سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

شناسایی چندین توالی کدکننده پروتئین فسفولیپاز A۲ در غده زهر عقرب همی اسکورپیوس لپتروس با استفاده از RNA-seq

Publish Year: 1402
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 82

This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_GEB-12-2_012

Index date: 14 September 2024

شناسایی چندین توالی کدکننده پروتئین فسفولیپاز A۲ در غده زهر عقرب همی اسکورپیوس لپتروس با استفاده از RNA-seq abstract

عقرب Hemiscorpius lepturus کشنده ترین عقرب ایران است و به همین جهت از نظر پزشکی اهمیت زیادی دارد. علائم بالینی ناشی از مسمومیت با زهر عقرب H. lepturus، مانند اثرات سمی نروتوکسیسیتی، سوزش های پوستی و همچنین برخی از واکنش های التهابی به فعالیت فسفولیپاز A۲ (PLA۲) آن نسبت داده شده است. هدف این مطالعه شناسایی و دسته بندی ژن های کدکننده فسفولیپاز A۲ در غده زهر عقرب H. lepturus است. به همین منظور در این مطالعه، یک کتابخانه cDNA از غدد زهر این عقرب با استفاده از تکنیک توالی یابی RNA ایلومینا تولید شد. توالی های کد کننده PLA۲ با استفاده از ابزار اصلی جستجوی تراز محلی (BLAST) و جستجوهای تشابه بین داده های خام غده زهر با توالی های ثبت شده از بندپایان دیگر به ویژه عقرب Centruroides sculpturatus شناسایی و استخراج شدند. این جستجوها منجر به یافتن چندین توالی همولوگ از PLA۲ در غدد زهر این عقرب با شباهت توالی به فاکتور فعال کننده پلاکت استیل هیدرولاز (PAFA)، PLA۲ های وابسته به کلسیم (cPLA۲)، PLA۲ های ترشح شونده (sPLA۲)، PLA۲ های مستقل از کلسیم (iPLA۲) و گروه III هترودیمریک فسفولیپاز A۲ (hgPLA۲) شد. اغلب توالی های یافت شده بیشترین شباهت را با توالی های PLA۲ از عقرب های C. sculpturatus و Androctonus crassicauda نشان دادند. این گزارش یکی از معدود تلاش های توالی یابی رونوشت برای شناسایی، دسته بندی و تعیین خصوصیات فیزیکوشیمیایی توالی های PLA۲ در غده زهر عقرب همی اسکورپیوس لپتروس است که در آن روابط فیلوژنتیکی بین بندپایان مختلف با استفاده از توالی های شناسایی شده از جنس Hemiscorpius  بررسی شده است.

شناسایی چندین توالی کدکننده پروتئین فسفولیپاز A۲ در غده زهر عقرب همی اسکورپیوس لپتروس با استفاده از RNA-seq Keywords:

شناسایی چندین توالی کدکننده پروتئین فسفولیپاز A۲ در غده زهر عقرب همی اسکورپیوس لپتروس با استفاده از RNA-seq authors

محمد تقی بیگی نصیری

Department of Animal Sciences, Khuzestan University of Agriculture and Natural Resources, Mulathani, Iran.

فاطمه ثعلبی

Department of Venomous Animals and antivenom production, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Ahvaz, Khuzestan, Iran.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Balsinde, J., Balboa, M. A., & Dennis, E. A. (۱۹۹۷). ...
Jalali, A., & Rahim, F. (۲۰۱۴). Epidemiological review of scorpion ...
Jalali, A., Pipelzadeh, M. H., Sayedian, R., & Rowan, E. ...
Kazemi, S. M., & Sabatier, J. M. (۲۰۱۹). Venoms of ...
Ozkan, O., & Kat, I. (۲۰۰۵). Mesobuthus eupeus scorpionism in ...
Torabi, E., Behdani, M., Hosseininejad Chafi, M., Moazzami, R., Sabatier, ...
نمایش کامل مراجع