معرفی روش ساده و آسان برای استخراج DNA ژنومی در قارچ های رشته ای

امروزه روش­های مولکولی لازمه انجام بسیاری از تحقیقات می باشد. اساس کار اکثر این آزمایشات و تحقیقات مولکولی بر پایه استخراج DNA می باشد، از این رو انتخاب و کشف روش جدیدی که در عین نتیجه بخش بودن، کم هزینه، ساده، کم خطر و سریع نیز باشد بسیار حائز اهمیت است. تکنیک های معمولی که در بخش کشاورزی جهت استخراج DNA قارچ­های رشته­ای مورد استفاده قرار می گیرد شامل C-TAB، فنل کلروفرم و کیت­های آزمایشگاهی استخراج DNA می باشد که هر کدام مزایا و معایب خاص خود را دارند، در این مقاله روشی جهت استخراج DNA از قارچ های رشته ای پادزیست، گندرو و بیماری زای گیاهی معرفی می گردد که تلفیقی از روش­های مذکور به منظور تسهیل و عدم استفاده از ازت مایع و فنل جهت استخراج DNA می باشد که در مورد مخمرها نیز استفاده می شود. این روش، روش خرد کردن با گریندر نام دارد که ایمن­تر، کم هزینه­تر و سریع­تر بوده و DNA حاصله از درجه خلوص نسبتا بالایی برخوردار است. خلوص و کیفیتDNA استخراج شده توسط این روش به کمک اسپکتروفتومتر بررسی گردید و به کمک آغازگر­های اختصاصی و PCR، ناحیه ی ITS از DNA ریبوزومی و ژن β-tubulin در DNA استخراج شده، تکثیر گردید. با توجه به نتایج به دست آمده از اسپکتروفتومتر و کیفیت باند­های حاصل از محصول PCR در ژل آگاروز، می توان این روش را به­عنوان یک روش عملی و مناسب جهت استخراج DNA قارچ های رشته ای بکار برد.

Keywords:

گریندر , قارچ های رشته ای , C-TAB , PCR , استخراج DNA , ITS