بررسی نقش خانواده ژنی دهیدرین در گیاه جو( (Hordeum vulgare

دهیدرین ها (DHNs) متعلق به گروه دوم پروتئین های LEA می باشند که اعضای آن در اواخر دوره جنین زایی در بذر و در پاسخ به تنش های غیرزیستی مانند شوری ، خشکی و سرما در بافت رویشی تجمع می یابند. در این مطالعه ، ۱۳ ژن کدکننده پروتئین دهیدرین (DHN)در ژنوم جو( (Hordeum vulgare شناسایی و خصوصیات فیزیکوشیمیایی ، جایگاه سلولی ، موتیف های حفاظت شده و ساختار ژنی آنها تعیین و روابط فیلوژنتیکی بین این پروتئین ها مد نظر قرار گرفت . نتایج نشان داد که طول ۱۳ توالی نوکلئوتیدی دهیدرین جو از ۲۱۱۷-۷۲۰ نوکلئوتید متغییر بود. اکثر این ژنها بر روی کروموزوم شماره ۶ قرار داشتند. با توجه به مقدار آمینواسیدها، بیشترین فروانی اسید آمینه در تمامی این توالی ها مربوط به گلیسین با میانگین مقدار ۴۴/۲۴ درصد بود. بیشترین محل حضور ژن دهیدرین درون هسته ، سیتوپلاسم و اندامکهایی مثل کلروپلاست و میتوکندری است . در تمامی این توالی ها سه موتیف اصلی K (لیزین )، S (سرین ) و Y (تیروزین ) شناسایی شد. همچنین بررسی درخت فیلوژنتیکی نشان داد توالی XP-۰۴۴۹۵۴۵۱۳.۱ با فاصله بیشتر نسبت به دیگران و بدون زیر شاخه و به تنهایی در یک گروه قرارگرفته است . در این مطالعه پروتئین دهیدرین با شماره های دستیابی XP-۰۴۴۹۸۰۲۵۰ با مقدار ۸۹/۶-پایدارترین و توالی پروتئین باشماره دستیابی XP-۰۴۴۹۵۲۵۴۷ و مقدار ۷/۵۵ ناپایدارترین پروتئین بودند. بالا بودن ضریب خاموشی در تمام توالی ها نشاندهنده طول عمر بالا پروتئین هاست .

Keywords:

تنش غیرزیستی , جو , دهیدرین , روابط فیلوژنتیکی