مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده miR-۲۰۰ و ژن های هدف آن در سرطان پروستات

مریم خراسانی; شیرین شهبازی; رضا مهدیان

مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده miR-۲۰۰ و ژن های هدف آن در سرطان پروستات

Publish place: Journal of Health & Biomedical Informatics، Vol: 5، Issue: 4

Publish Year: 1397

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/2036535

Document National Code:

JR_JHBMI-5-4_007

Index date: 29 July 2024

مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده miR-۲۰۰ و ژن های هدف آن در سرطان پروستات abstract

مقدمه: با توجه به محدودیت های تست تشخیصی رایج سرطان پروستات، معرفی بیومارکرهای با ویژگی بالاتر جهت تشخیص دقیق تر و به هنگام سرطان پروستات مورد توجه می باشد. هدف از انجام این مطالعه، بررسی بیوانفورماتیکی خانواده miR-۲۰۰ (miR-۲۰۰a, miR-۲۰۰b, miR-۲۰۰c, miR-۱۴۱, miR-۴۲۹) و پیش بینی هدف های ژنی این خانواده، جهت بررسی بیشتر تحت عنوان بیوماکر تشخیصی بود. روش: این تحقیق از نوع تئوری و بر پایه بررسی بیوانفورماتیکی میکرو RNA بود که به منظور جستجوی ژن های هدف خانواده miR-۲۰۰ در مسیرهای سیگنالینگ شناخته شده در پاتوژنز سرطان پروستات از پایگاه DIANA TOLLS-mirPath v.۳ استفاده شد. سپس به تایید ژن های معرفی شده توسط ابزارهای پیشگویی کننده آنلاین مانند MiRWalk, Targetscan, RNAhybrid, پرداخته شد. در انتها نقش عملکردی ژن های هدف معرفی شده توسط پایگاه بیوانفورماتیک DAIVID بررسی شد. نتایج: با توجه به نتایج حاصل از این بررسی ژن E۲F۳ هدف مشترک تمام اعضای خانواده miR-۲۰۰ است، BCL۲ به عنوان هدف مشترک miR-۲۰۰b/c/۴۲۹ و CCNE۲ به عنوان هدف مشترک miR-۲۰۰a/۱۴۱ بودند. همچنین miR-۲۰۰c با هدف قرار دادن CDKN۱B و miR-۴۲۹ با هدف قرار دادن KRAS می تواننند در ایجاد سرطان پروستات مداخله کنند. نتیجه گیری: نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که اعضای خانواده miR-۲۰۰ با هدف قرار دادن ژن های دخیل در پروسه های بیولوژیکی مهم و مسیرهای مولکولی دخیل در پاتوژنز سرطان پروستات احتمالا می توانند تحت عنوان بیومارکر تشخیصی در مطالعات آتی مورد بررسی بیشتر قرار بگیرند.

مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده miR-۲۰۰ و ژن های هدف آن در سرطان پروستات Keywords:

Prostate cancer , miR-۲۰۰ family , Bioinformatics , سرطان پروستات , خانواده miR-۲۰۰ , پیشبینی بیوانفورماتیک

مطالعه بیوانفورماتیک اعضای خانواده miR-۲۰۰ و ژن های هدف آن در سرطان پروستات authors

مریم خراسانی

Ph.D Student of Molecular Medicine, Molecular Medicine Department, Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran.

شیرین شهبازی

Associate Professor, Medical Genetics, Medical Genetics Department, Faculty of Medical Sciences, Tarbiat Modares‎ University, Tehran, Iran.

رضا مهدیان

Ph.D. in Medical Biotechnology, Associate Professor in Medical Biotechnology Dept., Pasteur Institute of Iran, Tehran, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Cancer statistics, ۲۰۱۸. CA ...

Esmaeimzadeh N, Salahi-Moghaddam A and Khoshdel A. Geographic distribution of ...

Frame FM, Noble AR, Klein S, Walker HF, Suman R, ...

Andreoiu M, Cheng L. Multifocal prostate cancer: biologic, prognostic, and ...

Velonas VM, Woo HH, dos Remedios CG, Assinder SJ. Current ...

Xi X, Li T, Huang Y, Sun J, Zhu Y, ...

Peng Y, Croce CM. The role of MicroRNAs in human ...

Melo SA, Esteller M. Dysregulation of microRNAs in cancer: playing ...

Kumarswamy R, Mudduluru G, Ceppi P, Muppala S, Kozlowski M, ...

Lu MH, Huang CC, Pan MR, Chen HH, Hung WC. ...

Cheng CW, Wang HW, Chang CW, Chu HW, Chen CY, ...

Guan H, Liu C, Fang F, Huang Y, Tao T, ...

Feng R, Chen X, Yu Y, Su L, Yu B, ...

Calin GA, Croce CM. MicroRNA signatures in human cancers. Nat ...

Liu B, Li J, Cairns MJ. Identifying miRNAs, targets and ...

Moradi N, Paryan M, Khansarinejad B, Rafiei M, Mondanizadeh M. ...

Min H, Yoon S. Got target? Computational methods for microRNA ...

Holland B, Wong J, Li M, Rasheed S. Identification of ...

Humphries B, Yang C. The microRNA-۲۰۰ family: small molecules with ...

Koutsaki M, Libra M, Spandidos DA, Zaravinos A. The miR-۲۰۰ ...

Wong NW, Chen Y, Chen S, Wang X. OncomiR: an ...

Vlachos IS, Zagganas K, Paraskevopoulou MD, Georgakilas G, Karagkouni D, ...

Huang da W, Sherman BT, Lempicki RA. Systematic and integrative ...

Huang da W, Sherman BT, Lempicki RA. Bioinformatics enrichment tools: ...

Saini S. PSA and beyond: alternative prostate cancer biomarkers. Cell ...

Fabris L, Ceder Y, Chinnaiyan AM, Jenster GW, Sorensen KD, ...

Khorasani M, Mahdian R, Peymani A. The role of microRNAs ...

Banwait JK, Bastola DR. Contribution of bioinformatics prediction in microRNA-based ...

Ambros V. The functions of animal microRNAs. Nature ۲۰۰۴;۴۳۱(۷۰۰۶):۳۵۰-۵ ...

Gao Y, Feng B, Lu L, Han S, Chu X, ...

Zeng X, Yin F, Liu X, Xu J, Xu Y, ...

Gudas JM, Payton M, Thukral S, Chen E, Bass M, ...

Payton M, Scully S, Chung G, Coats S. Deregulation of ...

Caldon CE, Sergio CM, Kang J, Muthukaruppan A, Boersma MN, ...

Sieuwerts AM, Look MP, Meijer-van Gelder ME, Timmermans M, Trapman ...

Zhang L, Zhang XW, Liu CH, Lu K, Huang YQ, ...

Krishnan K, Steptoe AL, Martin HC, Wani S, Nones K, ...

Hamilton MP, Rajapakshe KI, Bader DA, Cerne JZ, Smith EA, ...

Adams JM, Cory S. The BCL-۲ arbiters of apoptosis and ...

Adams JM, Cory S. The Bcl-۲ apoptotic switch in cancer ...

McDonnell TJ, Troncoso P, Brisbay SM, Logothetis C, Chung LW, ...

Jančík S, Drábek J, Radzioch D, Hajdúch M. Clinical Relevance ...

Cai H, Memarzadeh S, Stoyanova T, Beharry Z, Kraft AS, ...

نمایش کامل مراجع