تعیین مشخصات مولکولی و تبارزایی ویروئید لکه زردی-۱ مو (Grapevine yellow speckle viroid-۱) از تاکستان های شمال غرب کشور

Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 139

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ARPP-2-1_003

تاریخ نمایه سازی: 15 اسفند 1401

Abstract:

به­منظور تعیین مشخصات مولکولی و بررسی ساختارهای ثانویه ویروئید لکه زردی- ۱ مو، ۱۳۷ نمونه از تاکستان­های استان­های اردبیل، آذربایجان­­­ شرقی و آذربایجان­ غربی جمع­آوری گردید. اسید نوکلئیک کل از بافت برگ نمونه­ها استخراج و پس از ساخت دی­ان­ای مکمل با استفاده از آغازگر شش­نوکلئوتیدی تصادفی، طول کامل این ویروئید با روش پی­سی­آر و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروئید لکه زردی -۱ مو،  تکثیر شد. محصول پی­سی­آر پس از همسانه­سازی در حامل pGEMT-easy، تعیین­توالی گردید. نتایج نشان داد که واریانت­های شناسایی­شده در این تحقیق، دارای ۳۶۷ یا ۳۶۸ نوکلئوتید هستند و در مجموع هفت واریانت جدید از این ویروئید تشخیص داده شد. درخت تبارزایی نشان داد که واریانت ۶ مشابه اعضای تیپ یک این ویروئید و شش واریانت بعدی در کنار تعدادی جدایه و واریانت دیگر تشکیل یک تیپ جداگانه (به­نام پیشنهادی تیپ ۴) را می­دهند. در ساختار ثانویه واریانت­های به­دست­آمده در این تحقیق، بیشترین تفاوت در منطقه متغیر و قسمت انتهایی چپ قرار داشت. ویروئید لکه زردی-۱ مو برای اولین بار از استان­های آذربایجان­شرقی و اردبیل گزارش می­شود.

Keywords:

آرتی- پی سی آر , ساختار ثانویه , مو , واریانت

Authors

محمد حاجی زاده

استادیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان

نعمت سخندان بشیر

دانشیار گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • زکی عقل م و ایزدپناه ک، ۱۳۸۹. شناسایی و تعیین ...
  • Flores R, Hernández C, Martínez de Alba AE, Daros JA ...
  • Foissac X, Savalle-Dumas L, Gentit P, Dulucq MJ and Candresse ...
  • Gazel M and Onelge N, ۲۰۰۳. First report of grapevine ...
  • Hadidi A, Flores R, Randles JW and Semanick JS, ۲۰۰۳. ...
  • Hajizadeh M, Navarro B, Bashir NS and Di Serio F, ...
  • Hajizadeh M, Navarro B, Bashir NS, Torchetti EM and Di ...
  • Hajizadeh M, Navarro B, Bashir NS and Di Serio F, ...
  • Jiang D, Peng S, Wu Z, Cheng Z and Li ...
  • King AMQ, Lefkowitz E, Adams MJ and Carstens EB, ۲۰۱۲. ...
  • Koltunow MA and Rezaian MA, ۱۹۸۸. Grapevine yellow speckle viroid: ...
  • Little A and Rezaian MA, ۲۰۰۳. Grapevine viroids. Pp. ۱۹۵-۲۰۶ ...
  • Minafra A, Martelli GP and Savino V, ۱۹۹۰. Viroids of ...
  • Polivka H, Staub U and Gross HJ, ۱۹۹۶. Variation of ...
  • Rigden JE and Rezaian MA, ۱۹۹۲. In vitro synthesis of ...
  • Sano T, Kobayashi T, Ishiguro A and Motomura Y, ۲۰۰۰. ...
  • Semancik JS, ۲۰۰۳. Pathogenesis. Pp. ۶۱-۶۶ In: Hadidi A, Flores ...
  • Shikata E, Sano T and Uyeda I, ۱۹۸۴. An infectious ...
  • Sokhandan NB, Gillings MR and Bowyer JW, ۱۹۹۷. Polymerase chain ...
  • Stellmach G and Goheen AC, ۱۹۸۸. Other virus and virus-like ...
  • Szychowski JA, Credi R, Reanwarakorn K and Semancik JS, ۱۹۹۸. ...
  • Szychowski JA, McKenry MV, Walker MA, Wolpert JA, Credi R ...
  • Tajima F and Nei M, ۱۹۸۴. Estimation of evolutionary distance ...
  • Tamura K, Peterson D, Peterson N, Glen Stecher, Nei M ...
  • Taylor RH and Woodham RC, ۱۹۷۲. Grapevine yellow speckle-a newly ...
  • Vuittenz A, ۱۹۷۰. Fanleaf of grapevine. Pp. ۲۱۷-۲۲۸ In: Frazier ...
  • Wan Chow Wah YF and Symons RH, ۱۹۹۷. A high ...
  • Ward LI, Bumip GM, Liefting LW, Harper SJ and Clover ...
  • Wassenegger M, Spieker RL, Thalmeir S, Gast FU, Riedel L ...
  • Wolpert JA, Szychowski JA and Semancik JS, ۱۹۹۵. Effect of ...
  • Zaki-Aghl M and Izadpanah K, ۲۰۰۹. Identification and partial characterization ...
  • Zuker M. ۱۹۸۹. On finding all suboptimal foldings of an ...
  • نمایش کامل مراجع