هدف گذاری مجدد داروها برای درمان سرطان پستان با استفاده از رویکرد بیوانفورماتیکی

مقدمه: سرطان پستان که یکی از شایع ترین سرطان ها با مرگ ومیر بالا در زنان است، همواره مورد توجه پژوهشگران بوده است و همه روزه دانشمندان در تلاش هستند تا سازوکار ها، ژن ها و داروهای مرتبط با این بیماری را شناسایی کنند. امروزه از روش های بیوانفورماتیکی برای شناسایی و هدف گذاری مجدد داروها به منظور درمان بیماری ها به ویژه بیماری سرطان استفاده می شود. مواد و روش­ها: در این مطالعه از روش بیوانفورماتیکی و تحلیل شبکه های زیستی برای شناسایی داروهای کاندید برای درمان سرطان پستان استفاده شده است. بدین منظور، از شبکه برهم کنش پروتئینی و شبکه دارو-ژن استفاده گردیده است. داده های این مطالعه از پایگاه داده GEO با کد دسترسی GSE۵۴۰۰۲ گردآوری شده است. برای مجموعه داده انتخاب شده، در ابتدا ژن های با تغییرات بیان معنادار میان دو گروه افراد سالم و افراد با سرطان پستان انتخاب گردیدند و به عنوان ژن های اولیه در نظر گرفته شدند؛ سپس شبکه برهم کنش پروتئین-پروتئین با استفاده از پایگاه داده STRING بازسازی گردید و یک ماژول ژنی معنادار از شبکه به دست آمد. پس از آن، مطالعات هستی شناسی ژن ها به همراه مسیرهای زیستی مرتبط مطالعه شدند. در ادامه، شبکه دارو-ژن برای شناسایی داروهایی که ژن های ماژول را هدف قرار می دهند، بازسازی گردید و به عنوان داروهای مهم برای درمان سرطان پستان معرفی شد. برای بازسازی و تحلیل شبکه ها از نرم افزار Cytoscape و پایگاه داده های STRING و OncoDB استفاده گردید. یافته­ های پژوهش: پس از تحلیل شبکه برهم کنش پروتئین-پروتئین و شبکه دارو-ژن، سه داروی مهم که ژن های ماژول ها را هدف قرار می دهند، شناسایی شد و به عنوان داروهای کاندید برای درمان سرطان پستان معرفی گردید؛ این داروها عبارت اند از: RG-۱۵۳۰، R-۴۰۶ و GW۴۴۱۷۵۶x. بحث و نتیجه گیری: نتایج نشان می دهد که داروهای معرفی شده (RG-۱۵۳۰، R-۴۰۶ و GW۴۴۱۷۵۶x) می توانند در درمان سرطان پستان موثر باشند.

Keywords:

Bioinformatics , Breast cancer , Drug-gene network , Protein-protein interaction network , سرطان پستان , بیوانفورماتیک , شبکه دارو-ژن , شبکه برهم کنش پروتئینی