شناسایی نشانگرهای آگاهی بخش SSR و EST-SSR مرتبط با مقاومت به زنگ قهوه ای در ژنوتیپ های گیاه مرتعی Aegilops tauschii Coss در مرحله گیاهچه ای و گیاه کامل

Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 23

This Paper With 19 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJRFP-29-2_001

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1403

Abstract:

گونهAegilops tauschii ، گیاهی است یکساله و دیپلوئید (۲n = ۲x = ۱۴, DD) که به صورت خودرو در دامنه ارتفاعات و یا دشت های نزدیک به سواحل دریاهای غیرآزاد، از ترکیه تا چین رویش دارد. از آنجا که نواحی شمالی ایران به عنوان یکی از مهمترین مراکز پیدایش و تنوع این گونه مطرح است، شناسایی منابع مقاومت به زنگ قهوه ای (برگ) گندم در این مناطق بسیار اهمیت دارد. در این پژوهش، مقاومت گونه مرتعی آژیلوپس تائوشی (Aegilops tauschii Coss.) نسبت به شش جدایه مختلف عامل بیماری­ زنگ قهوه ­ای در مرحله گیاهچه­ ای و گیاه کامل ارزیابی شد. برای شناسایی نشانگرهای مرتبط با مقاومت گیاهچه به جدایه­ های مختلف و مقاومت گیاه کامل در مزرعه، از نشانگرهای SSR و EST-SSR که پوشش مناسبی روی ژنوم D گندم داشتند، استفاده شد. تجزیه ساختار ژنتیکی جمعیت، نشان داد که یکصد ژنوتیپ مورد ارزیابی در دو زیرجمعیت متمایز قرار گرفتند. پس از محاسبه ماتریس ضرایب ساختار ژنتیکی و همچنین خویشاوندی در جمعیت (Kinship)، تحلیل ارتباط نشانگر- صفت با استفاده از مدل های خطی عمومی­ و مختلط انجام شد. قطعات تکثیری آغازگرهای ریزماهواره Xgwm۲، Xgwm۴۴ و  Xgwm۳۰ که به ترتیب بر روی کروموزوم­های ۳D، ۷D و ۲D و همچنین آغازگرهای SWES۱۸۶ و SWEW۹۲  از  نشانگرهای EST-SSR که به ترتیب بر روی کروموزوم های ۲D و ۷D قرار داشت دارای ارتباط معنی­دار با سطح مقاومت به بیماری زنگ  (با ضریب تبیین بالا) بود. با توجه به ارتباط این نشانگرها با مقاومت اغلب جدایه­ های مطالعه شده، می­توان نتیجه گرفت که به عنوان نشانگرهای آگاهی ­بخش، ظرفیت بالایی در گزینش ژنومی و غربالگری سریع ژنوتیپ­ ها به کمک نشانگر دارند.

Authors

حسین محمدی دهبالایی

PhD student in Molecular Genetics and Plant Breeding, Gorgan University of Agricultural Sciences and Natural Resources, Director of Ilam University Educational and Research Farm

علی اصغر نصراله نژاد قمی

Assist. Prof. Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Plant Production, Gorgan University of Agriculture and Natural Resources Sciences

علی اشرف مهرابی

Assoc. Prof. Department of Biotechnology, Research Institute of Forest and rangelans, Agricultural Research, Education and Extention Organization (AREEO), Tehran, Iran

خلیل زینلی نژاد

Assist. Prof. Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Plant Production, Gorgan University of Agriculture and Natural Resources Sciences

حسن سلطانلو

Assoc. Prof. Department of Plant Breeding and Biotechnology, Faculty of Plant Production, Gorgan University of Agriculture and Natural Resources Sciences

سید طه دادرضائی

Assist. Prof. of Cereals Research Department Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Abdurakhmonov, I.Y., Abdukarimov, A., ۲۰۰۸. Application of association mapping to ...
  • Ataiee, R., Mohammadi, W., Talei, A., and M. R., Naghavi. ...
  • Anwar, M.J., Javad, M. and Jamil, M.W., Habib, I., Nazir, ...
  • Autrique, E., Singh, RP., Tanksley, S.D., Sorrells, M.E. ۱۹۹۵. Molecular ...
  • Bamdadian, A. ۱۹۹۳. Evaluation of physiological race of rusts of ...
  • Bradbury, P. ۲۰۰۷. TASSEL: software for association mapping of complex ...
  • Braulio, J.S., Cloutier, S. ۲۰۱۲. Association mapping in plant genomes: ...
  • Brbaklic, L., Trkulja, D., Kondic-spika, A., Treskic, S., Kobiljski, B. ...
  • Breseghello, F., M.E., Sorrells., ۲۰۰۷. QTL analysis of kernel size ...
  • Buckler, E.S., Thornsberry, J.M. ۲۰۰۲. Plant molecular diversity and applications ...
  • Cloutier, S., McCallum, B.D., Loutre, C., Banks, T.W., Wicker, T., ...
  • Dadrezaei, S., Afshari, F., Patpour, M., ۲۰۱۵. Evaluation of phenotypic ...
  • Dyck, P.L. ۱۹۸۷. The association of a gene for leaf ...
  • El-Orabey, W.M., Hamwieh, A., Ahmed, S.M. ۲۰۱۹. Molecular markers and ...
  • El-Orbey, W.M., Hamwieh, A., Ahmed, S.M. ۲۰۱۹. Molecular markers and ...
  • Esfandiari, E. ۱۹۴۸. Troisième liste des fungi ramassés en Iran: ...
  • Evanno G. ۲۰۰۵. Detecting the number of clusters of individuals ...
  • Feuillet, C., Messmer, M., Schachermayr, G., Keller, B. ۱۹۹۵. Genetic ...
  • Flint-Garcia, S.A., Thornsberry, J.M., Ivon, B. ۲۰۰۳. Structure of linkage ...
  • Gao L, Kathryn T, Shiaoman C, Kolmer J, Anderson J. ...
  • Huang, L., Gill, B.S. ۲۰۰۱. An RGA-like marker detects all ...
  • Huerta-Espino, J., Singh, R., Crespo-Herrera, L.A.,Villaseñor-Mir, H.E., Rodriguez-Garcia, M.F., Dreisigacker, ...
  • Huerta-Espino, J., Singh, R.P., Germanm, S., McCallumm, B.D., Park, R.F., ...
  • Krattinger, S.G., Lagudah, E.S., Spielmeyer, W., Singh, R.P., Huerta-Espino, J., ...
  • Lagudah, E.S., McFadden, H., Singh, R.P., Huerta-Espino, J., Bariana, H.S., ...
  • Lagudah, E.S., Krattinger, S.G., Herrera-Foessel, S. ۲۰۰۹. Gene-specific markers for ...
  • Lee, A., Trinh, A.c., Lee, W.J., Kim. m., Lee. H., ...
  • McIntosh, R.A., Welling, C.R., Park, R.F. ۱۹۹۵. Wheat Rusts: An ...
  • Khorami-fard, T; Mehrabi, A. A., Arminian, A., Fazeli, A. ۲۰۱۷. ...
  • Neelam, K., Brown-Guedira, G., Huang, L., ۲۰۱۳. Development and validation ...
  • Noori, A., Mehrabi, A., Safari, H. ۲۰۱۵. Morphological evaluation and ...
  • Peterson, G., Seberg, O., Yde, M., Berthelsen, K. ۲۰۰۶. Phylogenetic ...
  • Peterson, R.F., Campbell, A.B., Hannah, A.E. ۱۹۴۸. A diagrammatic scale ...
  • Pour-Aboughadareh, A. R., Moghaddam, M., Alavikia, S., Mehrabi, A. A. ...
  • Prins, R., Groenewald, J.Z., Marais, G.F., Snape, J.W., Koebner, R.M.D. ۲۰۰۱. ...
  • Roelfs, A.P. ۱۹۷۸. Estimated losses caused by rust in small ...
  • Saghai-Maroof, M.A., Soliman, K.M., Jorgensen, R.A., Allard, R.W., ۱۹۸۴. PNAS ۸۱ (۲۴) : ۸۰۱۴-۸۰۱۸ ...
  • Singh N., Wu S., Tiwari V., Sehgal S., Raupp J., ...
  • Singh, A., Pallavi, J.K., Gupta, P., Prabhu, K.V., ۲۰۱۱. Identification ...
  • Singh, N., Wu, S., Tiwari, V., Sehgal, S., Raupp, J., ...
  • Spataro, G., Tiranti, B., Arcaleni, P. ۲۰۱۱. Genetic diversity and ...
  • Stich, B., Melchinger, A. E. ۲۰۱۰. An introduction to association ...
  • Talbert, L.E., Blake, N.K., Chee, P.W., Blake, T.K., Magyar, G.M. ...
  • Thabet, M., Najeeb, M.A. ۲۰۱۷. Impact of Wheat Leaf Rust ...
  • Torabi, M., Nazari, K., Afshari, F. ۲۰۰۱. Genetic of pathogenicicty ...
  • Ulaszewski, W., Tomasz, M. ۲۰۲۰. Aegilops Species for the Improvement ...
  • Vanderplank, J.E., (۱۹۶۳) Plant Disease. Epidemics and Control: Accademic Press ...
  • William, M., Singh, R.P., Huerta-Espino, J., Ortiz Islas, S., Hoisington, ...
  • Witcombe, J. R. ۱۹۸۳. A Guide to the Species of Aegilops ...
  • Yu, J., Buckler, E.S. ۲۰۰۶. Genetic association mapping and genome ...
  • Zhang, P., Li, X., Gebrewahid, T.W., Liu, H., Xia, X., ...
  • Zhang, W., Dubcovsky, J. ۲۰۰۸. Association between allelic variation at the Phytoene ...
  • نمایش کامل مراجع