کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تمایز دو گونه Lolium perenne و Lolium multiflorum

Publish Year: 1397
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 28

This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJRFP-26-2_005

تاریخ نمایه سازی: 29 شهریور 1403

Abstract:

DOR: ۹۸.۱۰۰۰/۱۷۳۵-۰۸۹۱.۱۳۹۷.۲.۲۰۷.۵۲.۲۶.۱۶۰۳.۱۰۹ چچم یکی از گیاهان مهم علوفه­ای در مناطق سردسیری جهان می­باشد و در شرایط مختلف آب و هوایی رشد می­کند. تنوع ژنتیکی دو گونه  بین نه ژنوتیپ از Lolium perenne و نه ژنوتیپ از Lolium multiflorum با استفاده از ۱۵ نشانگر مولکولی SCoT بررسی شد. آغازگر­های ScoT در مجموع ۸۶ باند تولید کردند که از این تعداد ۱۲ باند یک‎شکل مشاهده شد و سایر باندها چند‎شکل بودند. آغازگرهای SC۳۵، SC۳۶ و SC۲۶ به‎ترتیب با ۹ و ۸ باند بیشترین تعداد باند و آغازگرهای SC۱۰ و SC۴۴ با ۲ و ۳ باند کمترین تعداد باند را نشان دادند. بیشترین میزان محتوای اطلاعات چند‎شکلی (PIC) مربوط به آغازگرهای SC۵، SC۴۰، SC۳۵، SC۶۳، SC۱۳، SC۴۴، SC۲۶، SC۲۱ و SC۱۰ بود. به طوری که بیشترین میزان شاخص قدرت تفکیک (RP)، شاخص نشانگری (MI) و نسبت چندگانه موثر (EMR) را آغازگرهای SC۳۵ و SC۲۶ داشتند. تشابه ژنتیکی ژنوتیپهای مورد بررسی با استفاده از ضریب تشابه جاکارد از ۳۵/۰ تا ۹۱/۰ متغیر بود و میانگین تشابه بین ژنوتیپها برابر ۶۴/۰ بود. بر اساس تجزیه خوشه‎ای ژنوتیپ­ها در ۲ گروه قرار گرفتند، به‎طوری که گونه­ها به‎صورت صد در صد از یکدیگر تفکیک شدند. این نتایج با نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) تایید شد. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) بر اساس گونه­های یکساله و چند ساله نشان داد که تنوع در درون گونه­ها برابر ۵۱% و در بین گونه­ها برابر ۴۹% بود. بر اساس شاخص­های هتروژنتیکی مورد انتظار (He) و شاخص شانون (I) بیشترین تنوع درون گونه­ای و تنوع ژنی مربوط به گونه L. Multiflorum بود.

Authors

M. Farshadfar

مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، پست الکترونیکی: farshadfarmohsen@yahoo.com

H. Shirvani

مدرس گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور

M. Amjadian

مربی، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور

A. Yaghotipoor

دکترای اصلاح نباتات، گروه زراعت و اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاه

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Abbaszade, S., Jafari, AA. and Safari, H., ۲۰۱۳a. Evaluation of ...
  • Abbaszade, S., Jafari, A.A. and Safari, H., ۲۰۱۳b. Evaluation of ...
  • Altıntas, S., Toklu, F., Kafkas, S., Kilian, B., Brandolini, A. ...
  • Bolaric, S., Barth, S., Melchinger, A.E. and Posselt, U.K., ۲۰۰۵. ...
  • Buckler, E.S., and Thornsherry, J.M., ۲۰۰۲. Plant molecular diversity and ...
  • Collard, B.C.Y. and Mackill, D.J., ۲۰۰۹. Start Codon Targeted (SCoT) ...
  • Davis, T.M., Haigis, Y.U.H. and McGowan, P.J., ۱۹۹۵. Template mixing: ...
  • Doyle, J.J. and Doyle J.L., ۱۹۸۷. A rapid DNA isolation ...
  • Elazreg, H., Chtourou-Ghorbel, N., Ghariani, S., Chakroun, M. and Trifi-Farah, ...
  • Farshadfar, M., Moradzade, N., Farshadfar, E. and Shirvani, H., ۲۰۱۷. ...
  • Ghariani, S., Trifi-Farah, N., Chakroun, M., Marghali, S. and Marrakchi, ...
  • Heydari Sharif Abad, H. and Dari, M.A., ۲۰۰۳. Fodder plants ...
  • Hou, Y., Yan, Z. and Wei, Y., ۲۰۰۵. Genetic diversity ...
  • Humphreys, M.O., ۱۹۹۱. A genetic approach to the multivariate differentiation ...
  • Kalendar, R., ۲۰۰۷. FastPCR: a PCR primer design and repeat ...
  • Kumar, M., Mishra, G.P., Singh, R., Kumar, J., Naik, P.K. ...
  • Majidi, M.M. and Mirlohi, A., ۲۰۱۰. Genetic similarities among Iranian ...
  • Moradi, P. and Jafari, A.A., ۲۰۰۶. Comparative study of forage ...
  • Peakall, R. and Smouse, P.E., ۲۰۰۶. GENALEX ۶: Genetic Analysis ...
  • Perrier, X. and Jacquemoud-Collet, J.P., (۲۰۰۶). DARwin soft ware, http://darwin.cirad.fr/darwi.. ...
  • Peters, J.P. and Martinelli, J.A., ۱۹۸۹. Hierarchical cluster analysis as ...
  • Pivoriene, O. and Pasakinskiene, I., ۲۰۰۷. Genetic differences between annual ...
  • Pivoriene, O., Pašakinskiene, I., Brazauskas, G., Lideikyte. L., Jensen, L.B., ...
  • Polok, K., Ciaglo, S. and Carbrita, L., ۲۰۰۶. AFLP analysis ...
  • Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., ...
  • Rohlf, F. and Taxonomy, N.P.N., ۱۹۹۸. Multivariate Analysis System, Version ...
  • Sicard, D., Nanni, L., Porfiri, O., Bulfon, D. and Papa, ...
  • Singh, S.K., ۲۰۰۳. Cluster analysis for heterosis in wheat (Triticum ...
  • Tsvelev, N.N., ۱۹۸۹. The system of grasses and their evolution. ...
  • Vieira, E.A., Castro, C.M., Oliveira, A.Cd., Irajá, F., Carvalho, Fd., ...
  • Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalskiand, J.A. and Tingey, ...
  • Wright, S., ۱۹۴۹. The genetical structure of populations. Annals of ...
  • نمایش کامل مراجع