مقایسه دو نوع مارکر کلروپلاستی (SSR و PCR-RFLP) در بررسی ساختار ژنتیکی جمعیتهای راش Lipsky Fagus orientalis در جنگلهای خزری
Publish Year: 1385
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 19
This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJFPR-14-2_004
تاریخ نمایه سازی: 28 دی 1402
Abstract:
پلی مورفیسم DNA کلروپلاست (cpDNA) در ۱۴ جمعیت راش (Fagus orientalis Lipsky) توسط مارکرهای PCR-RFLP و میکروساتلایتی (SSR) مطالعه شد تا تاریخچه تکاملی این گونه مهم اقتصادی- اکولوژیکی جنگلهای شمال ایران روشن گردد. دو منطقه ژنی cpDNA، OAو DT تکثیر و به وسیله آندونوکلئازهای محدود کننده HaeIII و HinfI هضم شده و قطعات حاصل توسط الکتروفورز ژل پلی آکریل آمید جداسازی گردیدند. قطعات محدود کننده منطقه DT هیچ پلی مورفیسمی در میان افراد جمعیتهای مورد مطالعه نشان نداد. در حالی که در میان افراد درون جمعیتهای مورد مطالعه منطقه اسالم و جمعیت نکا- ۱۴۰۰، شاهد وجود پلی مورفیسم در قطعات محدود کننده منطقه OA بودیم. سه هاپلوتایپ (که از نظر فیلوژنتیکی مرتب شده اند) در گستره توزیع این گونه مشاهده شد. میزان بالای تمایز ژنتیکی (۷/۶۸%=Gst) با ساختار جغرافیایی در گوناگونی آن برخلاف مطالعات قبلی تمایز ژنتیکی هسته ای پایین (که از مطالعات قبلی توسط مارکرهای آنزیمی بدست آمده است) نشان دهنده کم بودن جریان ژن توسط بذر در راش می باشد. از ۹ میکروساتلایت کلروپلاستی مطالعه شده فقط ۲ میکروساتلایت کلروپلاستی پلی مورفیسم نشان دادند که براساس ترکیبهای مختلف آللهای مشاهده شده، ۱۰ هاپلوتایپ شناسایی شد. توزیع هاپلوتیپها تمایز قابل ملاحظه ای را با ساختار جغرافیایی مشخص (Fst= ۸۰%) نشان دادند. طبق آزمون واریانس ملکولی (AMOVA) ۵۲% از گوناگونی کل میکروساتلایتهای کلروپلاستی به اختلافهای میان منطقه ای، ۲۸% به تفاوتهای میان جمعیتی و ۲۰% به اختلافهای درون جمعیتی تعلق دارد. اگرچه تنوع هاپلوئیدی مشاهده شده توسط مارکر PCR-RFLP بسیار کمتر از SSR بود. با وجود این، هر دو مارکر غنای هاپلوئیدی بالایی در بخش غربی جنگلهای راش خزری نشان دادند. غنای هاپلوتیپی بالا در جمعیتهای غربی که توسط هر دو مارکر در این بررسی مشاهده گردید تاکیدی بر این فرضیه است که سمت و سوی گسترش راش در جنگلهای خزری از غرب به شرق بوده و فاصله جغرافیایی مهمترین عامل تمایز جمعیتی در راش می باشد.
Keywords:
Authors
پروین صالحی شانجانی
Member of Scientific board, Research Institute of Forests and Rangelands
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :