بررسی فراوانی آللی و پارامترهای ژنتیک قانونی ۱۰ جایگاه STR در اقوام کرد و عرب ایرانی

زمینه و هدف: توالی های کوتاه تکراری(Short tandem repeat; STR)،  بخش های حفاظت شده در ژنوم انسان هستند که در بین افراد مختلف، پلی مورفیسم بالایی را نشان می دهند. امروزه نشانگرهای مبتنی بر این جایگاه ها به عنوان ابزار اصلی تعیین هویت در دنیا مطرح می باشند. با توجه به متفاوت بودن فراوانی آللی این جایگاه ها در جمعیت های مختلف، به منظور استفاده از آنها باید نسبت به بررسی پارامترهای ژنتیکی آنها در هر جمعیت اقدام نمود. هدف از این مطالعه، بهینه سازی روش آزمایشگاهی برای استفاده از ۱۰جایگاه STR اتوزومی (TPOX، vWA، D۷S۸۲۰، D۸S۱۱۷۹، D۱۳S۳۱۷، D۱۶S۵۳۹، D۱۸S۵۱، D۵S۸۱۸، THO۱، D۲۱S۳۱۱) و همچنین بررسی پارامترهای ژنتیکی این جایگاه ها و کارآیی آنها در زمینه تشخیص هویت در اقوام کرد و عرب ایران بود. روش تحقیق: در این مطالعه نیمه تجربی، نمونه های تصادفی خون از ۹۳ فرد عرب و ۹۴ فرد کرد تهیه و پس از استخراج DNA، ده جایگاه اتوزومی با استفاده از واکنش PCR تکثیر شدند. سپس به منظور تعیین ژنوتیپ هر فرد در هر جایگاه از الکتروفورز ژل آکریل آمید استفاده شد. یافته ها: جایگاه D۱۳S۳۱۷ در هر دو جمعیت حتی پس از اعمال تصحیح Bonferroni از تعادل هاردی-واینبرگ انحراف داشت. پس از این جایگاه، بیشترین هتروزیگوسیته مشاهده شده در جمعیت کرد ۹۴درصد مربوط به جایگاه D۲۱S۳۱۱ و ۸۴درصد در جمعیت عرب برای جایگاه های THO۱، vWA و D۵S۸۱۸ بود. کمترین هتروزیگوسیته مشاهده شده به ترتیب ۷۱درصد و ۷۲درصد مربوط به جایگاه TPOX در جمعیت های کرد و عرب بود. بررسی شاخص های ژنتیک پزشکی قانونی (PI, PE, PD & PIC) نشان دادند که به جز جایگاه D۱۳S۳۱۷ باقی ۹ جایگاه ژنی ارزیابی شده، دارای مشخصات خوبی برای استفاده در انگشت نگاری ژنتیکی در جمعیت های کرد و عرب بودند. نتیجه گیری: نتایج این پژوهش ضرورت بررسی خصوصیات ژنتیکی قانونی قوم های مختلف ساکن نقاط مختلف جغرافیایی ایران به منظور انتخاب مجموعه داده مناسب برای محاسبه پارامترهای ژنتیک قانونی، نه تنها در داخل هر قوم بلکه بین آنها را نشان می دهد.

بررسی فراوانی آللی و پارامترهای ژنتیک قانونی ۱۰ جایگاه STR در اقوام کرد و عرب ایرانی Keywords:

DNA Fingerprinting , Allelic frequencies , Identity determination , STR Marker , Arab and Kurd ethnics , Forensic genetics , انگشت نگاری ژنتیکی , بررسی فراوانی آللی , تشخیص هویت , نشانگر STR , قوم کرد و عرب , ژنتیک پزشکی قانونی