جهش شاخص گروه هاپلوتایپی H۵ (۲۸۶۸۸T>C) و ۱۵۸ نمونه دارای جهش شاخص گروه هاپلوتایپی H۱ (۱۴۴۰۸C>T) بودند. همچنین مشاهده شد که ۱۱ نمونه همزمان با دو هاپلوتایپ ویروسی متفاوت آلوده شده بودند. به علاوه در نمونه های مورد بررسی گروه هاپلوتایپی H۲ مشاهده نشد. نتیجه گیری: ارزیابی ها حکایت از آن دارد که جمعیت غالب ویروس های آلوده کننده افراد ایرانی در اوایل همه گیری دارای هاپلوتایپ H۵ بودند. به دنبال گسترش قابل توجه گروه هاپلوتایپی H۱ در سطح جهان و با گذشت زمان، این گروه به عنوان هاپلوتایپ غالب جایگزین H۵ گردید. توالی های از نوع H۱ واجد تغییرات مهمی در دو ژن RdRp و S بودند که به ترتیب در تکثیر ژنوم ویروس و اتصال به سلول میزبان نقش داشتند.

Keywords:

Authors

شیرین جلیلی

Research Center for Life & Health Sciences & Biotechnology of the Police, Directorate of Health, Rescue & Treatment, Police Headquarter, Tehran, Iran

هادی شیرزاد

Research Center for Life & Health Sciences & Biotechnology of the Police, Directorate of Health, Rescue & Treatment, Police Headquarter, Tehran, Iran

صادق صالحی

Master of Genetics, Research Center for Life & Health Sciences & Biotechnology of the Police, Directorate of Health, Rescue & Treatment, Police Headquarter, Tehran, Iran

پیمان تقی زاده

Master of Genetics, Research Center for Life & Health Sciences & Biotechnology of the Police, Directorate of Health, Rescue & Treatment, Police Headquarter, Tehran, Iran

رضا محمدی

PhD in Military Psychology, Research Center for Cognitive & Behavioral Sciences in Police, Directorate of Health, Rescue & Treatment, Police Headquarter, Tehran, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۵۶/NEJMoa۲۰۰۱۰۱۷Hu B, Guo H, Zhou P, Shi ZL. Characteristics of ...
  • Fung TS, Liu DX. Human Coronavirus : Host-Pathogen Interaction. Annu Rev ...
  • Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of ...
  • Cucinotta D, Vanelli M. WHO declares COVID-۱۹ a pandemic. Acta ...
  • WHO. Addressing Human Rights as Key to the COVID-۱۹ Response. ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. World-wide tracking of major ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. Evolution of SARS-CoV-۲ genome ...
  • Forster P, Forster L, Renfrew C, Forster M. Phylogenetic network ...
  • Tang X, Wu C, Li X, Song Y, Yao X, ...
  • Pachetti M, Marini B, Benedetti F, Giudici F, Mauro E, ...
  • Khailany RA, Safdar M, Ozaslan M. Genomic characterization of a ...
  • Kames J, Holcomb DD, Kimchi O, DiCuccio M, Hamasaki-Katagiri N, ...
  • Djikeng A, Spiro D. Advancing full length genome sequencing for ...
  • Fattahi Z, Mohseni M, Jalalvand K, Aghakhani Moghadam F, Ghaziasadi ...
  • Wang R, Chen J, Gao K, Hozumi Y, Yin C, ...
  • Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۵۶/NEJMoa۲۰۰۱۰۱۷Hu B, Guo H, Zhou P, Shi ZL. Characteristics of ...
  • Fung TS, Liu DX. Human Coronavirus : Host-Pathogen Interaction. Annu Rev ...
  • Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of ...
  • Cucinotta D, Vanelli M. WHO declares COVID-۱۹ a pandemic. Acta ...
  • WHO. Addressing Human Rights as Key to the COVID-۱۹ Response. ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. World-wide tracking of major ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. Evolution of SARS-CoV-۲ genome ...
  • Forster P, Forster L, Renfrew C, Forster M. Phylogenetic network ...
  • Tang X, Wu C, Li X, Song Y, Yao X, ...
  • Pachetti M, Marini B, Benedetti F, Giudici F, Mauro E, ...
  • Khailany RA, Safdar M, Ozaslan M. Genomic characterization of a ...
  • Kames J, Holcomb DD, Kimchi O, DiCuccio M, Hamasaki-Katagiri N, ...
  • Djikeng A, Spiro D. Advancing full length genome sequencing for ...
  • Fattahi Z, Mohseni M, Jalalvand K, Aghakhani Moghadam F, Ghaziasadi ...
  • Wang R, Chen J, Gao K, Hozumi Y, Yin C, ...
  • Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۵۶/NEJMoa۲۰۰۱۰۱۷Hu B, Guo H, Zhou P, Shi ZL. Characteristics of ...
  • Fung TS, Liu DX. Human Coronavirus : Host-Pathogen Interaction. Annu Rev ...
  • Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of ...
  • Cucinotta D, Vanelli M. WHO declares COVID-۱۹ a pandemic. Acta ...
  • WHO. Addressing Human Rights as Key to the COVID-۱۹ Response. ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. World-wide tracking of major ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. Evolution of SARS-CoV-۲ genome ...
  • Forster P, Forster L, Renfrew C, Forster M. Phylogenetic network ...
  • Tang X, Wu C, Li X, Song Y, Yao X, ...
  • Pachetti M, Marini B, Benedetti F, Giudici F, Mauro E, ...
  • Khailany RA, Safdar M, Ozaslan M. Genomic characterization of a ...
  • Kames J, Holcomb DD, Kimchi O, DiCuccio M, Hamasaki-Katagiri N, ...
  • Djikeng A, Spiro D. Advancing full length genome sequencing for ...
  • Fattahi Z, Mohseni M, Jalalvand K, Aghakhani Moghadam F, Ghaziasadi ...
  • Wang R, Chen J, Gao K, Hozumi Y, Yin C, ...
  • Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, ...
  • https://doi.org/۱۰.۱۰۵۶/NEJMoa۲۰۰۱۰۱۷Hu B, Guo H, Zhou P, Shi ZL. Characteristics of ...
  • Fung TS, Liu DX. Human Coronavirus : Host-Pathogen Interaction. Annu Rev ...
  • Cui J, Li F, Shi ZL. Origin and evolution of ...
  • Cucinotta D, Vanelli M. WHO declares COVID-۱۹ a pandemic. Acta ...
  • WHO. Addressing Human Rights as Key to the COVID-۱۹ Response. ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. World-wide tracking of major ...
  • Safari I, InanlooRahatloo K, Elahi E. Evolution of SARS-CoV-۲ genome ...
  • Forster P, Forster L, Renfrew C, Forster M. Phylogenetic network ...
  • Tang X, Wu C, Li X, Song Y, Yao X, ...
  • Pachetti M, Marini B, Benedetti F, Giudici F, Mauro E, ...
  • Khailany RA, Safdar M, Ozaslan M. Genomic characterization of a ...
  • Kames J, Holcomb DD, Kimchi O, DiCuccio M, Hamasaki-Katagiri N, ...
  • Djikeng A, Spiro D. Advancing full length genome sequencing for ...
  • Fattahi Z, Mohseni M, Jalalvand K, Aghakhani Moghadam F, Ghaziasadi ...
  • Wang R, Chen J, Gao K, Hozumi Y, Yin C, ...
    • نمایش کامل مراجع