مطالعه تنوع تعداد کپی روی کروموزوم جنسی در برخی از نژاد های گوسفند ایرانی
Publish place: IRANIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE، Vol: 54، Issue: 3
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 135
This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAS-54-3_004
تاریخ نمایه سازی: 8 آبان 1402
Abstract:
تنوع تعداد کپی (CNV) یکی از مهمترین تغییرات ساختاری در ژنوم است که نقش مهمی در واریانس ژنتیکی صفات اقتصادی دارند. در این مطالعه CNVها و نواحی تنوع تعداد کپی (CNVR) روی کروموزوم جنسی سه نژاد گوسفند بومی ایرانی شامل نژادهای دنبه دار بلوچی و لری بختیاری و نژاد بدون دنبه زل بررسی شدند. ژنوتیپ ۵۰ K نمونه ها جمع آوری و CNVها برای هر فرد با استفاده از نرم افزار PennCNV شناسایی شدند. سپس کنترل کیفیت CNVها با فیلترهای مختلف انجام شد و CNVRها با استفاده از نواحی همپوشان CNVها با استفاده از نرم افزار CNVRuler v۱.۵ شناسایی شدند. در مجموع، تعداد ۳۷، ۱۱ و ۴ CNV از نوع اضافه به ترتیب روی کروموزوم X گوسفند بلوچی، زل و لری-بختیاری شناسایی شد. کمترین، بیشترین و میانگین طول CNVهای شناسایی شده، به ترتیب ۹۴۴۷۷، ۱۲۹۳۱۵۴ و ۴۴۷۶۹۴ جفت باز در نژاد بلوچی ، ۲۷۱۸۱۹، ۹۰۶۶۴۴ و ۶۷۴۸۵۴ جفت باز در نژاد زل و ۹۹۷۰۵، ۳۰۶۵۲۵ و ۱۶۷۹۱۳ جفت باز در نژاد لری بختیاری بود. پس از ادغام CNVها به ترتیب تعداد ۳۰، ۱۰ و ۴ CNVR در این سه نژاد شناسایی شد که همگی از نوع اضافه بودند. بررسی عمکلرد ژن های نواحی CNVR نشان داد که برخی از این ژن ها (VEGF، VAM۲۱، TRPC۵، NDUFA۱، APLN وTNMD) با متابولیسم چربی در ارتباط بودند. حاشیه نویسی ژن ها برای عملکرد مولکولی، به طور معنی داری در مسیر arylsulfatase activity غنی سازی شدند که در تولید مثل نقش دارد. مطالعات بیشتر روی این مناطق CNV می تواند به شناسایی واریانت های سببی موثر بر متابولیسم چربی در گوسفند کمک نماید.
Keywords:
Authors
هادی یزدانی
گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
محسن قلی زاده
گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران
ایوب فرهادی
گروه علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری ، ایران
محمدحسین مرادی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک، اراک، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :