شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت کنترل کننده صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز
Publish place: Animal Production Research، Vol: 13، Issue: 2
Publish Year: 1403
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 66
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_ARGU-13-2_004
Index date: 7 September 2024
شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت کنترل کننده صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز abstract
هدف از این پژوهش، شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مرتبط با صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز بود. بدین منظور، از اطلاعات ژنوتیپی ۷۲۸ راس بزهای غیرخویشاوند متعلق به چهار نژاد مختلف تعیین ژنوتیپ شده با آرایههای۵۰K استفاده شد. جهت شناسایی نواحی ژنومی تحت انتخاب از دو آزمون آماری برآوردگر نااریب FST (تتا) و hapFLK استفاده شد. نتایج حاصل از آماره تتا منجر به شناسایی هشت ناحیه ژنومی روی کروموزومهای شماره ۳، ۴، ۷، ۱۳، ۱۵، ۱۸، ۲۰ و ۲۹ شد. ژنهای کاندیدای شناسایی شده مرتبط با صفات ساختاری شامل ژنهای TGFBR۳، CALCR، ACAD۸، BCAR۱ و ADAMTS۶ بودند و عملکردهای متفاوتی شامل رشد و توسعه عضلات اسکلتی، طول بدن، تنظیم کانال کلسیمی، هموستازی الیاف ماهیچهای، میزان خوراک مصرفی، ساخت پروتئین و اندازه سلول ماهیچهای داشتند. بهعلاوه، بررسی QTLهای گزارش شده در مناطق انتخابی و اورتولوگوس گاوی، قرار داشتن QTLهای مرتبط با افزایش وزن بدن، عرض کپل و وزن متابولیکی بدن را نشان داد. همچنین، نتایج حاصل از آماره hapFLK در این پژوهش، منجر به شناسایی پنج ناحیه ژنومی روی کروموزومهای شماره ۱، ۵، ۶، ۱۳ و ۳۰ شد. ژنهای کاندیدای شناسایی شده در این مناطق ژنومی شامل FNDC۳B، STAB۲ و CCNY بودند و عملکردهای متفاوتی در تکثیر فیبروبلاستها و تمایز سلولهای استخوانی داشتند. ژنهایی که در نواحی ژنومی شناسایی شدند، میتوانند بر اساس عملکرد بهعنوان کاندیداهای تحت انتخاب مثبت مطرح باشند. در هر حال، نیاز به بررسیهای پیوستگی و عملکردی بیشتری جهت شناسایی عملکرد ژنها وجود دارد. استفاده از یافتههای این تحقیق میتواند باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی برنامههای اصلاح نژادی بز شود.
شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت کنترل کننده صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز Keywords:
شناسایی مناطق ژنومی تحت انتخاب مثبت کنترل کننده صفات ساختاری بدن در نژادهای مختلف بز authors
حسین محمدی
استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
