سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP

Publish Year: 1396
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 129

This Paper With 21 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_RPPM-5-1_002

Index date: 13 February 2024

بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP abstract

توالی­های DNA ریبوزومی به­دلیل اینکه دارای کپی­های زیادی از ژن­های rRNA و نیز درجه بالایی از تغییر می­باشند، به­منظور بررسی روابط فیلوژنی در محدوده وسیعی از سطوح تاکسونومی مورد استفاده قرار می­گیرند. نواحی ITS و فواصل داخل ژنی DNA ریبوزومی هسته­ای، واحد­های تکراری تکامل یافته ثابت می­باشند و ممکن است در بین گونه های داخل یک جنس یا در بین افراد یک جمعیت متغیر باشند. به­منظور ارزیابی چند شکلی نواحی حد فاصل ژن­های s۲۸ و s۱۸ در ژنوم قارچ Rhizoctonia solani  گروه آناستوموزی ۴ (AG-۴)، ۲۸جدایه از میزبان­های مختلف مورد ارزیابی قرار گرفتند. از جدایه­ها DNA استخراج و از آن­ها به عنوان الگو در واکنش­های PCR استفاده شد. در تکثیر نواحی فاصله­ساز داخلی بین ژن­های ریبوزومی با استفاده از آغازگر­های ITS۱ و ITS۴ یک قطعه DNA به اندازه ۷۰۰ جفت باز ردیابی شد. قطعه مذکور با آنزیم­های برشیTaq I  Xba I, Hae III, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I, Hinc II, Hinf I, Eco RI, هضم شد. ولی آنزیم­های Xba I, Bam HI, Hind III, Sac I, Pst I, Nde I, Xho I فاقد محل برش بودند. نتایج حاصله نشان داد که جدایه­های Rhizoctonia solani AG۴ هتروژن بوده و ITS-RFLP با استفاده از آنزیم Hinc II تفاوت بین زیرگروه­های AG۴-HG I و AG۴-HG II رااز نظر الگوی برش آنزیمی نشان داد.

بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP Keywords:

بررسی چند شکلی DNA در جمعیت های AG-۴ Rhizoctonia solani با استفاده از نشانگر مولکولی rDNA RFLP authors

فرزانه بادپا

دانش آموخته کارشناسی ارشد، گروه زیست شناسی، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.

غلامرضا بلالی

دانشیار، گروه زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه اصفهان، اصفهان، ایران.

بهرام شریف نبی

استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Referencesahan, Iran. Mycopathologia ۱۵۸: ۳۷۷–۳۸۴ ...
Boysen M, Borja M, Del Moral C, Salazar O and ...
Bruns TD, White TJ and Taylor JW. ۱۹۹۱. Fungal molecular ...
Cubeta MA, Vilgalys R and González D. ۱۹۹۶. Molecular analysis ...
González D, Carling DE, Kuninaga S, Vilgalys R and Cubeta ...
González D, Cubeta MA and Vilgalys R. ۲۰۰۶. Phylogenetic utility ...
González V, Salazar O, Julián MC, Acero J, Portal MA, ...
Guillemaut C, Edel-Herman V, Comporota P, Alabouvette C, Richard-Molard M ...
Haratian M. ۲۰۱۲. Evaluation genetic structure populations Rhizoctonia solani AG۴ ...
Jabaji-Hare S. ۱۹۹۶. Biochemical methods. pp. ۶۵–۷۱, In B Sneh, ...
Kiliçoğlu Mc and Özkoç I. ۲۰۱۰. Molecular characterization of Rhizoctonia ...
Kuninaga S ۱۹۹۶. DNA base sequence relatedness. pp. ۷۴–۷۸, In ...
Kuninaga S and Yokosawa R. ۱۹۸۴a. DNA base sequence homology ...
Kuninaga S and Yokosawa R. ۱۹۸۴b. DNA base sequence homology ...
Lübeck M. ۲۰۰۴. Molecular characterization of Rhizoctonia solani. Applied Mycology ...
McDonald HJ and Rovira AD. ۱۹۸۵. Development of inoculation technique ...
Meinhardt LW, Wulff NA, Bellato CM and Tsai SM. ۲۰۰۲. ...
Menzies JD. ۱۹۷۰ Introduction: The first century of Rhizoctonia solani. ...
Moore RT. ۱۹۹۶. The dolipore/parenthesome septum in modern taxonomy. pp. ...
Pannecoucque J, Van Beneden S and Hofte M. ۲۰۰۸. Characterization ...
Parmeter JR and Whitney HS. ۱۹۷۰. Taxonomy and nomenclature of ...
Parmeter JR, Sherwood, RT and Platt WD. ۱۹۶۹. Anastomosis grouping ...
Puhalla J and Carter W. ۱۹۷۶. The role of the ...
Rahimian H. ۱۹۸۶. Rhizoctonia soil rot of tomato. Paper presented ...
Rosewich UL, Pettway RE, McDonald BA and Kistler HC. ۱۹۹۹. ...
Schneider J, Salazar O, Rubio V and Keijer J. ۱۹۹۷. ...
Sneh B, Burpee I and Ogoshi A (eds). ۱۹۹۱. Identification ...
Taylor JW, Jacobsen DJ and Fisher MC. ۱۹۹۹. The evolution ...
Vilgalys R and Cubeta M. ۱۹۹۴. Molecular systematics and population ...
Vilgalys R and Gonzalez D. ۱۹۹۰. Ribosomal DNA restriction fragment ...
Vilgalys R. ۱۹۸۸. Genetic relatedness among anastomosis groups in Rhizoctonia ...
Visscher H, Sephton MA and Looy CV. ۲۰۱۱. Fungal virulence ...
White TJ, Burns T, Lee S and Talor J. ۱۹۹۰. ...
نمایش کامل مراجع