شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز
Publish Year: 1402
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 211
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JASR-15-3_011
Index date: 8 October 2023
شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز abstract
پاراتوبرکلوزیس یا بیماری یون (JD) یکی از بیماریهای مهم مزمن التهاب رودهای در نشخوارکنندگان است. هدف پژوهش حاضر، شناسایی نشانههای انتخاب با استفاده از آماره نااریب تتا مرتبط با مقاومت به بیماری یون در دو نژاد بز جانیکا و سیریانا میباشد. به این منظور، مجموع ۳۳۱ حیوان برای ۵۳۳۴۵ جایگاه نشانگری SNP با استفاده از تراشههای Caprine SNP۵۰ BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. پس از کنترل کیفیت دادههای اولیه در نهایت، ۵۱۱۸۲ نشانگر SNP و ۳۲۶ راس دام وارد آنالیزهای بعدی شدند. حیوانات مورد استفاده بر اساس آزمون آنتیبادی سرم خون (الایزا) در دو دسته مقاوم به بیماری یا سالم (۱۶۲) و بیمار (۱۶۴) گروهبندی شدند. با در نظر گرفتن صدک ۹/۹۹ کل ارزشهای تتا، سیزده ناحیه ژنومی در نژاد جانیکا روی کروموزومهای ۱، ۵، ۷ (دو منطقه)، ۸، ۹ (دو منطقه)، ۱۱، ۱۶، ۱۷، ۱۸ و ۲۰ (دو منطقه) شناسایی شدند. همچنین، در نژاد سیریانا نواحی ژنومی روی کروموزومهای ۳، ۵ (دو منطقه)، ۱۰، ۱۲، ۱۶، ۱۷، ۱۸، ۲۳، ۲۴ و ۲۹ بالاتر از این دامنه بودند، شناسایی شدند. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق نشان داد که در داخل یا مجاورت این نواحی، ژنهای IL۴، IL۱۳، TLR۲، TLR۴، IFNGR۱، PGLYRP۱، CHI۳L۲، PPFIBP۱ و DENND۵B قرار داشتند. بررسی بیوانفورماتیکی این مناطق نشان داد، ژنهای موجود در این مناطق با سیستم ایمنی، مقاومت به بیماری و عفونت باکتریایی، پاسخ به استرس اکسیداتیو و سرکوب سرطان مرتبط هستند. نتایج این تحقیق میتواند منبع اطلاعاتی ارزشمندی در زمینه شناسایی مناطق ژنومی و در نتیجه، ژنهای مرتبط با بیماری یون در نژادهای مختلف بز فراهم آورد.
شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز Keywords:
شناسایی نشانه های انتخاب مرتبط با مقاومت به بیماری یون (JD) در نژادهای بز authors
حسین محمدی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک، اراک، ایران
محمد شمس اللهی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایلام، ایلام، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :