بررسی تفاوت های سیستم گاباارژیک هیپوتالاموس مرغ های تخم گذار تجاری لگهورن سفید و مرغ بومی براساس داده های RNA-Seq
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 15، Issue: 4
Publish Year: 1402
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 171
This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_JOAGK-15-4_009
Index date: 26 December 2023
بررسی تفاوت های سیستم گاباارژیک هیپوتالاموس مرغ های تخم گذار تجاری لگهورن سفید و مرغ بومی براساس داده های RNA-Seq abstract
هدف: گابا اسید آمینه ی غیر پروتئینی است که از دکربوکسیله شدن گلوتامات توسط آنزیم گلوتامات دکربوکسیلاز بدست می آید. سیستم عصب مرکزی مملو از این اسیدآمینه می باشد، که به عنوان نورترانسمیتر اصلی مهاری در مغز عمل میکند. اثر بیولوژیک گابا بواسطه گیرنده های A,Bو C رخ می دهد که نوع A یونوتروپیک و دو نوع دیگر متابوتروپیک می باشند. وضعیت بیان ژنهای مسیر گاباارژیک در شرایط فیزیولوژیک مختلف متفاوت می باشد. یکی از این شرایط کرچی در طیور است که بررسی تحول این مسیر در وضعیت مرغ های با کرچی زیاد و بدون کرچی به کشف آن کمک خواهد کرد. مواد و روش ها:ابتدا داده های مربوطه از پایگاه NCBI با شماره دسترسی DRA۰۰۸۳۹۶ در فرمت SRA دانلود گردیدند. در ادامه برای بررسی کیفیت داده ها از نرم افزار FastQC و برای ترمیم داده ها و حذف آداپتورها از نرم افزار Trimmomatic استفاده گردید. از وبسایت هستی شناسی برای تعیین مسیرهای متابولیکی ژنها و از نرم افزار STRING در جهت رسم شبکه ژنی و ژنهای هاب استفاده شد. نتایج: در هیپوتالاموس مرغ های لگهورن غیر کورچ و مرغهای بومی کرچ ۲۹۴۳ ژن بیان شده مشاهده شد. که پس از آنالیز مسیر ۷ژن مرتبط با مسیرهای گاباارژیک شناسایی شدند. این ژنها شامل آنزیم های تبدیل کننده گلوتامات به گابا دو نوع می باشند که GAD۱ و GAD۲ می باشد .هر دوی این آنزیم ها در مرغ های بومی کرچ در مقایسه با مرغ لگهورن کاهش بیان را نشان داد. گیرنده گابا A و G وB به طور معنی داری کاهش و گیرنده گابا نوع A زیرواحد Pi و گیرنده C زیرواحد R۱ افزایش بیان در مرغ های بومی دچار کرچی نسبت به مرغ لگهورن در دادهای ترانسکریپتوم مشاهده شدند. نتیجه گیری: از بررسی مقایسات ترانسکریپتوم مسیر گاباارژیک هیپوتالاموس میان مرغ لگهورن و مرغ بومی تفاوت معنی دار گیرنده ها، آنزیم های سنتز کننده گابا مشاهده گردید. در مرغ های تخم گذار گابا و گیرنده های آن بیان ژن بالایی دارند و احتمالا از بررسی مسیر گاباارژیک در مراحل مختلف دوره تولید مرغ های تخم گذار مشاهدات قابل توجهی متبادر خواهد شد.
بررسی تفاوت های سیستم گاباارژیک هیپوتالاموس مرغ های تخم گذار تجاری لگهورن سفید و مرغ بومی براساس داده های RNA-Seq Keywords:
بررسی تفاوت های سیستم گاباارژیک هیپوتالاموس مرغ های تخم گذار تجاری لگهورن سفید و مرغ بومی براساس داده های RNA-Seq authors
یدالله بدخشان
استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران
زهرا رودباری
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران
ارسلان برازنده
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :