تاثیر تنش خشکی بر تغییرات آنزیمی و مولکولی برخی آنتی اکسیدان ها در ژنوتیپ والدی و جهش یافته گندم نان با استفاده از داده های RNAseq

Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 83

This Paper With 21 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_ESCS-16-3_013

تاریخ نمایه سازی: 10 آبان 1402

Abstract:

گندم یکی از مهم ترین غلات جهان بوده و میزان تولید آن در مناطق مختلف تحت تاثیر خشکی کاهش می یابد. موتانت T۶۵-۵۸-۸ یک ژنوتیپ متحمل به خشکی می باشد که با پرتودهی به گندم طبسی ایجاد شده است. در این تحقیق در مرحله گلدهی به مطالعه آنزیم های دخیل در مکانیسم های تحمل به خسارت اکسیداتیو ناشی در برگ پرچم پرداخته شده و بیان ژن های مرتبط با این آنزیم ها نیز با استفاده از روش RNAseq بررسی شد. مقدار تنش خشکی بر اساس ظرفیت زراعی اعمال گردید. بررسی شاخص های سوپر اکسید دیسموتاز (SOD)، کاتالاز (CAT)، گلوتاتیون ردوکتاز (GR) و گلوتاتیون پراکسیداز (GPX) نشان داد در سطح احتمال یک درصد تفاوت معنی دار وجود دارد. با افزایش تنش خشکی، میزان فعالیت آنزیم سوپر اکسید دیسموتاز و کاتالاز در هر دو ژنوتیپ افزایش یافته است و این افزایش در ژنوتیپ موتانت بیشتر از والد طبسی بود. بررسی ۲۱ ژن مرتبط با آنزیم سوپر اکسید دیسموتاز نشان داد که بیان یک ژن FSD۳، دو ژن CSD۱، دو ژن FSD۲ و یک ژن CCS در ژنوتیپ موتانت در شرایط تنش خشکی نسبت به شاهد تغییر بیان معنی داری داشتند. از ۱۴ ژن مرتبط با کاتالاز، ۳ ژن با نام CAT۱ و ۳ ژن با نام CAT۲ در ژنوتیپ موتانت در شرایط تنش خشکی نسبت به شاهد افزایش معنی داری داشته اند. یک ژن CAT۱ و دو ژن CAT۲ در ژنوتیپ موتانت در شرایط خشکی دارای بیان بیشتری نسبت به ژنوتیپ والد طبسی بود. افزایش تنش خشکی باعث افزایش میزان فعالیت آنزیم های گلوتاتیون ردوکتاز و گلوتاتیون پراکسیداز شده و فعالیت این آنزیم ها در ژنوتیپ والد بیشتر از ژنوتیپ موتانت بود. از ۱۶ ژن مرتبط با گلوتاتیون پر اکسیداز تعداد ۷ ژن با نام CSA در ژنوتیپ موتانت در شرایط تنش خشکی نسبت به شاهد افزایش معنی داری داشتند. فعالیت آنزیم های SOD، CAT و GPX می تواند تحت تاثیر عوامل و ترکیبات شیمیایی مهار یا تشدید شود.

Keywords:

Authors

میثم رادفر

دانشجوی دکتری کشاورزی هسته ای و بیوتکنولوژی گیاهی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

سیده ساناز رمضانپور

دانشیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

حسن سلطانلو

دانشیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان

لیلا کیان مهر

محقق پسادکتری، گروه علوم زیستی و بیوتکنولوژی، دانشگاه شهید بهشتی تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Aebi, H., ۱۹۸۴. Catalase in vitro. Methods in Enzymology. ۱۰۵, ...
  • Alimohamadi, R., ۲۰۰۲. Water crisis and the ways to cope ...
  • Asada, K., ۲۰۰۶. Production and scavenging of reactive oxygen species ...
  • Basu, S., Ramegowda, V., Kumar, A., Pereira, A., ۲۰۱۶. Plant ...
  • Berkman, P.J., Lai, K., Lorenc, M.T., Edwards, D., ۲۰۱۲. Next ...
  • Bhabak, K.P., Mugesh, G., ۲۰۱۰. Functional mimics of glutathione peroxidase: ...
  • Bilski, J., ۲۰۰۱. Soil water status: content and potential. Campbell ...
  • Boon, E.M., Downs, A., Marcey, D., ۲۰۰۷. Porposed mechanism of ...
  • Bowler, C., Camp, W.V., Montagu, M.V., Inzé, D., Professor Kozi ...
  • Chelikani, P., Fita, I., Loewen, P.C., ۲۰۰۴. Diversity of structures ...
  • Chen, W., Guo, C., Hussain, S., Zhu, B., Deng, F., ...
  • Corpas, F.J., Fernandez-Ocana, A., Carreras, A., Valderrama, R., Luque, F., ...
  • Couto, N., Malys, N., Gaskell, S.J., Barber, J., ۲۰۱۳. Partition ...
  • Edwards, D., Batley, J., Snowdon, R.J., ۲۰۱۳. Accessing complex crop ...
  • Eftekhari, A., Baghizadeh, A., Yaghoobi, M.M., Abdolshahi, R., ۲۰۱۷. Differences ...
  • Faltin, Z., Holland, D., Velcheva, M., Tsapovetsky, M., Roeckel-Drevet, P., ...
  • FAO. Food and Agriculture Organization. ۲۰۱۸. Retrieved ۲۰۲۱, from http://faostat. ...
  • Farooq, M., Wahid, A., Kobayashi, N., Fujita, D., Basra, S.M.A., ...
  • Flexas, J., Niinemets, U., Galle, A., Barbour, M.M., Centritto, M., ...
  • Ford, K., Cassin, A., Bacic, A., ۲۰۱۱. Quantitative proteomic analysis ...
  • Foley, J.A., Ramankutty, N., Brauman, K.A., Cassidy, E.S., Gerber, J.S., ...
  • Foyer, C.H., Halliwell, B., ۱۹۷۶. The presence of glutathione and ...
  • Gayathri, D., Rashmi, B.S., ۲۰۱۶. Critical analysis of wheat as ...
  • Goodsell, D.S., ۲۰۰۴. Catalase. Molecule of the Month. RCSB Protein ...
  • Hussain, S., Khan, F., Cao, W., Wu, L., Geng, M., ...
  • Jain, P., Bhatla, S.C., ۲۰۱۴. Signaling role of phospholipid hydroperoxide ...
  • Kliebenstein, D.J., Monde, R.A., Last, R.L., ۱۹۹۸. Superoxide dismutase in ...
  • Li, C., Jiang, D., Wollenweber, B., Li, Y., Dai, T., ...
  • Luna, C.M., Pastori, G.M., Driscoll, S., Groten, K., Bernard, S., ...
  • Ma, X., Deng, D., Chen, W. ۲۰۱۷. Inhibitors and Activators ...
  • Maehly, A.C., Chance, B., ۱۹۵۴. The assay of catalases and ...
  • Majd, F., Ardakani, M.R., ۲۰۰۳. Nuclear Techniques In Agricultural Sciences. ...
  • Malek, M., Galavi, M., Ramroudi, M., Nakhzari Moghaddam, A. ۲۰۱۹. ...
  • McCOrd, J.M., Fridovich, I., ۱۹۶۹. Superoxide dismutase. An enzymic function ...
  • Md. Rohman., M., Alam, S.S., Akhi, A.H., Begum, F., Amiruzzaman, ...
  • Miller, A.F., ۲۰۱۲. Superoxide dismutases: ancient enzymes and new insights. ...
  • Minami, M., Yoshikawa, H., ۱۹۷۹. A simplified assay method of ...
  • Miri-hesar, K., Dadkhodaie, A., Dorostkar, S., Heidari, B., ۲۰۱۹. Differential ...
  • Mohammadkhani, N., Sharifi, P. ۲۰۱۶. Anti-oxidative response of different wheat ...
  • Muthukumar, K., Nachiappan, V., ۲۰۱۰. Cadmium-induced oxidative stress in Saccharomyces ...
  • Muthukumar, K., Rajakumar, S., Sarkar, M.N., Nachiappan, V., ۲۰۱۱. Glutathione ...
  • Navabpour, S., Yamchi, A., Bagherikia, S., et al., ۲۰۲۰. Lead-induced ...
  • Noctor, G., Foyer, C.H., ۱۹۹۸. Ascorbate and Glutathione: Keeping Active ...
  • Noormohammadi, Gh., Siadat, S.A., Kashani, A., ۲۰۰۷. Cereal Cultivation. Shahid ...
  • Nouri, H., Bagheri, Kia, S., Mahdavi Mushki, K., ۲۰۱۴. Plant ...
  • Pastore, A., Piemonte, F., Locatelli, M., Lo Russo, A., Gaeta, ...
  • Peng, J.H., Sun, D., Nevo, E., ۲۰۱۱. Domestication evolution, genetics ...
  • Pilon, M., Ravet, K., Tapken, W., ۲۰۱۱. The biogenesis and ...
  • Pompella, A., Visvikis, A., Paolicchi, A., De Tata, V., Casini, ...
  • Rajaram, S., Braun, H.J., van Ginkel, M., ۱۹۹۶. CIMMYT’s approach ...
  • Razmi, G.R., ۲۰۱۶. Irrigation Management in Wheat Fields. East Azerbaijan ...
  • Reddy, A.R., Chaitanya, K.V., Vivekanandan, M., ۲۰۰۴a. Drought-induced responses of ...
  • Reddy, A.R., Viswanatha Chaitanya, K., Vivekanandan, M., ۲۰۰۴b. Drought-induced responses ...
  • Sofo, A., Scopa, A., Nuzzaci, M., Vitti, A., ۲۰۱۵. Ascorbate ...
  • Song, J., Zeng, L., Chen, R., Wang, Y., Zhou, Y., ...
  • Song, Q., Liu, C., Goudia Bachir, D., Chen, L., Hu, ...
  • Theophilo, B., Marta, V., ۲۰۱۰. A variation of the Field ...
  • Wang, Z., Gerstein, M., Snyder, M., ۲۰۰۹. RNA-Seq: a revolutionary ...
  • Wang, W., Zhang, X., Deng, F., Yuan, R., Shen, F., ...
  • Zadoks, J.C., Chang, T.T., Konzak, C.F., ۱۹۷۴. A decimal code ...
  • Zhang, J., Li, B., Yang, Y., Hu, W., Chen, F., ...
  • نمایش کامل مراجع