سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تمایز دو گونه Lolium perenne و Lolium multiflorum

Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 74

This Paper With 14 Page And PDF Format Ready To Download

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

JR_IJRFP-26-2_005

Index date: 19 September 2024

کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تمایز دو گونه Lolium perenne و Lolium multiflorum abstract

DOR: ۹۸.۱۰۰۰/۱۷۳۵-۰۸۹۱.۱۳۹۷.۲.۲۰۷.۵۲.۲۶.۱۶۰۳.۱۰۹ چچم یکی از گیاهان مهم علوفه­ای در مناطق سردسیری جهان می­باشد و در شرایط مختلف آب و هوایی رشد می­کند. تنوع ژنتیکی دو گونه  بین نه ژنوتیپ از Lolium perenne و نه ژنوتیپ از Lolium multiflorum با استفاده از ۱۵ نشانگر مولکولی SCoT بررسی شد. آغازگر­های ScoT در مجموع ۸۶ باند تولید کردند که از این تعداد ۱۲ باند یک‎شکل مشاهده شد و سایر باندها چند‎شکل بودند. آغازگرهای SC۳۵، SC۳۶ و SC۲۶ به‎ترتیب با ۹ و ۸ باند بیشترین تعداد باند و آغازگرهای SC۱۰ و SC۴۴ با ۲ و ۳ باند کمترین تعداد باند را نشان دادند. بیشترین میزان محتوای اطلاعات چند‎شکلی (PIC) مربوط به آغازگرهای SC۵، SC۴۰، SC۳۵، SC۶۳، SC۱۳، SC۴۴، SC۲۶، SC۲۱ و SC۱۰ بود. به طوری که بیشترین میزان شاخص قدرت تفکیک (RP)، شاخص نشانگری (MI) و نسبت چندگانه موثر (EMR) را آغازگرهای SC۳۵ و SC۲۶ داشتند. تشابه ژنتیکی ژنوتیپهای مورد بررسی با استفاده از ضریب تشابه جاکارد از ۳۵/۰ تا ۹۱/۰ متغیر بود و میانگین تشابه بین ژنوتیپها برابر ۶۴/۰ بود. بر اساس تجزیه خوشه‎ای ژنوتیپ­ها در ۲ گروه قرار گرفتند، به‎طوری که گونه­ها به‎صورت صد در صد از یکدیگر تفکیک شدند. این نتایج با نتایج حاصل از تجزیه به مختصات اصلی (PCoA) تایید شد. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) بر اساس گونه­های یکساله و چند ساله نشان داد که تنوع در درون گونه­ها برابر ۵۱% و در بین گونه­ها برابر ۴۹% بود. بر اساس شاخص­های هتروژنتیکی مورد انتظار (He) و شاخص شانون (I) بیشترین تنوع درون گونه­ای و تنوع ژنی مربوط به گونه L. Multiflorum بود.

کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تمایز دو گونه Lolium perenne و Lolium multiflorum Keywords:

کارایی نشانگر مولکولی SCoT در بررسی تمایز دو گونه Lolium perenne و Lolium multiflorum authors

M. Farshadfar

مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور، پست الکترونیکی: farshadfarmohsen@yahoo.com

H. Shirvani

مدرس گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور

M. Amjadian

مربی، گروه کشاورزی، دانشگاه پیام نور

A. Yaghotipoor

دکترای اصلاح نباتات، گروه زراعت و اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاه

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Abbaszade, S., Jafari, AA. and Safari, H., ۲۰۱۳a. Evaluation of ...
Abbaszade, S., Jafari, A.A. and Safari, H., ۲۰۱۳b. Evaluation of ...
Altıntas, S., Toklu, F., Kafkas, S., Kilian, B., Brandolini, A. ...
Bolaric, S., Barth, S., Melchinger, A.E. and Posselt, U.K., ۲۰۰۵. ...
Buckler, E.S., and Thornsherry, J.M., ۲۰۰۲. Plant molecular diversity and ...
Collard, B.C.Y. and Mackill, D.J., ۲۰۰۹. Start Codon Targeted (SCoT) ...
Davis, T.M., Haigis, Y.U.H. and McGowan, P.J., ۱۹۹۵. Template mixing: ...
Doyle, J.J. and Doyle J.L., ۱۹۸۷. A rapid DNA isolation ...
Elazreg, H., Chtourou-Ghorbel, N., Ghariani, S., Chakroun, M. and Trifi-Farah, ...
Farshadfar, M., Moradzade, N., Farshadfar, E. and Shirvani, H., ۲۰۱۷. ...
Ghariani, S., Trifi-Farah, N., Chakroun, M., Marghali, S. and Marrakchi, ...
Heydari Sharif Abad, H. and Dari, M.A., ۲۰۰۳. Fodder plants ...
Hou, Y., Yan, Z. and Wei, Y., ۲۰۰۵. Genetic diversity ...
Humphreys, M.O., ۱۹۹۱. A genetic approach to the multivariate differentiation ...
Kalendar, R., ۲۰۰۷. FastPCR: a PCR primer design and repeat ...
Kumar, M., Mishra, G.P., Singh, R., Kumar, J., Naik, P.K. ...
Majidi, M.M. and Mirlohi, A., ۲۰۱۰. Genetic similarities among Iranian ...
Moradi, P. and Jafari, A.A., ۲۰۰۶. Comparative study of forage ...
Peakall, R. and Smouse, P.E., ۲۰۰۶. GENALEX ۶: Genetic Analysis ...
Perrier, X. and Jacquemoud-Collet, J.P., (۲۰۰۶). DARwin soft ware, http://darwin.cirad.fr/darwi.. ...
Peters, J.P. and Martinelli, J.A., ۱۹۸۹. Hierarchical cluster analysis as ...
Pivoriene, O. and Pasakinskiene, I., ۲۰۰۷. Genetic differences between annual ...
Pivoriene, O., Pašakinskiene, I., Brazauskas, G., Lideikyte. L., Jensen, L.B., ...
Polok, K., Ciaglo, S. and Carbrita, L., ۲۰۰۶. AFLP analysis ...
Powell, W., Morgante, M., Andre, C., Hanafey, M., Vogel, J., ...
Rohlf, F. and Taxonomy, N.P.N., ۱۹۹۸. Multivariate Analysis System, Version ...
Sicard, D., Nanni, L., Porfiri, O., Bulfon, D. and Papa, ...
Singh, S.K., ۲۰۰۳. Cluster analysis for heterosis in wheat (Triticum ...
Tsvelev, N.N., ۱۹۸۹. The system of grasses and their evolution. ...
Vieira, E.A., Castro, C.M., Oliveira, A.Cd., Irajá, F., Carvalho, Fd., ...
Williams, J.G.K., Kubelik, A.R., Livak, K.J., Rafalskiand, J.A. and Tingey, ...
Wright, S., ۱۹۴۹. The genetical structure of populations. Annals of ...
نمایش کامل مراجع