ردیابی و بررسی تبارزایی ویروس موزاییک شلغم (Turnip mosaic virus) در گیاه زعفران (Crocus sativus L.) در ایران

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 160

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARPP-7-1_002

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

Abstract:

چکیده ویروس موزائیک شلغم (Turnip mosaic virus; TuMV) یکی از اعضای جنس پوتی ویروس می­باشد که وسیع­ترین دامنه­ی میزبانی را در بین پوتی ویروس­ها دارد. به منظور ردیابی و شناسایی این ویروس، در ماه­های آبان و آذر سال ۱۳۹۵ از مزارع زعفران دارای علائم استان خراسان جنوبی و شهرستان های قاین، خوسف و بیرجند تعداد ۱۷۵ نمونه برداشت گردید. ردیابی اولیه­ی ویروس با آزمون الایزا صورت گرفت که طی آن آلودگی نمونه ها ۸۵/۱۰ درصد برآورد شد. سپس RNA کل استخراج و در آزمون RT-PCR با آغازگر اختصاصی ژن پروتئین پوششیTuMV ، قطعه­ای به طول تقریبی ۹۸۰ جفت باز تکثیر و تعداد ۹ جدایه تعیین توالی شد. بررسی تبارزایی ۹ جدایه­ی ایرانی با جدایه های موجود در بانک ژن بر مبنای توالی کامل ژن پروتئین پوششی، نشان داد که شش جدایه در گروه Asian BR همراه با جدایه هایی از چین، ترکیه و ایران قرار می­گیرند. در صورتیکه سه جدایه­ی دیگر این تحقیق درکنار سایر جدایه­های ایرانی این ویروس، در گروه World B نزدیک به جدایه­هایی از کانادا و نیوزلند قرار می­گیرند. بیشترین شباهت بین جدایه SKK۱۰ از ایران با جدایه­ی ایرانی IRNTT۳ به میزان ۹۶/۹۸ درصد و کمترین بین جدایه­ی ایرانی SKK۱۰ با AB ۰۹۳۵۹۸ از ایتالیا به میزان۵/۸۴ درصد می­باشد. از آنجا که جدایه­های ایرانی این ویروس روی گیاه زعفران در دو گروه کاملا مجزا قرار دارند، بنابراین از اجداد متفاوتی منشا گرفته اند. تحقیق حاضر اولین بررسی ویروس مذکور روی گیاه زعفران در ایران است.

Keywords:

واژه­ های کلیدی: ایران , ویروس موزائیک شلغم , پوتی ویروس , زعفران

Authors

مریم حیدری

دانشجوی کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند.

سیده عاطفه حسینی

استادیار بیماری شناسی گیاهی گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بیرجند.

راضیه دری

کارشناس مرکز تحقیقات زیست محیطی خراسان جنوبی.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • منابعایزدپناه ک، ۱۳۶۱. لیست مشروح بیماری های ویروسی و شبه ...
  • سبک خیز م ع، جعفرپور ب، شهریاری احمدی ف ا. ...
  • قربانی ش، شهرآئین ن، دهقانیار ح، سهندی ا.و پوررحیم ر، ...
  • Chang A. ۱۹۹۳. Modified CTAB RNA extraction method. Plant Molecular ...
  • Clewley JP and Arnold C, ۱۹۹۶. Sequence Data Analysis Guidebook ...
  • Farzadfar S, Ohshima K, Pourrahim R, Golnaraghi A, Sajedi S ...
  • Farzadfar S, Tomitaka Y, Ikematsu M, Golnaraghi AR, Pourrahim R, ...
  • Farzadfar SH and Pourrahim R, ۲۰۱۴. Characterization of Turnip mosaic ...
  • Haj Kassem A, and Walsh J, ۲۰۰۸. Characterising resistance to ...
  • Hughes SL, Green SK, Lydiate DJ and Walsh JA, ۲۰۰۲. ...
  • Korkmaz S, Tomitaka Y, Onder S and Ohshima K,۲۰۰۸. Occurrence ...
  • Martin D, Murrell B, Golden M, Khoosal A, Muhire B, ...
  • Monci FS, Nchez Campos S, Navas Castillo J and Moriones ...
  • Muhire BM, Varsani A and Darren PM, ۲۰۱۴. SDT: A ...
  • Ohshima K, Yamaguchi Y and Hirota R, ۲۰۰۲. Molecular evolution ...
  • Ohshima K, Tomitaka Y, Wood JT, Minematsu Y, Kajiyama H, ...
  • Sanchez F, Wang X, Jenner CE, Walsh JA and Ponz ...
  • Tamura K, Stecher G, Peterson D, Filipski A and Kumar ...
  • Tan Z, Wada Y, Chen J and Ohshima K, ۲۰۰۴. ...
  • Tomitaka Y and Ohshima K, ۲۰۰۶. A phylogeographical study of ...
  • Wang RY and Pirone TP, ۱۹۹۹. Purification and characterization of ...
  • Yasaka R, Ohba K, Schwinghamer M, Fletcher J, Ochoa-Corona F, ...
  • نمایش کامل مراجع