An Overview of the Second and Third-Generation of DNA Sequencing Technologies

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 77

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JABS-7-4_001

تاریخ نمایه سازی: 9 آبان 1402

Abstract:

تعیین توالی DNA از مهم ترین دستاوردهای بشر محسوب می شود. امروزه روش های متفاوتی جهت تعیین توالی نوکلئوتیدها به کار می رود. آشنایی با این دانش از ارکان اجتناب ناپذیر پژوهش های مرتبط با علم زیست شناسی است. تعیین توالی نوکلئوتیدها در گرایش های پژوهشی و کاربردی گسترده مانند تشخیص بیماری، زیست فناوری، زیست شناسی جنایی و زیست شناسی سیستماتیک استفاده می شود که به طور چشمگیری پژوهش و کشفیات در این زمینه را سرعت بخشیده است. تاکنون چندین نسل از فناوری تعیین توالی به وجود آمده که بر اساس ماهیت عملکرد و اطلاعات خروجی طبقه بندی می گردند. درحالی که روش تعیین توالی ختم زنجیره که توسط سنگر معرفی شد بیش از ۳۰ سال متداول بود و در پروژه ژنوم انسان نیز این روش استفاده شد اما در سال های اخیر تغییرات در فناوری تعیین توالی شتاب گسترده ای یافته است. در سال ۲۰۰۵ نخستین روش تعیین توالی نسل دوم معرفی شد که خروجی بسیار بالاتر و هزینه های فوق العاده کمتری نسبت به روش سنگر داشت و هم اکنون شاهد آغاز فعالیت نسل سوم فناوری تعیین توالی هستیم. ازآنجاکه پژوهشگران علم ژنتیک در ایران نیز از این فناوری ها استفاده می نمایند و با توجه به نیاز به منابع فارسی قابل فهم در این زمینه، مولفان مقاله حاضر بر آن شدند تا به ترجمه و نگارش مجموعه ای از مقالات مروری در این زمینه بپردازند. مقاله حاضر به معرفی مختصر مرسوم ترین روش های تعیین توالی نسل دوم و سوم پرداخته است.

Keywords:

DNA sequencing , High Throughput Nucleotide Sequencing , second generation sequencing , third generation sequencing , تعیین توالی DNA , تعیین توالی با توان عملیاتی بالا , نسل دوم فناوری تعیین توالی , نسل سوم فناوری تعیین توالی

Authors

فاطمه قربانی پارسا

Department of Animal Biology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran

محمد علی حسینپور فیضی

Department of Animal Biology, Faculty of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Maxam AM, Gilbert W. A new method for sequencing DNA. ...
  • Sanger F, Coulson AR. A rapid method for determining sequences ...
  • Sanger F, Nicklen S, Coulson AR. DNA sequencing with chain-terminating ...
  • Gilbert W, Maxam A. The nucleotide sequence of the lac ...
  • International Human Genome Sequencing Consortium. Finishing the euchromatic sequence of ...
  • Schloss JA. How to get genomes at one ten-thousandth the ...
  • Margulies M, Egholm M, Altman WE, Attiya S, Bader JS, ...
  • Roberts RJ, Carneiro MO, Schatz MC. The advantages of SMRT ...
  • Wang Y, Yang Q, Wang Z. The evolution of nanopore ...
  • Timp W, Mirsaidov UM, Wang D, Comer J, Aksimentiev A, ...
  • Ari Ş, Arikan M. Next-Generation Sequencing: Advantages, Disadvantages, and Future. ...
  • Anderson MW, Schrijver I. Next generation DNA sequencing and the ...
  • van Dijk EL, Auger H, Jaszczyszyn Y, Thermes C. Ten ...
  • Mutz KO, Heilkenbrinker A, Lönne M, Walter JG, Stahl F. ...
  • Shendure J, Ji H. Next-generation DNA sequencing. Nature biotechnology. ۲۰۰۸;۲۶(۱۰):۱۱۳۵-۴۵ ...
  • Heather JM, Chain B. The sequence of sequencers: The history ...
  • Buermans HP, Den Dunnen JT. Next generation sequencing technology: advances ...
  • Reuter JA, Spacek DV, Snyder MP. High-throughput sequencing technologies. Molecular ...
  • Bentley DR, Balasubramanian S, Swerdlow HP, Smith GP, Milton J, ...
  • Koboldt DC, Larson DE, Chen K, Ding L, Wilson RK. ...
  • Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu. Rev. Genomics Hum. ...
  • Guo J, Xu N, Li Z, Zhang S, Wu J, ...
  • Dohm JC, Lottaz C, Borodina T, Himmelbauer H. Substantial biases ...
  • Morey M, Fernández-Marmiesse A, Castiñeiras D, Fraga JM, Couce ML, ...
  • Harismendy O, Ng PC, Strausberg RL, Wang X, Stockwell TB, ...
  • Chen F, Dong M, Ge M, Zhu L, Ren L, ...
  • Illumina Company. http://www.illumina.com/systems/hiseq-x-sequencing-system/system.html۲۹. Clarke J, Wu HC, Jayasinghe L, Patel ...
  • Goodwin S, McPherson JD, McCombie WR. Coming of age: ten ...
  • Rothberg JM, Hinz W, Rearick TM, Schultz J, Mileski W, ...
  • Schadt EE, Turner S, Kasarskis A. A window into third-generation ...
  • Eid J, Fehr A, Gray J, Luong K, Lyle J, ...
  • Carneiro MO, Russ C, Ross MG, Gabriel SB, Nusbaum C, ...
  • Stoloff DH, Wanunu M. Recent trends in nanopores for biotechnology. ...
  • McGinn S, Gut IG. DNA sequencing–spanning the generations. New biotechnology. ...
  • Schneider GF, Dekker C. DNA sequencing with nanopores. Nature biotechnology. ...
  • Ashton PM, Nair S, Dallman T, Rubino S, Rabsch W, ...
  • Quick J, Quinlan AR, Loman NJ. Erratum: A reference bacterial ...
  • Bleidorn C. Third generation sequencing: technology and its potential impact ...
  • Mosher JJ, Bowman B, Bernberg EL, Shevchenko O, Kan J, ...
  • Weber-Lehmann J, Schilling E, Gradl G, Richter DC, Wiehler J, ...
  • Ku CS, Roukos DH. From next-generation sequencing to nanopore sequencing ...
  • نمایش کامل مراجع