بررسی بیوانفورماتیکی تغییرات بیان رونوشت ژن های شیردان به آلودگی انگل Heamonchus contortus در گوسفندان مقاوم و حساس
Publish place: Animal Production Research، Vol: 11، Issue: 4
Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 204
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARGU-11-4_005
تاریخ نمایه سازی: 7 اسفند 1401
Abstract:
هدف از این مطالعه، انجام یک بررسی سیستماتیک و متاآنالیز دادههای جمع آوری شده از گوسفندان آلوده شده با Heamonchus contortus به عنوان یکی از مهمترین و بیماریزاترین انگلهای دستگاه گوارش گوسفند و تجزیه و تحلیل کلی تغییر در رونوشت ژنهای شیردان در پاسخ به این عفونت با استفاده از فناوری RNA-seq و ابزارهای بیوانفورماتیک بود. به منظور شناسایی ژن ها و مسیرهای مرتبط با عفونت، متاآنالیز با ترکیب مجموعه دادههای مختلف عفونت Heamonchus contortus گوسفند با استفاده از بسته رنک پراد نرم افزار R انجام شد و نتایج بهدست آمده برای استحصال اطلاعات بیشتر مورد تجزیه و تحلیلهای پائیندستی قرار گرفتند. نتایج حاصل از متاآنالیز نشان داد که در مجموع، ۱۳۸۸ ژن بین نژادهای مقاوم و حساس دارای بیان افتراقی (DEGها) بودند. مطابق با نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل هستیشناسی ژن و دانشنامه کیوتوی ژنها و ژنومها (KEGG)، این ژنهای دارای بیان افتراقی (DEGها) در فرآیندهای زیستی متعددی مانند سوخت و ساز واحدهای یک کربنی، ترجمه، مسیر سیگنالینگ رسپتور سطح سلولی، پاسخ ایمنی، مسیرهای متابولیکی و ... درگیر بودند. با استفاده از تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین-پروتئین، ژنهای هاب متعددی مانند آلبومین و CD۴ شناسایی شدند که ممکن است نشان دهد بهبود پاسخ ایمنی ناشی از افزایش بیان ژنهای مختلف در ایجاد مقاومت تاثیر میگذارد. نتایج این مطالعه، بینشی کلی از تغییرات در ترانسکریپتوم نژادهای مقاوم و حساس گوسفند و ساز و کارهای مولکولی مقاومت میزبان در نتیجه عفونت Heamonchus contortus ارائه میدهد که میتواند مبنایی برای تحقیقات بیشتر در مورد این موضوع فراهم نماید.
Keywords:
Authors
رامین صیقلانی
دانشجوی دکتری، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، پردیس دانشگاهی، دانشگاه گیلان
حبیب الله سمیع زاده لاهیجی
استاد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان
فرجاد رفیعی
استادیار، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان
مجید متقی طلب
استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه گیلان
میثم گلین شریفدینی
دانشیار، گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی گیلان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :