مهار آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس ایدز و برهمکنش با داروی نویراپین با استفاده از مطالعه داینامیک ملکولی

همواره پیشگیری و کاهش سرعت تکثیر ویروس HIV (اچ آی وی ) یک دغدغه در علم نوین بوده است. یکی از روش های متداول در مهار ویروس HIV استفاده از داروهای مهار کننده آنزیم می باشد. از جمله این آنزیم ها می توان به آنزیم ترانس کریپتاز معکوس اشاره کرد. استفاده از مهار کننده های آنزیمی علیه آنزیم های ویروسی یکی از راه های نوین و کارآمد در درمان بیماری های ویروسی است. این مهار کننده ها از طریق غیرفعال کردن آنزیم های حیاتی می توانند چرخه تکثیر ویروس ها را مختل و با کم کردن جمعیت آن ها از گسترش عفوننت های ویروسی جلوگیری کنند. آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس HIV-۱ اهمیت ویژه ای دارد. تاکنون برای این آنزیم مهار کننده هایی طراحی، تائید و جهت استفاده معرفی شده است. در این مطالعه، جهت ارزیابی داروی نویراپین در مهار آنزیم ترانس کریپتاز معکوس در ابتدا صورت بندی داروی نویراپین با روش Hartree-Fock به ترتیب با مجموعه پایه ی ۲۱G-۳ بهینه شد و پارامترهای ترمودنامیکی وابسته به آن محاسبه گردید. بهترین حالت اتصال نویراپین جایگاه اتصال پروتئین با کمک مطالعات داینامیک مولکولی معین شد. در پایان جهت ارزیابی اثر بازدارندگی مهار کننده های توصیه شده بر آنزیم ترانس کریپتاز معکوس از شبیه سازی های دینامیک ولکولی بهره گرفته شده است. با انجام آنالیزهای مربوطه در مدت انجام شبیه سازی، ملاحظه شد که داروی نویراپین عملکرد خوبی در مهار آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس HIV-۱ دارد.

Keywords:

نویراپین , سندورم نقص ایمنی اکتسابی , آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس HIV-۱ , مطالعات داینامیک مولکولی