بررسی داکینگ مولکولی آورانتامید موجود در گیاه دارویی مورینگا الیفرا (Moringa Olifera) بر مهار پروستاگلاندین ها

درد مکانیسمی دفاعی محسوب می شود و هنگامی که بافتی دچار آسیب شود، ایجاد می گردد. گیرنده های درد در پوست و بافت ها، انتهای عصبی آزاد هستند. ایجاد درد در بافت ها به علت ساخته شدن موادی به نام پروستاگلاندین ها که از مهم ترین واسطه های التهاب می باشد و مهار ساخت آن توسط داروهای ضد التهاب موجب کاهش آن می شود. گیاه مورینگا الیفرا در صنایع غذا و دارو اهمیت بالایی دارد و دارای ترکیب دارویی نادر به نام آورانتی آمید (Auranti amide) می باشد. این ترکیب به دلیل اثرات ضدالتهابی و ضدروماتیسمی خود، در درمان بیماری های التهابی مانند آرتروز، روماتوئید و پسوریازیس کاربرد دارد و با ممانعت از تولید پروستاگلاندین ها و افزایش تولید گلوتاتیون، کاهش فعالیت آنزیم های آسپارتات آمینوترانسفراز و آلانین آمینوترانسفراز و کاهش تولید عامل التهابی TNF-α، عوارض التهابی را کاهش می دهد. هدف از این مطالعه بررسی اثر مهاری ترکیب دارویی اورانتامید بروی پروستاگلاندین ها از طریق داکینگ مولکولی می باشد. برای بررسی نحوه اتصال ترکیب دارویی به جایگاه فعال مولکول، ترسیم ساختار شیمیایی دارو، بهینه سازی انرژی، مطالعات داکینگ، تجزیه و تحلیل های نهایی از پایگاه داده های Pub Chem و PDB استفاده شد. میانکنش دارو با رسپتور از طریق داک های متفاوت با استفاده از نرم افزار های Pyrex، Chimera و Viewer Lite انجام شد. نتایج نشان داد که ترکیب مورد نظر قادر به اشغال جایگاه فعال آنزیم بود و در میان نرم افزارها بهترین نتیجه با استفاده از نرم افزار Pyrex بدست آمد. در واقع این ترکیب دارای منفی ترین سطح انرژی اتصال (Kcal mol ۵/۷-) بود. بنابراین نشان داده شد که بالاترین تمایل به آمینواسیدهای کلیدی جایگاه فعال آنزیم و محل برهمکنش با مولکول کوکریستال است.

Keywords:

داکینگ مولکولی , بیوانفورماتیک , آورانتامید , مورینگا , پروستاگلاندین