تنوع مولکولی و فیلوژنتیک جدایه های استافیلوکوکوس اورئوس به دست آمده از منابع انسانی، لبنی و حیوانات خانگی با روش های RAPD-PCR و coa-PCR-RFLP

مطالعه حاضر به منظور مقایسه جدایه های مختلف استافیلوکوکوس اورئوس جدا شده از انسان، شیر خام و حیوانات خانگی از منظر حدت، بیماریزایی و تولید بیوفیلم، مقاومت های آنتی بیوتیکی و بررسی پروفایل ژنتیکی آن ها صورت گرفت. این مطالعه بر روی ۷۰ جدایه استافیلوکوکوس اورئوس صورت گرفت. پس از تائید تمامی جدایه ها در ابتدا آزمون های میکروبی حساسیت آنتی بیوتیکی و تشخیص تولید بیوفیلم توسط جدایه ها بر انجام شد. سپس استخراج DNA جدایه ها برای انجام سایر مراحل مولکولی صورت گرفت. در مرحله بعد شناسایی مولکولی ۹ ژن مقاومت و ۱۴ ژن مربوط به حدت باکتری، با استفاده از روش واکنش زنجیره ای پلی مراز (PCR) انجام شد. در نهایت جدایه ها با دو روش RAPD-PCR و coa-PCR-RFLP مورد ارزیابی ژنوتیپی قرار گرفته و داده های حاصل با استفاده از نرم افزار SPSS و نرم افزار آنالیز تصاویر الکتروفورز GelClust مورد ارزیابی و تحلیل قرار گرفت. از بین ۷۰ جدایه استافیلوکوکوس اورئوس، ۵۵ جدایه (۵/۷۸%) MRSA بودند. جدایه ها بیشترین مقاومت آنتی بیوتیکی را به متی سیلین، آمپی سیلین و پنی سیلین (۵/۷۸ درصد) و کمترین مقاومت را به سیپروفلوکساسین (۱۲/۸ درصد) نشان دادند. ژن های مقاومت ermB و tetM در تمامی جدایه ها حضور داشتند و ژن vanA در هیچ یک از جدایه ها شناسایی نشد. سیزده خوشه مجزا در روش ژنوتایپینگ RAPD-PCR و ۹ خوشه مجزا در روش coa-PCR-RFLP شناسایی شد. تجزیه و تحلیل آماری نشان داد که جدایه-های فاقد هرگونه مقاومت نسبت به آنتی بیوتیک ها به طور معناداری با منشاء شیر خام مرتبط بودند (۰/۰۵>P). همچنین از بین ۷۰ جدایه استافیلوکوکوس اورئوس، ۶۴ جدایه (۹۱/۴%) تولید کننده بیوفیلم در محیط کشت آگار کنگو رد (CRA) بودند. ژن های حدت spa و icaD در همه جدایه ها وجود داشت و etaAدر هیچ یک از جدایه ها شناسایی نشد

Keywords:

استافیلوکوکوس اورئوس , مقاومت آنتی بیوتیکی , عوامل حدت , ژنوتایپینگ , بیوفیلم