کاربرد بارکدگذاری DNA توسط مارکر ریبوزومی ITS در شناسایی و طبقه بندی مولکولی قارچ های اکتومیکوریز

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 30

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IRNAT-3-2_005

تاریخ نمایه سازی: 29 دی 1402

Abstract:

همزیستی اکتومیکوریزایی، همزیستی گسترده میان قارچ های خاکزی و ریشه های درختان جنگلی می باشد که در استقرار و عملکرد گیاهان در اکوسیستم های جنگلی نقش مهمی ایفا می کند. شناسایی قارچ­های اکتومیکوریز، گام نخست تمام مطالعات مرتبط با این همزیستی بوده و برای بهره برداری از حداکثر پتانسیل آن در مدیریت جنگل امری ضروری­ست. در دهه اخیر، تکنیک­های مولکولی آنالیز DNA برای حل چالش­های تاکسونومی مرتبط با شناسایی قارچ­های اکتومیکوریز در سطح نوک ریشه­های به دست آمده از عرصه، بخصوص وقتی داده­های ریخت شناسی متمایزکننده نبوده، استفاده شده است. تحقیق حاضر با هدف معرفی و تایید کارآیی آنالیزهای مولکولی DNA و مطالعات فیلوژنی در شناسایی قارچ های اکتومیکوریز درختان بلوط (Quercus sp.) در جنگل های شمال کشور اجرا شد. در بازدید از این جنگل­ها، نوک ریشه های اکتومیکوریزایی درختان بلوط جمع آوری و برای شناسایی مولکولی قارچ­ها ناحیه ITS۱-۵.۸S-ITS۲ با آغازگرهای گونه های قارچی، تکثیر و تعیین توالی شد. سپس تجزیه و تحلیل فیلوژنتیکی آنها به همراه توالی های موجود در پایگاه­های معتبر با روش بیس (Bayesian method) صورت گرفت که نتیجه آن شناسایی ۴۹ تاکسون مختلف از قارچ­های اکتومیکوریز متعلق به ۱۳ جنس بود. این بررسی نشان داد جمعیت متنوعی از قارچهای اکتومیکوریز در جنگل­های هیرکانی همراه درختان بلوط وجود دارد و استفاده از توالی ناحیه ITS rDNA ابزاری دقیق و ارزشمند جهت شناسایی این قارچ­ها در عرصه­های جنگلی ایران است.

Authors

سیده معصومه زمانی

دانش آموخته دکترا، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس و پژوهشگر موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

ناصر زمانی

دانشیار، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

ابراهیم محمدی گل تپه

استاد، گروه بیماری شناسی گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

محمدرضا عارفی پور

پژوهشگر، موسسه تحقیقات جنگلها و مراتع کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • زمانی، س. م.، ۱۳۹۳. شناسایی قارچ های اکتومیکوریز درختان بلوط ...
  • شرافتی، م.، کاظم پور اوصالو، ش.، خوش سخن مظفر، م.، ...
  • Agerer, R., ۱۹۸۶-۲۰۰۶. Colour Atlas of Ectomycorrhizae. Einhorn- Verlag Eduard ...
  • Altschul, S.F., Madden, T.L., Schaffer, A.A., Zhang, J., Zhang, Z., ...
  • Avis, P.G., McLaughlin, C.J., Dentinger, B.C. and Reich, P.B., ۲۰۰۳. ...
  • Avis, P.G., Mueller, G.M. and Lussenhop, J., ۲۰۰۸. Ectomycorrhizal fungal ...
  • Brundrett, M., Bougher, N., Dell, B., Grove, T. and Malajczuk, ...
  • Burke, D.J., Martin, K.J., Rygiewicz, P.T and Topa, M.A., ۲۰۰۵. ...
  • Courtecuisse, R., ۱۹۹۹. Mushrooms of Britain and Europe. Harper Collins, ...
  • Dahlberg, A., ۲۰۰۱. Community ecology of ectomycorrhizal fungi: an advancing ...
  • Dickie, I.A. and Reich, P.B., ۲۰۰۵. Ectomycorrhizal fungal communities at ...
  • Gardes, M. and Bruns, T.D., ۱۹۹۳. ITS primers with enhanced ...
  • Hawley, G.L., ۲۰۰۶. Ectomycorrhizal characterisation, species diversity and community dynamics ...
  • Ingleby, K., Mason, P.A., Last, F.T. and Fleming, L.V., ۱۹۹۰. ...
  • Iotti, M., Barbieri, E., Stocchi, V.and Zambonelli, A., ۲۰۰۵. Morphological ...
  • Jargeat, P., Martos, F., Carriconde, F., Gryta, H., Moreau, P.A. ...
  • Jonsson, L., Dahlberg, A., Nilsson, M., Zackrisson, O. and Karen, ...
  • Kõljalg, U., Larsson, K.H., Abarenkov, K., Nilsson, R.H., Alexander, I.J., ...
  • Morris, M.H., Perez-Perez, M.A., Smith, M.E. and Bledsoe, C.S., ۲۰۰۹. ...
  • Morris, M.H., Smith, M.E., Rizzo, D.M., Rejmánek, M. and Bledsoe, ...
  • Nilsson, R.H., Kristiansson, E., Ryberg, M., Hellenberg, N. and Larsson, ...
  • Richard, F., Millot, S., Gardes, M. and Selosse, M.A., ۲۰۰۵. ...
  • Ronquist, F. and Huelsenbeck, J.P., ۲۰۰۳. MrBayes ۳: Bayesian phylogenetic ...
  • Scattolina, L., Lancellotti, E., Franceschini, A. and Montecchio, L., ۲۰۱۴. ...
  • Smith, M.E., Douhan, G.W. and Rizzo, D.M., ۲۰۰۷. Ectomycorrhizal community ...
  • Taylor, J.W., Turner, E., Pringle, A., Dettman, J. and Johannesson, ...
  • Thornhill, D.J., LaJeunesse, T.C., Kemp, D.W., Fitt, W.K. and Schmidt, ...
  • Timling, I., Dahlberg, A., Walker, D.A., Gardes, M., Charcosset, J.Y., ...
  • van der Westhuizen, G.C.A. and Eicker, A., ۱۹۹۴. Field Guide: ...
  • Walker, J.F., Miller, O.K. and Horton, J.L., ۲۰۰۵. Hyperdiversity of ...
  • Weiβ, M., Yang, Z.L. and Oberwinkler, F., ۱۹۹۸. Molecular phylogenetic ...
  • White, T.J., Brun,s T.D., Lee, S. and Taylor, J.W., ۱۹۹۰. ...
  • نمایش کامل مراجع