سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

ردیابی و تحلیل تبارزائی ویروس کوتولگی گوجه (Prune dwarf virus) از درختان گیلاس استان خراسان رضوی

Publish Year: 1402
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 63

This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_GEB-12-2_015

Index date: 14 September 2024

ردیابی و تحلیل تبارزائی ویروس کوتولگی گوجه (Prune dwarf virus) از درختان گیلاس استان خراسان رضوی abstract

ویروس کوتولگی گوجه (Prune dwarf virus, PDV) به عنوان یک عامل بیماری زا مهم در درختان گیلاس (Prunus avium L.)، شناخته شده است و خسارت جدی به درختان هسته دار می رساند. در بهار سال ۱۴۰۱ نمونه برداری از مجموعه درختان باغ گیلاس ایستگاه تحقیقات گلمکان مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی خراسان رضوی، انجام شد. نمونه های جمع آوری شده دارای علائم کوتولگی، میوه های لکه دار، کاهش رشد جوانه ها بودند و فاصله ی میانگره های شاخه نسبت به گیاهان سالم کمتر بود. برای ردیابی ویروس از آزمون رونویسی معکوس با پرایمرهای اختصاصی مبتنی بر ژن پروتئین حرکتی ویروس استفاده شد. قطعات ۷۵۶ نوکلئوتیدی حاصل از الکتروفورز تکثیر شده پس از خالص سازی، ایزوله گلمکان توالی یابی شد. ترادف به دست آمده با استفاده از بلاست در پایگاه NCBI با ترادف های موجود در بانک ژن مقایسه شد و بیشترین شباهت با جدایه بلغارستان (%۷/۹۹MT۱۵۲۱۷۶, ) و کمترین شباهت با جدایه هلند (%۸/۸۸HM۰۲۱۲۳۱, ) مشاهده شد. درخت تبارزائی بر پایه پروتئین حرکتی ترسیم شد و جدایه های PDV در دو گروه مجزا قرار گرفتند و جدایه گلمکان در گروه I درخت فیلوژنتیک قرار گرفت. مقایسه توالی پروتئین حرکتی جدایه های ویروس نشان داد توالی های اسیدآمینه پروتئین حرکتی و دامنه اتصال به RNA پروتئین حرکتی در میان ویروس کوتولگی گوجه بسیار حفاظت شده است. در این پژوهش برای اولین بار توالی ویروس کوتولگی گوجه از ایران از باغ گیلاس در ژن بانک با رس شماره OR۵۴۱۱۰۶ ثبت شد و تحلیل تبارزائی ویروس کوتولگی گوجه با تمرکز بر ژن پروتئین حرکتی بررسی شد.

ردیابی و تحلیل تبارزائی ویروس کوتولگی گوجه (Prune dwarf virus) از درختان گیلاس استان خراسان رضوی Keywords:

ردیابی و تحلیل تبارزائی ویروس کوتولگی گوجه (Prune dwarf virus) از درختان گیلاس استان خراسان رضوی authors

سارا قارونی کاردانی

Plant Protection Research Department, Khorasan Razavi, Agricultural and natural resources research and education center AREEO, Mashhad, Iran.

ابراهیم گنجی مقدم

Department of crop and horticulture science Research, Khorasan Razavi, Agricultural and natural resources research and education center AREEO, Mashhad, Iran.

شادی عطار

Former PhD student, Horticultural science department, Agriculture faculty, Ferdowsi university of Mashhad, Iran

منصور صلاتی

Plant Protection Research Department, Khorasan Razavi, Agricultural and natural resources research and education center AREEO, Mashhad, Iran.

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Bachman, E. J., Scott, S. W., Xin, G. E., & ...
Fonseca, F., Neto, J. D., Martins, V., & Nolasco, G. ...
Gholampour, Z., & Zakiaghl, M. (۲۰۱۶). Comparison of RNA Extraction ...
Hasanpour, M. H., Ayazpour, K. (۲۰۱۸).Presence and Distribution of Prune ...
Kamenova, I. L., & Borisova, A. Z. (۲۰۲۲). Biological and ...
Kozieł, E., Bujarski, J. J., & Otulak, K. (۲۰۱۷). Molecular ...
Koziel, E., Otulak, K., & Garbaczewska, G. (۲۰۱۵). Phylogenetic analysis ...
Kumar, S., Stecher, G., & Tamura, K. (۲۰۱۶). MEGA۷: molecular ...
Massart, S., Brostaux, Y., Barbarossa, L., César, V., Cieslinska, M., ...
Mekuria, G., Ramesh, S. A., Alberts, E., Bertozzi, T., Wirthensohn, ...
Melcher, U. (۲۰۰۰). The ‘۳۰K’superfamily of viral movement proteins. Journal ...
Mink, G. I. (۱۹۹۳). Pollen and seed-transmitted viruses and viroids. ...
Muhire, B. M., Varsani, A., & Martin, D. P. (۲۰۱۴). ...
Nemeth, M. (۱۹۸۶). Virus, mycoplasma and rickettsia diseases of fruit ...
Németh, M., Nyerges, K., Hangyál, R., & Kósa, G. (۲۰۱۰). ...
Paduch-Cichał, E., Sala-Rejczak, K., Mroczkowska, K., Boscia, D., & Potere, ...
Predajňa, L., Sihelská, N., Benediková, D., Šoltys, K., Candresse, T., ...
Ravelonandro, M. (۲۰۲۱). Reliable Methodologies and Impactful Tools to Control ...
Soltani, N., Hayati, J., Babaei, G., & Qomi, M. E. ...
Ulubaş Serçe, Ç., Ertunç, F. İ. L. İ. Z., & ...
Vašková, D., Petrzik, K., & Špak, J. (۲۰۰۰). Molecular variability ...
Zhao, S. H., Wang, J. Z., Li, M. F., Li, ...
نمایش کامل مراجع