Three-Dimensional Quantitative Structure-Activity Relationship Analysis and Molecular Docking of some Nonpeptidic Inhibitors of Protein Tyrosine Phosphatase as Anti-Alzheimer Drugs
Publish place: Journal of Advanced Biomedical Sciences، Vol: 10، Issue: 2
Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 88
This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JABS-10-2_019
تاریخ نمایه سازی: 1 مرداد 1402
Abstract:
زمینه و هدف: بیماری آلزایمر نوعی اختلال عملکردی مغز است که به تدریج باعث تحلیل رفتن توانایی های ذهنی بیمار میشود. فعالیت بالای پروتئین تیروزین فسفاتاز (PTP) منجر به کاهش عملکرد حافظه و بیماری آلزایمر میشود؛ بنابراین مهار فعالیت PTP می تواند یک هدف بالقوه برای کشف داروهای ضد آلزایمر باشد. در این مطالعه با استفاده از روشهای کامپیوتری کاندیدهای دارویی ضد آلزایمر طراحی خواهند شد.
مواد و روشها: مطالعات کامپیوتری روابط کمی ساختار–فعالیت (کیوسار) سهبعدی بر روی دسته ای از بازدارندههای PTP انجام شد. در این راستا، روشهای تحلیل مقایسهای میدان مولکولی (کومفا) و تحلیل مقایسهای شاخصهای شکل مولکولی (کومسیا) برای تعیین فاکتورهای ضروری در فعالیت این ترکیبات مورداستفاده قرار گرفت. روش Distill برای بر خط کردن مولکولها به کار گرفته شد. تعدادی بازدارنده فعال جدید با استفاده از کانتورهای حاصل از مدل کومفا پیشنهاد شدند. مطالعات الحاق کردن مولکولی برای بررسی مکانیسم مهارکنندگی، شناسایی کانفورمر فعال زیستی و تعیین برهم کنش های کلیدی انجام شد. درنهایت مطالعات ADMET (جذب، توزیع، متابولیسم، هضم و سمیت) در محیط کامپیوتری روی این بازدارندهها انجام شد و با محدودههای استاندارد مقایسه شدند.
نتایج: پارامترهای آماری از مدلها (کومفا: ۹۶۱/۰, r۲ncv =۶۵۳/۰, q۲=۷۷۰/۰ r۲pred =و کومسیا: ۹۳۳/۰, r۲ncv =۵۶۴/۰, q۲=۷۴۶/۰ r۲pred =) نشان میدهند که دادهها به خوبی فیت شده و قدرت پیشگویی بالایی دارند. بر اساس اطلاعات به دست آمده از مدلهای ساخته شده، یک سری بازدارندههای جدید پروتئین تیروزین فسفاتاز با چارچوب های جدید مولکولی به عنوان کاندیداهای جدید دارویی ضد آلزایمر، معرفی گردید.
نتیجه گیری: تکنیک های محاسباتی نقش ارزشمندی در طراحی دارو ایفا میکنند. پارامترهای آماری r۲pred و q۲ مطلوب منجر به طراحی منطقی تعدادی بازدارندههای جدید پروتئین تیروزین فسفاتاز شدند که به عنوان کاندیدهای جدید دارویی ضد آلزایمر معرفی شدند.
Keywords:
Three-dimensional quantitative structure activity relationship , tyrosine phosphatase , Molecular docking , pharmacokinetics , روابط کمی ساختار- فعالیت سه بعدی , تیروزین فسفاتاز , الحاق مولکولی , فارماکوکنتیک
Authors
فرشته شیری
Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zabol, Zabol, Iran
علیرضا سام زاده کرمانی
Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zabol, Zabol, Iran
هادی صالح پودینه
Department of Chemistry, Faculty of Science, University of Zabol, Zabol, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :