Molecular docking study of anti-viral FDA-approved drugs as novel entry and replication Ebola viral inhibitors
Publish place: Journal of Advanced Biomedical Sciences، Vol: 9، Issue: 1
Publish Year: 1398
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 146
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JABS-9-1_009
Index date: 22 July 2023
Molecular docking study of anti-viral FDA-approved drugs as novel entry and replication Ebola viral inhibitors abstract
زمینه و هدف: به دلیل قدرت و شیوع بالای عفونتزایی و عدم داروی مناسب ویروس ابولا طی سال های اخیر، پژوهشهایی در خصوص کشف و معرفی داروهای ضد ابولا انجام شده است. هدف از این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار ورود و تکثیر ویروس ابولا توسط داروهای مجوزدار غیر ویروسی است.
مواد و روشها: این پژوهش به روش توصیفی- تحلیلی انجام گرفت. برای انجام این بررسی بیوانفورماتیکی، در ابتدا ساختار شیمیایی ترکیبات با استفاده از نرم افزار ChemDraw Ultra۱۰.۰ ترسیم شد سپس بهمنظور بهینهسازی انرژی، به نرمافزار Hyperchem۸ انتقال یافت. مطالعات داکینگ بهوسیله نرمافزار AutoDock۴.۲ انجام شد و در مرحله نهایی، مورد آنالیز و تجزیه وتحلیل قرار گرفت.
نتایج: یافتههای مطالعه حاضر نشان داد که پیوندهای درگیر در اتصال دارو با گیرندهها، پیوند هیدروژنی، اتصالات هیدروفوبی، π-π و کاتیون-π می باشند. در میان تمام ترکیبات موردمطالعه، بهترین نتایج داکینگ مربوط به داروهای آمودیاکین، دیفنوکسیلات و کلروکینون است. در حقیقت این سه دارو با منفیترین سطح انرژی اتصال تمایل بیشتری برای اتصال به اسیدهای آمینه جایگاه اتصال پروتئینهای GP و VP۴۰ دارند. ضعیفترین نتایج داکینگ مربوط به دو داروی دیریترومایسین و اریترومایسین است زیرا هیدروفیلیسیته این دو دارو بسیار زیاد است. به طورکلی، وجود بخشهای هیدروفوب، آمین نوع سوم و پیوندهای هیدروژنی بهینه باعث افزایش قدرت ضد ابولای داروها می شود.
نتیجه گیری: بر اساس نتایج به دست آمده از مطالعات بیوانفورماتیکی، تمام داروها تاثیرات مهاری خوبی را در جایگاه اتصال گیرندهها از خود نشان می دهند و می توانند بهعنوان مهارکنندههای موثر ورود و تکثیر ویروس ابولا مطرح شوند.
Molecular docking study of anti-viral FDA-approved drugs as novel entry and replication Ebola viral inhibitors Keywords:
Docking , Ebola viral , Drug repositioning , VP۴۰ , GP , داکینگ , ویروس ابولا , drug repositioning , پروتئین ماتریس ویروسی اصلی ۴۰ , گلیکو پروتئین
Molecular docking study of anti-viral FDA-approved drugs as novel entry and replication Ebola viral inhibitors authors
ساقی سپهری
Department of Medicinal Chemistry, School of Pharmacy, Ardabil University of Medical Sciences, Ardabil, Iran
واحد ادهمی
Department of Medicinal Chemistry, School of Pharmacy, Ardabil University of Medical Sciences, Ardabil, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :