الگوریتن شناسایی ژنهای متفاوت بیاى شذه در داده های حاصل از ریزآرایه مخمر ساکاروهیسس سرویسیه با استفاده از بسته های نرم افزاری R
Publish place: 3rd Iranian Agricultural Biotechnology Conference
Publish Year: 1391
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 603
متن کامل این Paper منتشر نشده است و فقط به صورت چکیده یا چکیده مبسوط در پایگاه موجود می باشد.
توضیح: معمولا کلیه مقالاتی که کمتر از ۵ صفحه باشند در پایگاه سیویلیکا اصل Paper (فول تکست) محسوب نمی شوند و فقط کاربران عضو بدون کسر اعتبار می توانند فایل آنها را دریافت نمایند.
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
AGRIBIOTECH03_074
تاریخ نمایه سازی: 27 تیر 1392
Abstract:
با استفاده از بسته های نرم افزاری R بویژه Limma و با استفاده از اطلاعاتروژه آنالیز چرخه سلولی مخمر ساکارومیسس سرویسیه در دانشگاه استانفورد زنهای متفاوت بیان شده برای پنج مرحله اصلی جرخه سلولی این مخمر شامل مراحل تقسیم میتوز و رشد شناسایی گردید. این داده ها از میزان بان ژنهای موجود بر روی ریزارایه های مربوطه در فواصل زمانی مختلف و در قالب 5 ازمایش بدست امد . تفاوت در بیان زنها بر ارزش یک مدل خطی بر روی دادههای بیان ژن و از روی برآردهای بیزی حاصل ار آن بدست امد. آنالیز واریانس مدل تابعیت خطی بر ارزش شده برای بیان ژنهای مخمر در زوا زمانهای مختلف و بازاء هر یک از مراحل اصلی چرخه سلولی و با مقایسه با بیان ژنهای شاهد تعبیه شده بدست آمد. در مجموع اطلاعات مربوط به 4000 قابل انالیز بود که از این میان 800 ژن بر تنظیم چرخه سلولی موثر تشخیص داده شده و بیان متقاوتی داشتند . در مجموع این تحقیق یکبار دیگر کارایی مدلهای خطی و برآوردهای بیزی اشنا برای اکثر متخصصین اصلاح نژاد دام به منظور آنالیز داده های بیان ژن نیز نشان داد. این داده ها می تواند اصلاحگران دام را در شناسایی زنهای موثر بر صفات مورد نظرشان یاری نماید . این مطالعه نمونه ای از کاربردهای بیوانفورماتیک و سامانه های زیستی محاسباتی را در مطالعات تنظیم بیان ژن نشان داد.
Keywords:
ریز ارایه های بیاان ژن , ژنهای متفاوت بیان شده , نرم افزار R , بسته Limma , مخمر ساکارومیسس سرویسیه , چرخه سلولی
Authors
محمد حسین بناءبازی
گروه علوم دامی - دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی - پردیس کشاورزی و منابع ط
معصومه ناصرخلیل
گروه علوم دامی - دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی - پردیس کشاورزی و منابع ط
رضا میرایی آشتیانی
گروه علوم دامی - دانشکده علوم و مهندسی کشاورزی - پردیس کشاورزی و منابع ط
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :