طراحی و داکینگ تعدادی از مشتقات پیریمیدین به عنوان ترکیبات ضد مالاریا

زمینه و هدف: بر اساس آخرین تخمین منتشر شده توسط سازمان جهانی بهداشت در سال ۲۰۱۷ تعداد مبتلایان به مالاریا ۲۱۹ میلیون نفر بوده و مالاریا سبب مرگ ۴۳۵ هزار نفر گردیده است. با ظهور سویه های مقاوم به دارو در مالاریا، نیاز به اهداف جدید دارویی در هر زمان وجود دارد. در این مطالعه طراحی و داکینگ مشتقات پیرمیدین برای مهار آنزیم متیونین آمینوپپتیداز۱بی (MetAP۱b) انجام شد که به عنوان ترکیبات ضد مالاریا به عنوان داروی جدید و درجهت مقابله با مقاومت دارویی در نظر گرفته شده است. روش­ ها: مطالعات داکینگ با برنامه AutoDock انجام شد. ساختار مولکول­ها با برنامه­Hyperchem  کشیده شد و با روش Semi-empirical بهینه گردید. یافته­ ها: مطالعات داکینگ نشان داد که مهمترین پیوندهای درگیر در اتصال دارو با گیرنده پای-پای، پای-کاتیون و پیوند هیدروژنی می­ باشند. افزایش پیوندهای پای-پای و پای-کاتیون در افزایش قدرت این گروه از ترکیبات موثر است. همچنین درمجموع مشخص شد که ترکیب شماره ۷ موثرترین ترکیب در اتصال در جایگاه فعال آنزیم می ­باشند. نتیجه ­گیری: بر اساس نتایج به­ دست­ آمده از مطالعات داکینگ، تمامی ترکیبات طراحی شده تاثیرات مهاری خوبی را در جایگاه فعال آنزیم از خود نشان می ­دهند اما ترکیب ۷ بهترین اثر مهاری را از خود نشان داد. با توجه به نتایج حاصل از شیمی محاسباتی ترکیب شماره ۷ می تواند به عنوان کاندید داروی جدید ضد مالاریا باشد.

Keywords:

داکینگ , مالاریا , ۲-پیریدیل پیریمیدین , متیونین آمینوپپتیداز b۱ , شبیه سازی دینامیک مولکولی