بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های کلبسیلا پنومونیه دامی و انسانی با استفاده از روش ERIC-PCR و تعیین الگو حساسیت آنتی بیوتیکی

کلبسیلا پنومونیه، از جمله پاتوژ نهای فرصت طلب و عامل عفونت در انسان و حیوانات می باشد. مقاومت به آنتی بیوتیک در جدایه های کلبسیلا پنومونیه در حال افزایش است. تست حساسیت ضد میکروبی قبل از تجویز آنتی بیوتیک ها، لازم به نظر می رسد. هدف از مطالعه حاضر تعیین تایپ جدایه های بالینی و دامی کلبسیلا پنومونیه و ارزیابی حساسیت آنتی بیوتیکی بود. در مجموع ۱۰۰ جدایه بالینی و دامی کلبسیلا پنومونیه از شهرستان بابک جمع آوری شد. حساسیت آنتی بیوتیکی با روش کربی بائر با توجه به دستورالعمل CLSI انجام شد. سپس، استخراج DNA ژنومی با استفاده از کیت DNA انجام و واکنش زنجیره ای پلیمراز با پرایمر ERIC۱ و ERIC۲ انجام گردید. نتایج نشان داد که تمامی سویه های تحت مطالعه (۱۰۰%) به آنتی بیوتیک های آمپی سیلین و آمیکاسین مقاوم بودند. بیشترین و کمترین میزان مقاومت مریوط به تتراسیکلن (۵۳ سویه؛ ۳/۸۸%) و ایمی پنم (۸ جدایه؛ ۳/۱۳%) بود. نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای و ترسیم دندروگرام بر اساس شباهت های ژنتیکی، نمونه های مورد مطالعه را به هفده گروه مجزا تفکیک نموده است. با توجه به یافته های این مطالعه، مقاومت به آنتی بیوتیک در بین جدایه های کلبسیلا پنومونیه در حال افزایش می باشد. علاوه بر این، توال های ERIC دارای جفت بازی هستند که حاوی تکرارهای معکوس و مرکزی به شدت حفاظت شده بوده و در نواحی خارج ژنی ژنوم باکتری ها قرار گرفته اند و در تعیین تنوع ژنتیکی میان تمامی جدایه پیچیدگی کمتری دارند اما تفکیک خوبی در سطح سویه ایجاد می کنند.

Keywords:

کلبسیلا پنومونیه , ERIC-PCR , مقاومت آنتی بیوتیکی